More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0938 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0938  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 398 aa  819    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  56.17 
 
 		 390 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 390 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7265  MerR family transcriptional regulator  56.93 
 
 		 391 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04067  SAM-dependent methyltransferase  55.42 
 
 		 390 aa  443  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  53.92 
 
 		 391 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0250  MerR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 392 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.757542 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0966  putative transcriptional regulator  47.61 
 
 		 392 aa  343  2e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2976  hypothetical protein  36.33 
 
 		 250 aa  167  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3977  normal  0.29484 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  35.2 
 
 		 249 aa  155  8e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1685  hypothetical protein  35.77 
 
 		 264 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1075  hypothetical protein  35.37 
 
 		 250 aa  146  6e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238827  normal  0.291334 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  35.27 
 
 		 253 aa  143  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  32.93 
 
 		 247 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4877  methyltransferase type 11  34.84 
 
 		 327 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0585  methyltransferase type 11  30.59 
 
 		 253 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8125  acetyltransferase-like protein  37.37 
 
 		 464 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1584  methyltransferase type 11  31.02 
 
 		 250 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3419  methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 261 aa  124  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381882 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1825  methyltransferase type 11  30.2 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627869  normal  0.366066 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1585  hypothetical protein  29.39 
 
 		 256 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0064  Methyltransferase type 11  27.57 
 
 		 249 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2073  methyltransferase type 12  29.15 
 
 		 239 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131474  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1382  methyltransferase type 12  28.92 
 
 		 239 aa  93.2  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00680014  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2724  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.69 
 
 		 239 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2214  transcriptional regulator, MerR family  34.12 
 
 		 177 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000011193 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2008  transcriptional regulator, MerR family  33.53 
 
 		 191 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0139  transcriptional regulator, MerR family  33.13 
 
 		 183 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2779  MerR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575166  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 188 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3841  MerR family transcriptional regulator  55.22 
 
 		 123 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1961  methyltransferase type 12  25.96 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00015321  normal  0.48171 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1930  MerR family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 123 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3033  MerR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0661406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2794  MerR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0198  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 137 aa  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  39.09 
 
 		 135 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 130 aa  64.7  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  41 
 
 		 121 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.8 
 
 		 132 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  39.44 
 
 		 129 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0179  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 136 aa  61.2  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  35.58 
 
 		 129 aa  61.2  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 133 aa  60.5  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  36.45 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  35.11 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  34.74 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3219  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199693  normal  0.39103 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2454  transcriptional regulator, MerR family  44.62 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.589296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0677  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0264  MerR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4286  transcriptional regulator, MerR family  33.03 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4396  transcriptional regulator, MerR family  33.03 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  32.61 
 
 		 139 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 137 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  36.7 
 
 		 130 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0626  transcriptional regulator  35.94 
 
 		 115 aa  58.9  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 132 aa  59.7  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 		 137 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  39.58 
 
 		 129 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  41.89 
 
 		 158 aa  59.7  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  45.83 
 
 		 148 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 		 138 aa  58.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2902  regulatory protein, MerR  37.5 
 
 		 143 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  49.23 
 
 		 125 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 182 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  45.83 
 
 		 148 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 166 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  33.64 
 
 		 129 aa  58.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 169 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 163 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  44.12 
 
 		 124 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  40.54 
 
 		 159 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 127 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 136 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  45.31 
 
 		 155 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 145 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  41.89 
 
 		 159 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2087  MerR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 128 aa  57.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.545443  normal  0.539836 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 126 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2821  MerR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 138 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  32 
 
 		 129 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.12 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0226  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 154 aa  57.8  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0438  transcriptional regulator, MerR family  46.03 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 132 aa  57.4  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 132 aa  57.4  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  41.89 
 
 		 173 aa  57.8  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2889  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359034  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2081  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 117 aa  57.4  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.665595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 150 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 129 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0419  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 146 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000107138  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1535  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.139036  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  36.27 
 
 		 138 aa  57  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3103  MerR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 129 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>