31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0973 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3439  TonB-dependent receptor  66.23 
 
 		 684 aa  918    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.587459  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0935  TonB-dependent receptor  99.12 
 
 		 683 aa  1390    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000201333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0973  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 683 aa  1404    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00145441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3367  TonB-dependent receptor  65.94 
 
 		 684 aa  911    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0939  TonB-dependent receptor  68.96 
 
 		 683 aa  968    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0878917  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3564  TonB-dependent receptor  67.11 
 
 		 684 aa  924    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000148134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0937  TonB-dependent receptor  91.65 
 
 		 683 aa  1260    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0923  TonB-dependent receptor  67.11 
 
 		 684 aa  928    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.854225  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1102  TonB-dependent receptor domain-containing protein  84.33 
 
 		 683 aa  1129    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0948  TonB-dependent receptor domain-containing protein  39.66 
 
 		 691 aa  487  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.915378  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  26.33 
 
 		 737 aa  190  9e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 730 aa  178  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 727 aa  171  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 727 aa  170  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 729 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 751 aa  165  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 738 aa  130  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 734 aa  125  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4270  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 880 aa  121  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.156647  decreased coverage  0.00504276 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2540  hypothetical protein  24.08 
 
 		 601 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.600129  normal  0.687458 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0508  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 764 aa  107  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.786517  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  22.05 
 
 		 773 aa  91.7  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0023  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 747 aa  86.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 809 aa  46.6  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 700 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  35.48 
 
 		 730 aa  45.8  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 665 aa  44.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 781 aa  44.3  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 777 aa  44.3  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 777 aa  44.3  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 777 aa  44.3  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>