More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0440 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0440  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 
155 aa  319  8e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03070  methionine sulfoxide reductase B  78.57 
 
 
154 aa  256  6e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2001  methionine sulfoxide reductase B  67.59 
 
 
201 aa  216  7.999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0768208  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1925  methionine sulfoxide reductase B  68.28 
 
 
155 aa  216  7.999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0476823  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3166  methionine sulfoxide reductase B  64.9 
 
 
163 aa  204  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3401  methionine sulfoxide reductase B  66.41 
 
 
141 aa  189  9e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2558  methionine-R-sulfoxide reductase  63.85 
 
 
141 aa  175  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0971304  normal  0.867883 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2945  methionine-R-sulfoxide reductase  63.85 
 
 
141 aa  175  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  62.28 
 
 
135 aa  148  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01747  methionine sulfoxide reductase B  56.69 
 
 
137 aa  147  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0193587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1864  methionine-R-sulfoxide reductase  56.69 
 
 
137 aa  147  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000480706  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2502  methionine sulfoxide reductase B  56.69 
 
 
137 aa  147  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1413  methionine sulfoxide reductase B  56.69 
 
 
137 aa  147  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133391  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01735  hypothetical protein  56.69 
 
 
137 aa  147  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2002  methionine sulfoxide reductase B  56.69 
 
 
137 aa  147  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00962024  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1863  methionine sulfoxide reductase B  56.69 
 
 
137 aa  147  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000150257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1854  methionine sulfoxide reductase B  56.69 
 
 
137 aa  147  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0487085  hitchhiker  0.0000151548 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  58.82 
 
 
133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  51.52 
 
 
134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  57.52 
 
 
131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  60 
 
 
132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01256  methionine sulfoxide reductase B  56.03 
 
 
142 aa  144  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.779389  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2350  methionine sulfoxide reductase B  56.91 
 
 
137 aa  144  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167897  normal  0.0377518 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2095  methionine sulfoxide reductase B  56.91 
 
 
137 aa  144  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000449437  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1986  methionine sulfoxide reductase B  56.91 
 
 
137 aa  144  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000131447  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  55.38 
 
 
166 aa  143  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  56.64 
 
 
131 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  57.52 
 
 
131 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  57.52 
 
 
136 aa  142  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1676  methionine sulfoxide reductase B  54.1 
 
 
137 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000216334  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1884  methionine sulfoxide reductase B  55.37 
 
 
137 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000227022  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  61.4 
 
 
136 aa  140  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2065  methionine sulfoxide reductase B  55.37 
 
 
137 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.717826  hitchhiker  0.00120288 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  53.23 
 
 
144 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1385  methionine sulfoxide reductase B  55.37 
 
 
137 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0497198  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1418  methionine sulfoxide reductase B  55.37 
 
 
137 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.445758 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  53.12 
 
 
140 aa  139  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1402  methionine sulfoxide reductase B  55.37 
 
 
137 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  hitchhiker  0.0051199 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  56.14 
 
 
131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  50.38 
 
 
136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  56.3 
 
 
140 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1850  methionine sulfoxide reductase B  54.92 
 
 
134 aa  137  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.510559  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
131 aa  137  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  56.64 
 
 
131 aa  137  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  57.02 
 
 
131 aa  137  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2727  methionine sulfoxide reductase B  56.14 
 
 
137 aa  137  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00340114  hitchhiker  0.000973633 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  55.83 
 
 
131 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
147 aa  135  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33670  methionine-R-sulfoxide reductase  58.06 
 
 
131 aa  136  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263102  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  57.52 
 
 
151 aa  136  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  55.08 
 
 
142 aa  135  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  54.17 
 
 
133 aa  135  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  51.18 
 
 
137 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3024  methionine-R-sulfoxide reductase  52 
 
 
127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0106667 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  53.17 
 
 
141 aa  135  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  53.6 
 
 
140 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5573  methionine sulfoxide reductase B  52.8 
 
 
147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139871  normal  0.0985113 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  56.52 
 
 
163 aa  134  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  47.58 
 
 
135 aa  133  8e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  50.77 
 
 
183 aa  133  9e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  49.62 
 
 
146 aa  133  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3481  methionine-R-sulfoxide reductase  51.94 
 
 
133 aa  133  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  52.8 
 
 
140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  51.15 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  55.75 
 
 
137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1966  methionine sulfoxide reductase B  49.62 
 
 
139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0169175  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2966  methionine sulfoxide reductase B  51.08 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  54.69 
 
 
141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  57.02 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  49.24 
 
 
142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  52.78 
 
 
140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  54.87 
 
 
142 aa  131  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  51.88 
 
 
140 aa  132  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  52.85 
 
 
150 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2975  protein-methionine-S-oxide reductase  57.55 
 
 
135 aa  131  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0725689 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  50.4 
 
 
133 aa  131  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  48.92 
 
 
135 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  55.75 
 
 
137 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  48.57 
 
 
136 aa  130  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  53.98 
 
 
134 aa  130  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  49.59 
 
 
139 aa  130  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  53.98 
 
 
128 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2262  methionine sulfoxide reductase B  48.53 
 
 
139 aa  130  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00190122  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  49.25 
 
 
138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  51.49 
 
 
133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2627  methionine-R-sulfoxide reductase  47.69 
 
 
136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277502  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  56.64 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  52.94 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  50.41 
 
 
148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  53.1 
 
 
128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2214  methionine-R-sulfoxide reductase  53.23 
 
 
138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.399657  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  54.87 
 
 
159 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1638  methionine-R-sulfoxide reductase  55.26 
 
 
127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  53.1 
 
 
128 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7199  methionine-R-sulfoxide reductase  51.49 
 
 
150 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.929536  normal  0.310731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  52.46 
 
 
167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  50.38 
 
 
138 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  50.38 
 
 
138 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0783  peptide methionine sulfoxide reductase  51.75 
 
 
444 aa  126  9.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>