47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1533 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2498  Ig domain-containing protein  51.61 
 
 		 835 aa  705    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284109  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1853  Ig domain protein group 1 domain protein  62.82 
 
 		 817 aa  960    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.498276  hitchhiker  0.000000271075 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1801  Ig domain-containing protein  53.29 
 
 		 837 aa  734    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716764  hitchhiker  0.0000241302 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  53.77 
 
 		 821 aa  784    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2330  Ig-like, group 1  49.64 
 
 		 818 aa  706    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  100 
 
 		 807 aa  1592    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2843  Ig domain-containing protein  53.11 
 
 		 838 aa  755    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000356214  decreased coverage  0.00000000529133 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  61.33 
 
 		 819 aa  932    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2480  Ig domain-containing protein  53.73 
 
 		 820 aa  749    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311981  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  48.69 
 
 		 851 aa  663    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  50.53 
 
 		 676 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1195  intimin/invasin family protein  40.14 
 
 		 878 aa  496  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  32.82 
 
 		 811 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  33.06 
 
 		 1237 aa  301  3e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  33.29 
 
 		 1209 aa  296  9e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  33.22 
 
 		 1209 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  39.67 
 
 		 638 aa  290  8e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  32.36 
 
 		 1224 aa  286  8e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  32.36 
 
 		 1224 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  32.17 
 
 		 1224 aa  283  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0592  Ig domain-containing protein  36.52 
 
 		 840 aa  263  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3807  Ig domain-containing protein  32.38 
 
 		 837 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3723  Ig domain-containing protein  33.87 
 
 		 826 aa  259  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00549605  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4080  hypothetical protein  33.86 
 
 		 826 aa  250  7e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3069  hypothetical protein  36.64 
 
 		 830 aa  246  9e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0493  Ig domain-containing protein  34.86 
 
 		 829 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3633  Ig domain-containing protein  34.29 
 
 		 829 aa  239  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3457  Ig domain-containing protein  39.83 
 
 		 829 aa  239  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0314  hypothetical protein  33.64 
 
 		 651 aa  239  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.358502  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0570  Ig domain-containing protein  33.16 
 
 		 851 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.131384 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0536  Ig domain protein group 1 domain protein  31.42 
 
 		 836 aa  233  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4390  Ig domain-containing protein  32.01 
 
 		 843 aa  232  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0531  Ig domain-containing protein  34.92 
 
 		 834 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3742  Ig domain-containing protein  31.94 
 
 		 851 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0510  Ig domain-containing protein  34.98 
 
 		 836 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0783  hypothetical protein  37.3 
 
 		 476 aa  165  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628796  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0677  hypothetical protein  33.01 
 
 		 638 aa  155  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2695  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  33.93 
 
 		 366 aa  125  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000319474  decreased coverage  0.000345849 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0935  hypothetical protein  37.43 
 
 		 498 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  26.81 
 
 		 845 aa  66.6  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  27.06 
 
 		 2795 aa  51.2  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2358  Ig-like, group 1  36.7 
 
 		 727 aa  50.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3639  LigA  31.18 
 
 		 948 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3697  LigA  30.53 
 
 		 951 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0503311  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  26.87 
 
 		 4672 aa  48.1  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2924  Ig-like, group 1  40.54 
 
 		 633 aa  48.1  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3780  LigA  28.32 
 
 		 948 aa  44.3  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>