195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1647 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1647  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  833    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411737  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0859  major facilitator superfamily MFS_1  35.76 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.221691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1867  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 436 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1481  transporter, putative  33.94 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1578  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 438 aa  230  4e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0877587 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1686  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 		 454 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000674894  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1094  major facilitator superfamily MFS_1  36.25 
 
 		 437 aa  218  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.929439  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0889  transporter, putative  34.19 
 
 		 437 aa  218  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2269  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 427 aa  143  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000581212  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01489  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04850)  26.58 
 
 		 533 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0186505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57608  predicted protein  24.32 
 
 		 474 aa  110  6e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.371537 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2239  ferric reductase domain-containing protein  21.25 
 
 		 642 aa  73.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0544393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1594  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000379312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 409 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.36 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0797975  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  24.76 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  24.76 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  24.76 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  24.76 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  27.05 
 
 		 400 aa  53.5  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3308  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 401 aa  53.5  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0575835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  24.76 
 
 		 404 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 433 aa  53.1  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  24.51 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  24.76 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1753  inner membrane transport protein YdhC  37.04 
 
 		 400 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000133845  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1859  inner membrane transport protein YdhC  37.04 
 
 		 400 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.422452  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3094  major facilitator family transporter  33.06 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948927  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0780  major facilitator family transporter  33.06 
 
 		 490 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114821  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0499  major facilitator family transporter  32.21 
 
 		 478 aa  52.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.788244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2574  inner membrane transport protein YdhC  37.04 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.723156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0062  major facilitator family transporter  33.06 
 
 		 395 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906812  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1528  major facilitator family transporter  33.06 
 
 		 395 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0595  major facilitator family transporter  33.06 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0610  major facilitator family transporter  33.06 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2956  major facilitator family transporter  33.06 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  23.79 
 
 		 404 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  23.73 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  38.82 
 
 		 481 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 457 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 395 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 395 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2027  major facilitator superfamily MFS_1  44 
 
 		 506 aa  51.6  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.828592  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0537  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 395 aa  51.6  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2789  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 385 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2513  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 393 aa  51.2  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2838  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 395 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298937  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2696  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 385 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2193  inner membrane transport protein YdhC  29.63 
 
 		 402 aa  50.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.230534  hitchhiker  0.00000667038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 439 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 		 439 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 462 aa  49.3  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 		 438 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0826  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.79 
 
 		 421 aa  49.7  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  37.93 
 
 		 433 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0158  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01631  predicted transporter  33.33 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1980  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.33 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00451664  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1858  inner membrane transport protein YdhC  33.33 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000141458  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.78 
 
 		 421 aa  48.5  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2373  inner membrane transport protein YdhC  33.33 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00231291  normal  0.112493 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  24.03 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0276  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 387 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2250  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 539 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1969  inner membrane transport protein YdhC  33.33 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225757 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0303  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01620  hypothetical protein  33.33 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 389 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1740  inner membrane transport protein YdhC  33.33 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.41176e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1874  inner membrane transport protein YdhC  33.33 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136238  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1929  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.28 
 
 		 422 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00455399  hitchhiker  0.000000256479 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0421  putative multidrug-efflux transporter transmembrane protein  32.23 
 
 		 387 aa  48.5  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107977  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2181  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 470 aa  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000990983  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1537  inner membrane transport protein YdhC  33.33 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0900835  normal  0.0201427 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  26.56 
 
 		 396 aa  47.8  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 460 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  35.23 
 
 		 487 aa  47.8  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 497 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0323  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.59 
 
 		 525 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.853677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 434 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0340  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 385 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 381 aa  47.4  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.75 
 
 		 501 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.88 
 
 		 517 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  26.43 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 424 aa  47  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 402 aa  46.6  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.47 
 
 		 621 aa  46.6  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1561  inner membrane transport protein YdhC  30.85 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00165154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6108  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1746  inner membrane transport protein YdhC  30.85 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000953992  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04730  arabinose efflux permease family protein  31.72 
 
 		 529 aa  45.8  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4881  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  24.13 
 
 		 421 aa  46.6  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>