More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3997 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 422 aa  825    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  73.74 
 
 		 720 aa  545  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  69.9 
 
 		 398 aa  531  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  69.37 
 
 		 398 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  64.46 
 
 		 400 aa  450  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  57.87 
 
 		 398 aa  437  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  57.07 
 
 		 398 aa  425  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  55.39 
 
 		 404 aa  423  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  55.89 
 
 		 405 aa  419  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  55.47 
 
 		 398 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  55.22 
 
 		 398 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  56 
 
 		 398 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  54.93 
 
 		 419 aa  400  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2246  lytic murein transglycosylase  51.48 
 
 		 490 aa  398  9.999999999999999e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.27518 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0286  lytic murein transglycosylase  50.62 
 
 		 474 aa  392  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1952  transglycolase  50 
 
 		 491 aa  391  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  48.93 
 
 		 486 aa  379  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  45.9 
 
 		 438 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  46.32 
 
 		 445 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  46.32 
 
 		 445 aa  342  7e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  46.42 
 
 		 438 aa  341  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  46.7 
 
 		 438 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  45.8 
 
 		 438 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  45.22 
 
 		 448 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  48.63 
 
 		 448 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  44.76 
 
 		 443 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  46.13 
 
 		 438 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  46.52 
 
 		 461 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  46.79 
 
 		 464 aa  332  7.000000000000001e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  47.86 
 
 		 470 aa  332  1e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  46.79 
 
 		 451 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  47.34 
 
 		 418 aa  328  8e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  44.33 
 
 		 440 aa  325  7e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  46.26 
 
 		 481 aa  325  8.000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  45.72 
 
 		 464 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4363  lytic murein transglycosylase  45.6 
 
 		 469 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  45.77 
 
 		 474 aa  312  9e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  40.88 
 
 		 427 aa  311  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  49.16 
 
 		 429 aa  310  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  46.05 
 
 		 424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  45.36 
 
 		 413 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  45.02 
 
 		 466 aa  306  6e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  45.24 
 
 		 418 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4047  lytic murein transglycosylase  47.72 
 
 		 423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  45.53 
 
 		 413 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  44.27 
 
 		 438 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  43.58 
 
 		 439 aa  301  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  44.05 
 
 		 409 aa  300  4e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  44.27 
 
 		 400 aa  299  6e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  49.26 
 
 		 417 aa  298  8e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  49.26 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  48.2 
 
 		 457 aa  297  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  41.02 
 
 		 377 aa  296  7e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  46.32 
 
 		 421 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  39.7 
 
 		 396 aa  293  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  41.65 
 
 		 415 aa  294  3e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  41.56 
 
 		 424 aa  293  5e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  44.65 
 
 		 470 aa  292  6e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  42.97 
 
 		 430 aa  292  6e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  45.83 
 
 		 430 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  42.71 
 
 		 438 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  41.18 
 
 		 430 aa  291  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  41.04 
 
 		 424 aa  290  4e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  44.71 
 
 		 395 aa  289  6e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  42.44 
 
 		 411 aa  289  7e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  39.85 
 
 		 428 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  40.31 
 
 		 421 aa  288  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  42.18 
 
 		 438 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  41.35 
 
 		 436 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  41.29 
 
 		 395 aa  286  4e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  42.55 
 
 		 410 aa  286  5e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  41.75 
 
 		 401 aa  286  7e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  41.18 
 
 		 433 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  43.27 
 
 		 514 aa  283  4.0000000000000003e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  40.21 
 
 		 395 aa  281  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  44.05 
 
 		 413 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  44.05 
 
 		 462 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  40.31 
 
 		 455 aa  281  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  38.96 
 
 		 437 aa  278  9e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  41.11 
 
 		 413 aa  277  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  40 
 
 		 432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  41.05 
 
 		 417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  43.12 
 
 		 454 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  43.4 
 
 		 411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  41.54 
 
 		 434 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  38.04 
 
 		 409 aa  272  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  38.73 
 
 		 435 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  40.59 
 
 		 407 aa  269  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  38.48 
 
 		 415 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3314  lytic murein transglycosylase  40.15 
 
 		 407 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  39.69 
 
 		 405 aa  263  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  42.74 
 
 		 392 aa  264  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  41.88 
 
 		 434 aa  263  4e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_003296  RS03184  putative transglycosylase protein  42.29 
 
 		 390 aa  263  6e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0378496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  44.71 
 
 		 391 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3727  lytic murein transglycosylase  40.95 
 
 		 405 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3846  lytic murein transglycosylase  39.9 
 
 		 416 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.977376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  37.93 
 
 		 412 aa  259  6e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  40.68 
 
 		 417 aa  257  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  42.49 
 
 		 429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>