255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1142 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1142  threonine aldolase  100 
 
 
338 aa  691  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  6.36367e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  78.31 
 
 
337 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.04832e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  78.01 
 
 
337 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  8.09376e-08  unclonable  1.46629e-12 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  78.31 
 
 
337 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  6.65478e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3169  threonine aldolase  78.01 
 
 
337 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  5.33874e-07  unclonable  4.38048e-06 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  75.6 
 
 
337 aa  534  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1347  threonine aldolase  78.31 
 
 
336 aa  536  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  9.74839e-08  decreased coverage  4.17727e-07 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1278  L-threonine aldolase  75.9 
 
 
337 aa  533  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.70333e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1207  L-threonine aldolase  76.2 
 
 
337 aa  532  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  8.62399e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1247  threonine aldolase  78.81 
 
 
336 aa  534  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103654  normal  0.613699 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  76.2 
 
 
337 aa  533  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  5.86474e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2673  threonine aldolase  78.09 
 
 
337 aa  530  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  3.71505e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1155  threonine aldolase  77.61 
 
 
335 aa  528  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  6.19042e-08  decreased coverage  0.00631546 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2462  threonine aldolase  74.47 
 
 
336 aa  522  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  2.61845e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2801  threonine aldolase  76.12 
 
 
336 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1361  threonine aldolase  73.81 
 
 
342 aa  500  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  1.21527e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05668  L-allo-threonine aldolase  64.97 
 
 
334 aa  451  1e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  62.09 
 
 
343 aa  445  1e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2292  threonine aldolase  65.66 
 
 
337 aa  443  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.899538  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  63.77 
 
 
334 aa  441  1e-122  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  62.65 
 
 
366 aa  431  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  60.56 
 
 
334 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4817  threonine aldolase  61.89 
 
 
337 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5364  threonine aldolase  61.59 
 
 
337 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5475  threonine aldolase  59.64 
 
 
337 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  59.39 
 
 
334 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5386  threonine aldolase  59.64 
 
 
337 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4794  threonine aldolase  60.67 
 
 
337 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331333  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0178  L-threonine aldolase  60.67 
 
 
337 aa  381  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3793  threonine aldolase  60.53 
 
 
334 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3310  threonine aldolase  61.59 
 
 
337 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124779  normal  0.12149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  57.41 
 
 
338 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2098  L-allo-threonine aldolase  59.35 
 
 
458 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0834  L-allo-threonine aldolase  59.35 
 
 
337 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0108221  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0430  low-specificity L-threonine aldolase  59.35 
 
 
337 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1834  L-allo-threonine aldolase  59.35 
 
 
337 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1771  L-allo-threonine aldolase  59.35 
 
 
397 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.444188  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0337  low-specificity L-threonine aldolase  59.35 
 
 
337 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400783  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1125  L-allo-threonine aldolase  59.35 
 
 
397 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.628839  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  58.46 
 
 
461 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  59.88 
 
 
348 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  54.6 
 
 
333 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859325 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  60.8 
 
 
339 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2904  L-threonine aldolase  59.64 
 
 
334 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0643317  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  54.01 
 
 
333 aa  368  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0974  L-threonine aldolase  54.3 
 
 
333 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00875  L-allo-threonine aldolase, PLP-dependent  54.3 
 
 
333 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2772  Threonine aldolase  54.3 
 
 
333 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.826971  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00881  hypothetical protein  54.3 
 
 
333 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.554159  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2726  L-threonine aldolase  54.3 
 
 
333 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0943  L-threonine aldolase  54.3 
 
 
333 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.59  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  55.19 
 
 
333 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2204  L-threonine aldolase  61.31 
 
 
335 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1386  L-threonine aldolase  54.01 
 
 
333 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2461  L-threonine aldolase  53.71 
 
 
333 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.994155  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  55.49 
 
 
333 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  55.19 
 
 
333 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  55.19 
 
 
333 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  55.19 
 
 
333 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4276  L-threonine aldolase  59.39 
 
 
334 aa  364  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5968  Threonine aldolase  60.42 
 
 
335 aa  364  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.904259  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2620  L-threonine aldolase  55.93 
 
 
339 aa  359  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1588  L-threonine aldolase  55.93 
 
 
339 aa  359  4e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2705  L-threonine aldolase  55.62 
 
 
351 aa  358  8e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  53.66 
 
 
337 aa  350  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52610  hypothetical protein  58.9 
 
 
334 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4613  hypothetical protein  58.9 
 
 
334 aa  345  7e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3604  threonine aldolase  53.2 
 
 
355 aa  342  6e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.51138  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  51.52 
 
 
337 aa  340  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1686  threonine aldolase  52.33 
 
 
356 aa  339  4e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  53.73 
 
 
339 aa  334  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.77913e-07 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3418  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  52.84 
 
 
339 aa  330  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0639  L-threonine aldolase  50.99 
 
 
354 aa  327  2e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1448  L-threonine aldolase  55.86 
 
 
339 aa  325  9e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  48.79 
 
 
343 aa  323  3e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  48.79 
 
 
343 aa  323  3e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3651  threonine aldolase  56.62 
 
 
349 aa  322  5e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0576  Threonine aldolase  50.43 
 
 
352 aa  321  1e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4454  L-threonine aldolase  49.45 
 
 
370 aa  318  8e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0097  threonine aldolase  55.86 
 
 
339 aa  318  8e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  48.22 
 
 
353 aa  315  6e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  51.21 
 
 
359 aa  311  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  48.83 
 
 
357 aa  309  4e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  47.13 
 
 
344 aa  300  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.9 
 
 
345 aa  294  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0162  L-threonine aldolase  50.62 
 
 
367 aa  288  8e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  43.95 
 
 
344 aa  283  3e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  44.35 
 
 
344 aa  281  9e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3444  Threonine aldolase  46.92 
 
 
359 aa  280  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4499  Threonine aldolase  44.67 
 
 
348 aa  279  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  45.29 
 
 
344 aa  277  2e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0162  threonine aldolase  42.23 
 
 
343 aa  275  7e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.687717  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  46.92 
 
 
340 aa  271  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  42.94 
 
 
353 aa  267  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  42.61 
 
 
341 aa  266  3e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2851  L-threonine aldolase  50.94 
 
 
343 aa  266  5e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185965  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33121  predicted protein  44.44 
 
 
368 aa  264  2e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.752316  normal  0.13405 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  44.71 
 
 
343 aa  263  4e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  7.8963e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3043  Threonine aldolase  46.61 
 
 
339 aa  261  8e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2144  threonine aldolase  46.58 
 
 
344 aa  261  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.708281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>