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for query gene Shewana3_2204 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2204  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 402 aa  797    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1232  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  44.53 
 
 		 396 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104179  normal  1 
 
 
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NC_011092  SeSA_B0064  chloramphenicol resistance protein  43.49 
 
 		 419 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.629663 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3862  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.62 
 
 		 399 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.984629 
 
 
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NC_008254  Meso_3944  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.86 
 
 		 401 aa  299  6e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_1320  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  45.3 
 
 		 395 aa  298  8e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_4704  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.62 
 
 		 399 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3659  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.62 
 
 		 399 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154078  normal  0.828723 
 
 
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NC_009636  Smed_2519  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.64 
 
 		 399 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.632928 
 
 
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NC_009667  Oant_1335  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.31 
 
 		 397 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.409904  n/a   
 
 
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NC_009140  SNSL254_pSN254_0040  florfenicol/chloramphenicol resistance protein FloR  45.68 
 
 		 404 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3550  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  43.09 
 
 		 395 aa  281  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B2449  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.35 
 
 		 410 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3389  hypothetical protein  44.87 
 
 		 244 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0402028 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  32.85 
 
 		 400 aa  176  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal  1 
 
 
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NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.14 
 
 		 400 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010506  Swoo_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.662405 
 
 
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NC_009457  VC0395_A2445  putative multidrug resistance protein  33.16 
 
 		 400 aa  169  9e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.74 
 
 		 400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007963  Csal_2509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.23 
 
 		 389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.01 
 
 		 400 aa  167  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_00358  permease  32.31 
 
 		 423 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  32.76 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  32.92 
 
 		 397 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_3494  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.45 
 
 		 402 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.61895  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  33.04 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009052  Sbal_0196  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.74 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4138  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.74 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_0196  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.74 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009997  Sbal195_4271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.74 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0763382 
 
 
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NC_008345  Sfri_0297  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.24 
 
 		 401 aa  159  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169159  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_0325  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.63 
 
 		 402 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_3750  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.63 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008577  Shewana3_3948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.63 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3823  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 		 402 aa  154  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4555  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  32.74 
 
 		 402 aa  149  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  29.97 
 
 		 398 aa  145  9e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.97 
 
 		 398 aa  145  9e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_4475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.23 
 
 		 408 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439856  normal  0.289296 
 
 
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NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.19 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.36 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.82 
 
 		 400 aa  136  8e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_006368  lpp2505  hypothetical protein  31.1 
 
 		 371 aa  134  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.99 
 
 		 418 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.65 
 
 		 403 aa  133  6.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.97 
 
 		 412 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_2106  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.62 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.758817  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1996  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.62 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006369  lpl2359  hypothetical protein  30.49 
 
 		 371 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.11 
 
 		 425 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  31.55 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.23 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013757  Gobs_3432  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.13 
 
 		 438 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00363219  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_2220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.93 
 
 		 430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.21 
 
 		 401 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.33 
 
 		 398 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  30.71 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_2665  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.92 
 
 		 408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126331  hitchhiker  0.00560959 
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  30 
 
 		 392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013456  VEA_003780  permease  30.38 
 
 		 400 aa  127  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.61 
 
 		 394 aa  127  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  27.98 
 
 		 426 aa  126  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30 
 
 		 405 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  27.88 
 
 		 413 aa  126  8.000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.41 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.77 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3211  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.81 
 
 		 424 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.41 
 
 		 458 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  33.33 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.41 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.43 
 
 		 393 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0876  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.98 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.453625  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2392  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.72 
 
 		 421 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.06 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  33.08 
 
 		 414 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.99 
 
 		 407 aa  124  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.19 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.44 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1777  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.91 
 
 		 407 aa  124  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.29 
 
 		 402 aa  124  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2800  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.92 
 
 		 411 aa  124  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.42 
 
 		 392 aa  124  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.35 
 
 		 430 aa  123  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2254  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.45 
 
 		 399 aa  123  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0827  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.29 
 
 		 389 aa  123  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2744  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.37 
 
 		 397 aa  123  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000519122 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02654  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.72 
 
 		 400 aa  123  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.46 
 
 		 420 aa  122  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.37 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.799827  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.65 
 
 		 411 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.45 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.97 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.35 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
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NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  31.07 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.43 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.43 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.43 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.68 
 
 		 436 aa  121  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_4704  putative drug resistance transporter  30.97 
 
 		 402 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.096379  normal  0.25889 
 
 
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