132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14470 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_14470  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 183 aa  363  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3970  deaminase-reductase domain-containing protein  53.01 
 
 		 186 aa  194  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  46.77 
 
 		 187 aa  168  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.16 
 
 		 177 aa  131  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  41.34 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.94 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.01 
 
 		 187 aa  123  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  39.18 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.01 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.71 
 
 		 179 aa  121  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  35.48 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3842  bifunctional deaminase-reductase-like protein  39.26 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  38.92 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.23 
 
 		 183 aa  101  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.75 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  38.61 
 
 		 173 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  39.62 
 
 		 173 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  37.89 
 
 		 177 aa  95.1  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  37.89 
 
 		 177 aa  95.1  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  37.27 
 
 		 177 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25060  dihydrofolate reductase  37.34 
 
 		 193 aa  85.5  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  35.09 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.89 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  29.73 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  28.11 
 
 		 173 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  28.11 
 
 		 173 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  28.11 
 
 		 173 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  28.65 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  28.65 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  26.92 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  28.65 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  27.81 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  28.65 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4077  dihydrofolate reductase  28.89 
 
 		 172 aa  77.4  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  33.71 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.54 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.89 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  28.72 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  29.24 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.88 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.15 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  25.88 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  26.47 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  31.41 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  29.44 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  24.86 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.65 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.82 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  26.7 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  25.14 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  25.27 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  28.92 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.78 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  27.04 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.35 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.72 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  36.54 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  35.42 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  28.33 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  26.26 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  33 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  24.73 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  29.68 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  29.63 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.9 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  29.51 
 
 		 180 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.73 
 
 		 175 aa  51.6  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.23 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 222 aa  50.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.79 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.9 
 
 		 240 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.88 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.82 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.29 
 
 		 220 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  26.49 
 
 		 177 aa  48.5  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.29 
 
 		 220 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.93 
 
 		 214 aa  48.5  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.17 
 
 		 206 aa  48.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  30.23 
 
 		 177 aa  48.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.77 
 
 		 180 aa  47.8  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2049  bifunctional deaminase-reductase-like  27.4 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.58 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.01 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  28.64 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.29 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  27.11 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.98 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4561  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.27 
 
 		 197 aa  45.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  35.42 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  28.95 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  31.82 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.17 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5086  bifunctional deaminase-reductase-like  29.09 
 
 		 177 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.68 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  31.41 
 
 		 184 aa  45.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.74 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  30.2 
 
 		 173 aa  45.1  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  20.43 
 
 		 188 aa  44.7  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169407 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>