230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_27000 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_27000  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 
429 aa  822  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1410  Na+/H+ antiporter NhaA  59.06 
 
 
442 aa  410  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0925  Na+/H+ antiporter NhaA  61.36 
 
 
436 aa  404  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12160  Na+/H+ antiporter NhaA  53.9 
 
 
436 aa  396  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  50.34 
 
 
446 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  54.14 
 
 
453 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  53.65 
 
 
451 aa  364  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0345  Na+/H+ antiporter NhaA  51.67 
 
 
434 aa  356  5e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2105  Na+/H+ antiporter NhaA  52.86 
 
 
462 aa  353  5e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2262  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.19 
 
 
436 aa  350  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50629  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4630  Na+/H+ antiporter NhaA  52.57 
 
 
461 aa  344  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2118  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.61 
 
 
436 aa  343  4e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0195602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2920  Na+/H+ antiporter NhaA  53.37 
 
 
463 aa  338  8e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3507  Na+/H+ antiporter NhaA  51.65 
 
 
429 aa  337  2e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.486632  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2196  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.35 
 
 
450 aa  337  3e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.045378  normal  0.0524961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2207  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.12 
 
 
441 aa  336  4e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2476  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.43 
 
 
464 aa  336  4e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.946252  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2253  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.12 
 
 
450 aa  335  8e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2583  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.57 
 
 
442 aa  333  3e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.281476 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0405  Na+/H+ antiporter NhaA  53.9 
 
 
437 aa  332  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4510  Na+/H+ antiporter NhaA  47.67 
 
 
422 aa  327  2e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0203  Na+/H+ antiporter NhaA  50.7 
 
 
434 aa  326  5e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0229594  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2301  Na+/H+ antiporter NhaA  49.03 
 
 
414 aa  324  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3027  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.42 
 
 
449 aa  322  1e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3924  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.23 
 
 
447 aa  321  2e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00452006  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1657  Na+/H+ antiporter NhaA  50.36 
 
 
432 aa  314  2e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0107  pH-dependent sodium/proton antiporter  46.47 
 
 
461 aa  307  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0066  Na+/H+ antiporter NhaA  44.89 
 
 
433 aa  293  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0880  Na+/H+ antiporter NhaA  45.12 
 
 
401 aa  291  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3924  Na+/H+ antiporter NhaA  43.67 
 
 
402 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0288538  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0683  Kef-type K+ transport system membrane protein  38.98 
 
 
472 aa  281  2e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2573  Na+/H+ antiporter NhaA  54.63 
 
 
539 aa  277  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1238  Na+/H+ antiporter NhaA  50.99 
 
 
431 aa  276  6e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4842  Na+/H+ antiporter NhaA  45.61 
 
 
413 aa  275  9e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0261  Na+/H+ antiporter NhaA  46.25 
 
 
390 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0476  Na+/H+ antiporter NhaA  45.71 
 
 
408 aa  270  3e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0869  putative Na+/H+ antiporter NhaA  37.69 
 
 
419 aa  260  3e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30430  Na+/H+ antiporter NhaA  43.88 
 
 
440 aa  260  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.42 
 
 
399 aa  250  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3091  Na+/H+ antiporter NhaA  53.39 
 
 
447 aa  250  4e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.904983  hitchhiker  1.7266e-05 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.37 
 
 
394 aa  249  5e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.92 
 
 
399 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0028  Na+/H+ antiporter NhaA  35.64 
 
 
396 aa  246  7e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2015  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.04 
 
 
389 aa  245  1e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  40.98 
 
 
396 aa  245  1e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  38.37 
 
 
424 aa  244  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  42.71 
 
 
404 aa  243  4e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.21 
 
 
390 aa  243  4e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.32 
 
 
391 aa  243  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1826  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.79 
 
 
389 aa  243  5e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.243343  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  36.34 
 
 
391 aa  240  3e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  40.42 
 
 
382 aa  240  3e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.13 
 
 
409 aa  240  4e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.14 
 
 
391 aa  239  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1645  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.28 
 
 
389 aa  239  5e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.18 
 
 
397 aa  239  8e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  36.48 
 
 
394 aa  239  9e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.12 
 
 
382 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  5.35639e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.24 
 
 
388 aa  236  5e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.24 
 
 
388 aa  236  5e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.24 
 
 
388 aa  236  5e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.24 
 
 
388 aa  236  5e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.24 
 
 
388 aa  236  5e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.7 
 
 
391 aa  236  8e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.19 
 
 
392 aa  235  1e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.17 
 
 
398 aa  234  2e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.05 
 
 
391 aa  234  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.28 
 
 
400 aa  234  3e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  41.86 
 
 
388 aa  233  4e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.41 
 
 
389 aa  233  4e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  38.34 
 
 
383 aa  233  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  40 
 
 
389 aa  233  5e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.16 
 
 
389 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.16 
 
 
389 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.16 
 
 
389 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.66 
 
 
382 aa  233  7e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.6 
 
 
388 aa  232  8e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.6 
 
 
388 aa  232  8e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  41.6 
 
 
388 aa  232  8e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.6 
 
 
388 aa  232  8e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.6 
 
 
388 aa  232  8e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.6 
 
 
388 aa  232  8e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.6 
 
 
388 aa  232  8e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  40.25 
 
 
401 aa  232  9e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  40 
 
 
391 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.34 
 
 
388 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0544  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.21 
 
 
401 aa  230  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.92 
 
 
400 aa  230  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.79 
 
 
389 aa  229  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.62 
 
 
389 aa  229  9e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.62 
 
 
389 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.42 
 
 
391 aa  227  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  39.19 
 
 
423 aa  226  5e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3657  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.11 
 
 
398 aa  226  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.457018  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  33.56 
 
 
444 aa  226  8e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  36.79 
 
 
386 aa  225  9e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.55 
 
 
391 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  38.07 
 
 
406 aa  224  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  40.77 
 
 
393 aa  223  5e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0406  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.51 
 
 
420 aa  223  7e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>