98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0099 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0099  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  316  7.999999999999999e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  37.95 
 
 
417 aa  100  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 
423 aa  81.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  42.01 
 
 
414 aa  81.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  34.48 
 
 
431 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 
420 aa  75.1  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  36 
 
 
435 aa  74.7  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  36.09 
 
 
415 aa  74.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  35.84 
 
 
430 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  37.21 
 
 
444 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 
414 aa  71.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  40.72 
 
 
416 aa  70.9  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 
439 aa  68.9  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 
426 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 
417 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  37.06 
 
 
411 aa  64.7  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  33.53 
 
 
412 aa  64.3  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  37.82 
 
 
441 aa  60.8  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  36.81 
 
 
435 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  28.06 
 
 
405 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  28.06 
 
 
405 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 
417 aa  57.8  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  31.95 
 
 
408 aa  57.8  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0033  hypothetical protein  24.34 
 
 
208 aa  57.8  0.00000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  32.89 
 
 
428 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  25.81 
 
 
410 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  33.77 
 
 
408 aa  54.7  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  32.87 
 
 
378 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  32.87 
 
 
378 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  32.87 
 
 
378 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 
433 aa  54.3  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  32.87 
 
 
415 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20840  Major Facilitator Superfamily transporter  30.72 
 
 
389 aa  53.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  32.87 
 
 
415 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  32.87 
 
 
415 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  31.88 
 
 
408 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 
467 aa  52.4  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  31.88 
 
 
408 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  31.16 
 
 
408 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  38.61 
 
 
408 aa  51.6  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  30.43 
 
 
408 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  31.16 
 
 
408 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  29.87 
 
 
414 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  31.16 
 
 
408 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  30.86 
 
 
427 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  31.91 
 
 
420 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  35.71 
 
 
439 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  38.46 
 
 
420 aa  48.9  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  31.16 
 
 
408 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  43.1 
 
 
417 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  43.1 
 
 
414 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 
420 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 
420 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  29.94 
 
 
461 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  36.64 
 
 
426 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  46.81 
 
 
416 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  30.5 
 
 
397 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  28.47 
 
 
424 aa  45.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4989  hypothetical protein  42.86 
 
 
342 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2974  major facilitator transporter  31.71 
 
 
419 aa  45.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  35 
 
 
411 aa  45.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  30.5 
 
 
418 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  33.33 
 
 
406 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3246  putative permease  33.33 
 
 
419 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  44 
 
 
451 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  28.29 
 
 
415 aa  45.1  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  36.67 
 
 
406 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  36.54 
 
 
404 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  27.27 
 
 
419 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  27.27 
 
 
419 aa  44.7  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  29.79 
 
 
397 aa  44.3  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4238  major facilitator transporter  41.07 
 
 
420 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.375023 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  29.79 
 
 
418 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  29.79 
 
 
418 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  30.34 
 
 
474 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  28.14 
 
 
421 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  29.79 
 
 
417 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  29.79 
 
 
417 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 
432 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  29.27 
 
 
419 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  26.75 
 
 
419 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  36.54 
 
 
406 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  34.62 
 
 
362 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  29.82 
 
 
413 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  31.2 
 
 
416 aa  43.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  26.75 
 
 
419 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  35.8 
 
 
432 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1327  enterobactin exporter EntS  34.19 
 
 
424 aa  43.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00590508  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3256  putative permease  30.49 
 
 
314 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  30.49 
 
 
419 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 
432 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  40.82 
 
 
461 aa  42.4  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 
401 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 
442 aa  42  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  36.67 
 
 
428 aa  42  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  27.06 
 
 
413 aa  41.2  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 
429 aa  40.8  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  29.49 
 
 
410 aa  40.8  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>