194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3722 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  56.58 
 
 
589 aa  656  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  74.38 
 
 
603 aa  939  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  74.88 
 
 
603 aa  944  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  74.79 
 
 
599 aa  931  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  68.17 
 
 
599 aa  846  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  59.93 
 
 
583 aa  682  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  73.78 
 
 
599 aa  918  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  74.54 
 
 
603 aa  940  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  76.44 
 
 
619 aa  902  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  73.46 
 
 
601 aa  934  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  73.79 
 
 
601 aa  936  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  73.79 
 
 
601 aa  936  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  57.05 
 
 
595 aa  690  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  74.7 
 
 
591 aa  932  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  73.05 
 
 
602 aa  909  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  74.46 
 
 
603 aa  936  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  73.62 
 
 
601 aa  936  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  75.04 
 
 
603 aa  945  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  4.26014e-10 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  100 
 
 
594 aa  1229  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  52.15 
 
 
588 aa  604  1e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  50.81 
 
 
587 aa  577  1e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  46.27 
 
 
590 aa  505  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  46.04 
 
 
613 aa  499  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  45.88 
 
 
593 aa  485  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  49.02 
 
 
621 aa  478  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  43.32 
 
 
598 aa  475  1e-132  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  40.71 
 
 
1283 aa  452  1e-126  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  42.64 
 
 
586 aa  449  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  44.13 
 
 
584 aa  446  1e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  37.67 
 
 
619 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  36.43 
 
 
611 aa  386  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  4.85801e-09 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  36.24 
 
 
609 aa  386  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  35.67 
 
 
609 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  36.24 
 
 
609 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  6.339e-11 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  35.67 
 
 
609 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  36.05 
 
 
609 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  4.29666e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  35.67 
 
 
609 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  37.43 
 
 
611 aa  383  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  35.48 
 
 
609 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  3.491e-08 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  33.78 
 
 
609 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  35.42 
 
 
585 aa  379  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  35.85 
 
 
611 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  5.55519e-06 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  34.34 
 
 
607 aa  375  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  35.29 
 
 
609 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  35.61 
 
 
616 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  35.42 
 
 
616 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.86308e-06  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  39.36 
 
 
621 aa  365  2e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  35.47 
 
 
629 aa  364  3e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  35.82 
 
 
592 aa  360  5e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  34.22 
 
 
610 aa  358  1e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  34.53 
 
 
609 aa  358  2e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  35.47 
 
 
610 aa  358  2e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  34.05 
 
 
637 aa  357  5e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  33.73 
 
 
635 aa  356  6e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  36.2 
 
 
615 aa  355  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  36.2 
 
 
615 aa  353  5e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  36.2 
 
 
615 aa  353  6e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  37.07 
 
 
608 aa  345  1e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  34.54 
 
 
615 aa  344  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  33.06 
 
 
617 aa  342  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  35.11 
 
 
625 aa  341  2e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  38.99 
 
 
605 aa  338  1e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  36.72 
 
 
608 aa  338  2e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  34.22 
 
 
616 aa  338  2e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.23999e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  34.22 
 
 
616 aa  337  3e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  4.81618e-06  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  34.22 
 
 
616 aa  337  4e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.02664e-05  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  32.34 
 
 
617 aa  335  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  34.36 
 
 
589 aa  335  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  34.85 
 
 
628 aa  335  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  34.05 
 
 
616 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2373  hypothetical protein  37.03 
 
 
566 aa  334  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  33.28 
 
 
628 aa  332  1e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  36.52 
 
 
627 aa  332  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  32.3 
 
 
614 aa  331  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  33.5 
 
 
613 aa  326  8e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  34.11 
 
 
605 aa  325  2e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  31.31 
 
 
602 aa  325  2e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  33.85 
 
 
618 aa  325  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  34.74 
 
 
610 aa  324  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43434  predicted protein  36.64 
 
 
593 aa  323  6e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996285  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  34.57 
 
 
613 aa  320  5e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.82029e-06  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  36.94 
 
 
607 aa  317  3e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  5.15921e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  36.94 
 
 
607 aa  317  4e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  36.94 
 
 
607 aa  317  4e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  35.06 
 
 
625 aa  316  6e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  32.71 
 
 
624 aa  316  9e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.99463e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  33.61 
 
 
629 aa  313  5e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  36.19 
 
 
614 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  33.1 
 
 
593 aa  312  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  36.71 
 
 
618 aa  310  6e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.60677e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  36.19 
 
 
614 aa  310  6e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  35.34 
 
 
551 aa  310  7e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  36.07 
 
 
617 aa  309  7e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  36.01 
 
 
614 aa  309  8e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  36.82 
 
 
614 aa  308  1e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  34.67 
 
 
608 aa  307  3e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  34.6 
 
 
621 aa  306  6e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2922  protein of unknown function DUF885  31.09 
 
 
646 aa  295  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.799276  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  34.55 
 
 
611 aa  295  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  33.23 
 
 
635 aa  289  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>