93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0033 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0033  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  390  1e-107  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 431 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 428 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  23.24 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  24.87 
 
 		 415 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  24.34 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  24.47 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  24.47 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  24.34 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  24.47 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 414 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 435 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  20.2 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 461 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 416 aa  55.8  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 420 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 420 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 401 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 		 467 aa  55.5  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20840  Major Facilitator Superfamily transporter  22.35 
 
 		 389 aa  54.7  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  23.83 
 
 		 412 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  21.81 
 
 		 415 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 420 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  24.83 
 
 		 406 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 		 423 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  32.12 
 
 		 408 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  27.11 
 
 		 411 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 439 aa  50.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  23.12 
 
 		 414 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 405 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  22.58 
 
 		 414 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 405 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  23.12 
 
 		 417 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 420 aa  48.9  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 435 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  31.25 
 
 		 408 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1884  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 427 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.019643  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 		 417 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  27.81 
 
 		 408 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  27.81 
 
 		 408 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 410 aa  47  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  20.66 
 
 		 444 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  31.25 
 
 		 408 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  22.7 
 
 		 408 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1575  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 472 aa  46.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 		 441 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  21.24 
 
 		 430 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  18.58 
 
 		 408 aa  45.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  27.15 
 
 		 408 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  27.5 
 
 		 408 aa  45.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 432 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 413 aa  45.4  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 413 aa  45.4  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  26.34 
 
 		 419 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  36.54 
 
 		 411 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 436 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0046  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 405 aa  44.3  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  23.43 
 
 		 426 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  19.44 
 
 		 456 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  20.45 
 
 		 442 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2449  permease  22.22 
 
 		 427 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  25.81 
 
 		 419 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  25.81 
 
 		 419 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2628  permease  22.22 
 
 		 427 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  25.81 
 
 		 419 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  20.9 
 
 		 362 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  25.27 
 
 		 419 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  21.65 
 
 		 451 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2411  macrolide efflux protein  22.22 
 
 		 427 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.070182  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2646  putative permease  22.22 
 
 		 427 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000587034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 433 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 		 406 aa  42.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  25.27 
 
 		 419 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2697  putative permease  22.16 
 
 		 427 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.775096  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  19.32 
 
 		 406 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  24.53 
 
 		 415 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3256  putative permease  25.27 
 
 		 314 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0099  hypothetical protein  23.77 
 
 		 169 aa  42.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  22.78 
 
 		 416 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2512  major facilitator transporter  22.16 
 
 		 427 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.267916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2374  macrolide efflux protein  21.69 
 
 		 427 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3246  putative permease  26.26 
 
 		 419 aa  42  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2655  permease, putative  22.16 
 
 		 427 aa  42  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000943346  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4011  protocatechuate (4-hydroxybenzoate) transmembrane transporter  23.53 
 
 		 459 aa  42  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4989  hypothetical protein  21.11 
 
 		 342 aa  41.6  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2672  putative permease  21.47 
 
 		 427 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.929224  normal  0.0249328 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0377  major facilitator transporter  21.61 
 
 		 413 aa  41.6  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  18.97 
 
 		 415 aa  41.6  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0062  putative membrane transport protein  20.81 
 
 		 418 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2128  hypothetical protein  27.54 
 
 		 429 aa  41.6  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2720  putative permease  24 
 
 		 412 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.093304  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 421 aa  41.2  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2974  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 419 aa  41.2  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>