194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0095 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  76.69 
 
 
591 aa  960  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  100 
 
 
599 aa  1240  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  64.97 
 
 
599 aa  815  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  73.72 
 
 
601 aa  944  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  75.59 
 
 
599 aa  942  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  74.67 
 
 
603 aa  938  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  4.26014e-10 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  74 
 
 
603 aa  938  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  73.78 
 
 
594 aa  917  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  56.34 
 
 
583 aa  662  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  76.76 
 
 
619 aa  924  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  73.72 
 
 
601 aa  945  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  73.55 
 
 
601 aa  944  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  72.73 
 
 
602 aa  909  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  74.17 
 
 
603 aa  937  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  73.54 
 
 
603 aa  931  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  54.61 
 
 
595 aa  657  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  73.88 
 
 
603 aa  936  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  73.21 
 
 
601 aa  934  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  52.7 
 
 
589 aa  632  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  51.44 
 
 
588 aa  579  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  48.75 
 
 
587 aa  561  1e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  49.15 
 
 
590 aa  520  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  45.59 
 
 
613 aa  494  1e-138  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  46.76 
 
 
598 aa  474  1e-132  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  47.86 
 
 
621 aa  475  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  45.02 
 
 
593 aa  465  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  42.46 
 
 
1283 aa  464  1e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  45.45 
 
 
586 aa  447  1e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  43.8 
 
 
584 aa  437  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  38.42 
 
 
619 aa  388  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  36.87 
 
 
611 aa  389  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  34.44 
 
 
610 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  34.28 
 
 
609 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  34.45 
 
 
609 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  34.78 
 
 
609 aa  379  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  4.29666e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  34.62 
 
 
609 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  6.339e-11 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  34.28 
 
 
609 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  33.73 
 
 
607 aa  372  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  35.79 
 
 
585 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  34.11 
 
 
609 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  3.491e-08 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  34.17 
 
 
611 aa  371  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  4.85801e-09 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  34.42 
 
 
611 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  5.55519e-06 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  36.41 
 
 
629 aa  369  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  36.68 
 
 
615 aa  364  2e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  34.02 
 
 
609 aa  365  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  36.51 
 
 
615 aa  363  3e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  33.83 
 
 
616 aa  364  3e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  36.68 
 
 
615 aa  363  7e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  33.22 
 
 
616 aa  362  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.86308e-06  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  34.06 
 
 
609 aa  361  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  35.02 
 
 
615 aa  358  1e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  33.99 
 
 
609 aa  358  2e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  33.5 
 
 
609 aa  357  3e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  33.71 
 
 
635 aa  352  1e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  34.91 
 
 
637 aa  351  2e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  34.91 
 
 
617 aa  352  2e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  38.65 
 
 
621 aa  350  3e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  34.92 
 
 
610 aa  349  7e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  35.3 
 
 
616 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  35.3 
 
 
616 aa  346  8e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  4.81618e-06  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  35.92 
 
 
616 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.02664e-05  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2373  hypothetical protein  38.11 
 
 
566 aa  345  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  35.79 
 
 
618 aa  344  3e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  35.34 
 
 
627 aa  343  4e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  34.98 
 
 
616 aa  342  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.23999e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  33.78 
 
 
614 aa  341  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  34.36 
 
 
617 aa  340  3e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  33.11 
 
 
592 aa  339  8e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  34.99 
 
 
613 aa  338  2e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  35.44 
 
 
625 aa  336  9e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  34.45 
 
 
628 aa  333  4e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  37.29 
 
 
605 aa  333  4e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  32.41 
 
 
602 aa  332  1e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  34.39 
 
 
628 aa  331  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  36.98 
 
 
608 aa  330  5e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  34.11 
 
 
610 aa  329  1e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  36.8 
 
 
608 aa  325  1e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  35.11 
 
 
629 aa  324  2e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  33.33 
 
 
613 aa  322  1e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.82029e-06  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  36.01 
 
 
618 aa  318  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.60677e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  33.73 
 
 
624 aa  316  7e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.99463e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  32.87 
 
 
589 aa  315  1e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  33.22 
 
 
625 aa  315  1e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43434  predicted protein  35.02 
 
 
593 aa  311  3e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996285  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  33.57 
 
 
605 aa  307  4e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2922  protein of unknown function DUF885  31.99 
 
 
646 aa  304  4e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.799276  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  35.14 
 
 
551 aa  302  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  34.53 
 
 
607 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  34.53 
 
 
607 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  5.15921e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  34.53 
 
 
607 aa  294  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  31.22 
 
 
593 aa  293  8e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  33.57 
 
 
614 aa  291  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  32.55 
 
 
608 aa  290  4e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  33.04 
 
 
611 aa  288  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  33.1 
 
 
614 aa  288  3e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  31.9 
 
 
621 aa  287  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  32.63 
 
 
614 aa  287  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  32.63 
 
 
614 aa  287  5e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  32.46 
 
 
617 aa  284  4e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0692  protein of unknown function DUF885  38.34 
 
 
547 aa  280  6e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>