112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0740 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0740  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 400 aa  827    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3365  radical SAM domain-containing protein  41.56 
 
 		 393 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.803151  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2893  radical SAM domain-containing protein  37.13 
 
 		 370 aa  219  8.999999999999998e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00746158  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2250  radical SAM domain-containing protein  36.11 
 
 		 367 aa  219  8.999999999999998e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.621052 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1715  Radical SAM domain protein  35.29 
 
 		 370 aa  215  9e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707887  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1616  Radical SAM domain protein  35.29 
 
 		 370 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.230625  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2723  Radical SAM domain protein  34.55 
 
 		 384 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  29.03 
 
 		 378 aa  69.3  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  30.73 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  27.89 
 
 		 501 aa  65.1  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  28.18 
 
 		 496 aa  62.8  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1734  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.98 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1669  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.45 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.195157 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  27.11 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  26.77 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  25.49 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  27.61 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2372  radical SAM domain-containing protein  29.67 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 		 389 aa  55.5  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  26.9 
 
 		 380 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  28.14 
 
 		 422 aa  55.1  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  27.49 
 
 		 317 aa  54.3  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0882  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.02 
 
 		 323 aa  54.3  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  27.54 
 
 		 346 aa  54.3  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  31.51 
 
 		 342 aa  53.9  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  27.88 
 
 		 390 aa  53.1  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  27.91 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  25 
 
 		 479 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  29.51 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  27.38 
 
 		 355 aa  50.4  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  23.38 
 
 		 380 aa  50.4  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  25 
 
 		 399 aa  49.7  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25 
 
 		 323 aa  49.7  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2294  molybdenum cofactor synthesis-like protein  26.34 
 
 		 343 aa  49.3  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.819438  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  24.07 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 		 404 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.87 
 
 		 341 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 		 364 aa  49.7  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2406  radical SAM domain-containing protein  31.11 
 
 		 310 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  23.35 
 
 		 375 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  23.36 
 
 		 353 aa  48.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  28.83 
 
 		 382 aa  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  28.14 
 
 		 480 aa  47.4  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  30.15 
 
 		 359 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1970  Radical SAM domain protein  25.44 
 
 		 346 aa  47.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  22.33 
 
 		 326 aa  47  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  26.8 
 
 		 428 aa  47  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  28.16 
 
 		 376 aa  46.6  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  25.23 
 
 		 401 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.35 
 
 		 298 aa  47  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 		 401 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 		 401 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 		 399 aa  47  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3677  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.58 
 
 		 338 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  24.1 
 
 		 394 aa  46.6  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  26.62 
 
 		 394 aa  46.6  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3363  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.28 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  26.52 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3627  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.28 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  28.86 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.17 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 		 349 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0058  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.5 
 
 		 310 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1972  radical SAM domain-containing protein  31.4 
 
 		 275 aa  46.2  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.396519  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  26.83 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1640  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.58 
 
 		 338 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3584  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.04 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.28 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00708242  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3277  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.28 
 
 		 338 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.589823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  24.88 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  24.07 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0858  Radical SAM domain protein  31.82 
 
 		 349 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  22.59 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.1 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1101  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.4 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0444  Radical SAM domain protein  27.06 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2650  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.26 
 
 		 344 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  28.92 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  24.24 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  24.88 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2877  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.26 
 
 		 344 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.593908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3577  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.28 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  26.99 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0518  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  22.76 
 
 		 365 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  27.44 
 
 		 411 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  26.14 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  25.27 
 
 		 358 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3594  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.28 
 
 		 338 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  24.67 
 
 		 393 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  25.67 
 
 		 349 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.31 
 
 		 359 aa  44.3  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  26.17 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  25.27 
 
 		 358 aa  44.3  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>