More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1100 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 170 aa  343  5e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  80.59 
 
 		 176 aa  293  7e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  82.84 
 
 		 170 aa  290  7e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  80.47 
 
 		 176 aa  288  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  79.41 
 
 		 171 aa  276  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  78.24 
 
 		 171 aa  275  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  78.82 
 
 		 171 aa  274  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  78.82 
 
 		 171 aa  274  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  81.21 
 
 		 170 aa  274  4e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  78.82 
 
 		 171 aa  274  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  81.21 
 
 		 170 aa  274  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  81.21 
 
 		 170 aa  274  4e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  80.98 
 
 		 168 aa  272  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  78.79 
 
 		 170 aa  268  4e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  75.3 
 
 		 170 aa  264  4e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  75.62 
 
 		 182 aa  253  7e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  56.88 
 
 		 171 aa  183  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  54.43 
 
 		 169 aa  180  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  54.43 
 
 		 169 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  52.66 
 
 		 182 aa  178  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  55.97 
 
 		 170 aa  177  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  53.37 
 
 		 171 aa  177  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  50.3 
 
 		 180 aa  177  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  51.53 
 
 		 164 aa  176  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  53.12 
 
 		 169 aa  175  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  56.49 
 
 		 168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  52.15 
 
 		 164 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  52.15 
 
 		 164 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  48.81 
 
 		 168 aa  171  5.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  51.53 
 
 		 164 aa  170  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  51.53 
 
 		 164 aa  170  6.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  51.53 
 
 		 164 aa  170  6.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  51.53 
 
 		 164 aa  170  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  51.53 
 
 		 164 aa  170  6.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  51.53 
 
 		 164 aa  170  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  51.22 
 
 		 170 aa  170  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  50.6 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  55.13 
 
 		 169 aa  169  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  51.53 
 
 		 164 aa  169  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  50.6 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  50.6 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  50.6 
 
 		 166 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  50.6 
 
 		 166 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  51.22 
 
 		 170 aa  169  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  50.3 
 
 		 166 aa  167  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  49.38 
 
 		 165 aa  165  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  46.47 
 
 		 173 aa  160  7e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  52.32 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  53.47 
 
 		 169 aa  154  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  53.25 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  50.3 
 
 		 169 aa  148  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  49.1 
 
 		 169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  51.66 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  49.04 
 
 		 173 aa  142  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  46.25 
 
 		 165 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  44.38 
 
 		 169 aa  140  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  47.4 
 
 		 165 aa  140  8e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  50.31 
 
 		 167 aa  140  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  44.74 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  44.74 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  49.68 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  47.44 
 
 		 157 aa  137  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  43.37 
 
 		 172 aa  136  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  51.39 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  45.81 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  44.31 
 
 		 178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  45.39 
 
 		 169 aa  134  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  44.59 
 
 		 168 aa  134  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  55.2 
 
 		 181 aa  134  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  48 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  47.02 
 
 		 159 aa  131  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 		 179 aa  130  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  48.32 
 
 		 166 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  48.32 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  44.37 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  48.32 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  48.32 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  48.32 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  48.32 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  48.32 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  48.32 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  48 
 
 		 174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  44.1 
 
 		 358 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  48 
 
 		 174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  47.71 
 
 		 178 aa  128  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  45.28 
 
 		 176 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 235 aa  128  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  40.49 
 
 		 170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  48 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  45.81 
 
 		 160 aa  127  6e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  40.88 
 
 		 202 aa  127  6e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  48.32 
 
 		 172 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  44.03 
 
 		 164 aa  127  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  47.65 
 
 		 166 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  47.65 
 
 		 166 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  47.65 
 
 		 166 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  47.65 
 
 		 166 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  42.76 
 
 		 167 aa  127  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  48.32 
 
 		 172 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  44.83 
 
 		 163 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>