More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2128 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2128  hypothetical protein  100 
 
 
429 aa  832    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  32.33 
 
 
412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  26.8 
 
 
413 aa  106  7e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  26.8 
 
 
413 aa  106  7e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 
405 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  25.54 
 
 
390 aa  100  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  25.54 
 
 
390 aa  100  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  25.18 
 
 
414 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  26.16 
 
 
410 aa  97.4  5e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  23.25 
 
 
422 aa  96.7  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  22.19 
 
 
422 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  28.99 
 
 
412 aa  95.9  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  25.07 
 
 
412 aa  95.5  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 
432 aa  94.4  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  22.36 
 
 
422 aa  92.8  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  23.98 
 
 
414 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0240  transporter, putative  25.36 
 
 
393 aa  92  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  21.97 
 
 
1816 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  32.13 
 
 
410 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  23.74 
 
 
417 aa  90.9  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  24.22 
 
 
415 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  22.79 
 
 
408 aa  90.1  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  24.22 
 
 
417 aa  90.1  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 
444 aa  90.1  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.3 
 
 
408 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 
397 aa  89.7  8e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  23.84 
 
 
415 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  23.28 
 
 
408 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  23.28 
 
 
408 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  23.28 
 
 
408 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  23.74 
 
 
415 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  23.5 
 
 
417 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  22.7 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.48 
 
 
406 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  24.74 
 
 
406 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  22.82 
 
 
408 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  25 
 
 
420 aa  87  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  25.91 
 
 
418 aa  87  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  28.33 
 
 
404 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  23.22 
 
 
408 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  21.78 
 
 
406 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  22.75 
 
 
422 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  22.46 
 
 
406 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  22.46 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  22.46 
 
 
406 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  23.02 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  27.11 
 
 
427 aa  85.1  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 
423 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  22.5 
 
 
422 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  22 
 
 
1829 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  21.89 
 
 
422 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05510  major facilitator superfamily MFS_1  23.77 
 
 
446 aa  83.6  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354906  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  27.16 
 
 
403 aa  83.6  0.000000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  22.25 
 
 
422 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  23.43 
 
 
1769 aa  83.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  22.47 
 
 
414 aa  83.2  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  22.33 
 
 
404 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 
433 aa  81.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  22 
 
 
422 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3334  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  21.1 
 
 
1776 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311515  normal  0.562431 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  22.09 
 
 
404 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  28.39 
 
 
404 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  26.96 
 
 
404 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  22 
 
 
422 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  26.96 
 
 
404 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  22 
 
 
422 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  22.83 
 
 
362 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  27.21 
 
 
423 aa  80.5  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  23.98 
 
 
414 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  23.97 
 
 
432 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  22.35 
 
 
439 aa  79.7  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  22.31 
 
 
426 aa  79  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  24.47 
 
 
404 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  21.8 
 
 
434 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  24.23 
 
 
404 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  23.97 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  20.39 
 
 
1806 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  23.54 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0918  major facilitator superfamily permease  26.36 
 
 
402 aa  77.4  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  21.75 
 
 
422 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  21.71 
 
 
425 aa  76.6  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  20.78 
 
 
429 aa  76.3  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  22.45 
 
 
1876 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  28.04 
 
 
417 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  28.04 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  24.09 
 
 
434 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  24.7 
 
 
434 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  24.09 
 
 
434 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  24.01 
 
 
438 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  24.09 
 
 
434 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  25.06 
 
 
454 aa  74.7  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  21.68 
 
 
449 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  23.84 
 
 
434 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  26.14 
 
 
414 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  24.09 
 
 
434 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 
426 aa  73.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  19.7 
 
 
407 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 
421 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  20.14 
 
 
463 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>