More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2331 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  80.8 
 
 		 437 aa  714    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  85.02 
 
 		 440 aa  757    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  82.13 
 
 		 436 aa  727    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  84.79 
 
 		 440 aa  755    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  80.8 
 
 		 439 aa  705    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  80.97 
 
 		 436 aa  720    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  85.02 
 
 		 440 aa  757    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  81.59 
 
 		 442 aa  716    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 438 aa  870    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  81.97 
 
 		 437 aa  722    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  83.14 
 
 		 441 aa  711    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  85.01 
 
 		 437 aa  739    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  84.78 
 
 		 437 aa  738    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  84.33 
 
 		 440 aa  749    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  87.16 
 
 		 436 aa  772    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  83.61 
 
 		 437 aa  734    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  61.48 
 
 		 445 aa  528  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  60.45 
 
 		 449 aa  529  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  61.31 
 
 		 447 aa  519  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  59.29 
 
 		 434 aa  520  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  59.72 
 
 		 434 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  59.49 
 
 		 434 aa  512  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  59.72 
 
 		 433 aa  510  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  59.35 
 
 		 448 aa  486  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  55.66 
 
 		 436 aa  426  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  50.95 
 
 		 457 aa  412  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  50.48 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  50.12 
 
 		 452 aa  404  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  48.36 
 
 		 440 aa  396  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  49.88 
 
 		 457 aa  382  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  48.91 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  48.55 
 
 		 411 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  48.55 
 
 		 411 aa  368  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  48.91 
 
 		 411 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  48.07 
 
 		 411 aa  368  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  47.7 
 
 		 411 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  47.28 
 
 		 445 aa  367  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  47.7 
 
 		 411 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  47.94 
 
 		 411 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  48.31 
 
 		 411 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  47.7 
 
 		 411 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  47.7 
 
 		 411 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  46.44 
 
 		 443 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  47.46 
 
 		 411 aa  362  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  47.52 
 
 		 409 aa  360  3e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  46.02 
 
 		 440 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  46.02 
 
 		 440 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  46.02 
 
 		 435 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  44.39 
 
 		 432 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  45.77 
 
 		 424 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  45.02 
 
 		 430 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  44.63 
 
 		 409 aa  355  7.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  44.55 
 
 		 449 aa  354  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  44.61 
 
 		 444 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  44.36 
 
 		 444 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  45.89 
 
 		 433 aa  353  4e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  44.61 
 
 		 444 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  44.61 
 
 		 444 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  45.45 
 
 		 410 aa  343  4e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  47.21 
 
 		 417 aa  339  7e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  44.25 
 
 		 402 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01133  hypothetical protein  42.38 
 
 		 424 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  41.94 
 
 		 413 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004292  proton/glutamate symport protein  42.96 
 
 		 424 aa  301  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0413758  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1325  proton glutamate symport protein  42.86 
 
 		 427 aa  296  6e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151644  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2904  sodium:dicarboxylate symporter  41.91 
 
 		 451 aa  294  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.555878  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  39.76 
 
 		 424 aa  291  2e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0390  sodium:dicarboxylate symporter  46.79 
 
 		 428 aa  288  1e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000203  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  42.28 
 
 		 409 aa  288  1e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1020  sodium--dicarboxylate symporter  40.09 
 
 		 479 aa  282  1e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  40.47 
 
 		 430 aa  281  1e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  42.43 
 
 		 437 aa  279  7e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  39.1 
 
 		 417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  39.67 
 
 		 427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  38.53 
 
 		 426 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  41.64 
 
 		 416 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1353  excitatory amino acid transporter  39.03 
 
 		 427 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1241  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  40.63 
 
 		 432 aa  272  1e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1002  sodium:dicarboxylate symporter  40.05 
 
 		 432 aa  271  2e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.541825 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  41.21 
 
 		 416 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0719  sodium:dicarboxylate symporter  40.4 
 
 		 418 aa  270  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1194  hypothetical protein  38.62 
 
 		 444 aa  269  5.9999999999999995e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654767 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3781  sodium:dicarboxylate symporter  39.95 
 
 		 421 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549433  hitchhiker  0.000150842 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  37.62 
 
 		 441 aa  267  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0642  sodium:dicarboxylate symporter  39.37 
 
 		 416 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3378  sodium:dicarboxylate symporter  39.37 
 
 		 416 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033988 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0642  sodium:dicarboxylate symporter  39.37 
 
 		 416 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000327788 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  37.76 
 
 		 424 aa  266  7e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  38.53 
 
 		 417 aa  266  7e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  37.95 
 
 		 419 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  37.95 
 
 		 419 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  38.68 
 
 		 413 aa  264  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  37.79 
 
 		 419 aa  264  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  38.85 
 
 		 425 aa  264  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  38.3 
 
 		 417 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  37.95 
 
 		 419 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0595  sodium:dicarboxylate symporter  38.93 
 
 		 414 aa  264  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.1634  normal  0.0311958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  38.27 
 
 		 409 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  38.06 
 
 		 417 aa  263  4e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  37.05 
 
 		 425 aa  263  4e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>