More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1464 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1464  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 
121 aa  256  6e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0263105  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1028  peptide methionine sulfoxide reductase  65.55 
 
 
124 aa  178  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.589309  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1056  methionine sulfoxide reductase B  63.03 
 
 
124 aa  173  7e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.690057  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  66.38 
 
 
334 aa  170  7.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1255  methionine sulfoxide reductase B  63.03 
 
 
119 aa  168  2e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  62.93 
 
 
351 aa  168  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0609  methionine sulfoxide reductase B  62.18 
 
 
119 aa  168  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1130  methionine sulfoxide reductase B  62.18 
 
 
119 aa  168  3e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2731  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  61.67 
 
 
120 aa  166  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000598889  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0754  methionine sulfoxide reductase B  62.61 
 
 
169 aa  165  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.192538  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  62.18 
 
 
290 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0746  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  60.53 
 
 
286 aa  162  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000037264  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  61.21 
 
 
287 aa  160  6e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  59.83 
 
 
301 aa  158  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  62.07 
 
 
284 aa  159  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  60.5 
 
 
338 aa  157  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  59.48 
 
 
301 aa  155  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  59.48 
 
 
301 aa  156  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  59.48 
 
 
301 aa  155  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0688  methionine sulfoxide reductase B  60 
 
 
159 aa  155  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  60.53 
 
 
301 aa  154  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  60.34 
 
 
333 aa  153  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  58.77 
 
 
301 aa  153  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  58.77 
 
 
301 aa  153  8e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  58.77 
 
 
302 aa  153  9e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.89 
 
 
301 aa  153  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0012  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.76 
 
 
306 aa  152  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2506  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  58.77 
 
 
300 aa  152  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2423  methionine sulfoxide reductase B  58.77 
 
 
122 aa  150  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.55047  normal  0.248958 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  59.66 
 
 
334 aa  150  7e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.89 
 
 
301 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  58.77 
 
 
301 aa  149  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.26 
 
 
305 aa  146  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.02 
 
 
305 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1456  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55.93 
 
 
284 aa  144  3e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0102824  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55 
 
 
284 aa  144  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2977  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55.46 
 
 
289 aa  143  6e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2825  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55.46 
 
 
289 aa  143  6e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.39 
 
 
309 aa  140  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1329  Methionine sulfoxide reductase B  53.91 
 
 
148 aa  137  7e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.397039  normal  0.253282 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9083  predicted protein  48.72 
 
 
128 aa  120  6e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1542  methionine-R-sulfoxide reductase  51.33 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3916  methionine-R-sulfoxide reductase  49.15 
 
 
136 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158974  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04990  protein-methionine-R-oxide reductase, putative  50.43 
 
 
134 aa  117  7e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.296874  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1661  methionine-R-sulfoxide reductase  49.17 
 
 
161 aa  117  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.626292  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2487  methionine-R-sulfoxide reductase  47.54 
 
 
136 aa  117  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2267  methionine-R-sulfoxide reductase  49.57 
 
 
146 aa  116  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2205  methionine-R-sulfoxide reductase  48.31 
 
 
136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346022  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1654  methionine-R-sulfoxide reductase  49.14 
 
 
178 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2216  protein-methionine-S-oxide reductase  48.31 
 
 
136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2262  methionine-R-sulfoxide reductase  48.31 
 
 
136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42981  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24060  methionine-R-sulfoxide reductase  47.5 
 
 
141 aa  114  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0197494 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1589  methionine-R-sulfoxide reductase  49.56 
 
 
149 aa  114  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105808  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  47.83 
 
 
131 aa  114  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12689  hypothetical protein  48.31 
 
 
136 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.09651e-60  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1485  methionine-R-sulfoxide reductase  48.67 
 
 
136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476071  hitchhiker  0.000138534 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1895  methionine-R-sulfoxide reductase  46.96 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  47.5 
 
 
183 aa  112  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  48.28 
 
 
159 aa  111  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  46.61 
 
 
180 aa  110  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  47.37 
 
 
141 aa  110  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  45.83 
 
 
180 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13770  methionine-R-sulfoxide reductase  46.49 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6715  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  47.83 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.264414 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15640  methionine-R-sulfoxide reductase  45.53 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.825973  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1768  methionine-R-sulfoxide reductase  48.7 
 
 
135 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205069  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12940  methionine-R-sulfoxide reductase  45.3 
 
 
171 aa  107  5e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0480149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  47.5 
 
 
142 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12448  putative methionine sulfoxide reductase, SelR  49.58 
 
 
148 aa  107  8.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.626775  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4333  methionine-R-sulfoxide reductase  48.28 
 
 
146 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01932  methionine-R-sulfoxide reductase SelR, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07840)  48.6 
 
 
153 aa  106  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  46.43 
 
 
140 aa  105  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1565  methionine-R-sulfoxide reductase  45.83 
 
 
142 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4430  methionine-R-sulfoxide reductase  44.83 
 
 
152 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  44.35 
 
 
167 aa  104  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  49.14 
 
 
142 aa  105  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  47.37 
 
 
134 aa  104  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  43.86 
 
 
141 aa  104  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  41.18 
 
 
138 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  41.18 
 
 
138 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2259  methionine-R-sulfoxide reductase  46.09 
 
 
133 aa  102  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.128269 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  42.98 
 
 
166 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3910  methionine-R-sulfoxide reductase  45.61 
 
 
133 aa  101  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01256  methionine sulfoxide reductase B  41.18 
 
 
142 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.779389  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  45.61 
 
 
140 aa  101  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2643  methionine-R-sulfoxide reductase  46.55 
 
 
137 aa  101  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2342  methionine-R-sulfoxide reductase  44.83 
 
 
125 aa  100  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929654  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  44.44 
 
 
147 aa  100  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2214  methionine-R-sulfoxide reductase  42.86 
 
 
138 aa  100  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.399657  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0469  methionine-R-sulfoxide reductase  40.52 
 
 
190 aa  100  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046463  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1893  methionine sulfoxide reductase B  41.67 
 
 
140 aa  100  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0416766  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  43.1 
 
 
133 aa  100  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0440  methionine sulfoxide reductase B  42.86 
 
 
155 aa  100  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1902  methionine-R-sulfoxide reductase  43.97 
 
 
135 aa  100  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  42.98 
 
 
174 aa  100  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  40.87 
 
 
133 aa  100  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  43.36 
 
 
164 aa  99.4  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  47.37 
 
 
135 aa  99.8  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  43.97 
 
 
166 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  45.3 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>