More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1058 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1058  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 297 aa  612  9.999999999999999e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0120  dihydrodipicolinate synthase  77.78 
 
 		 297 aa  490  1e-137  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.380726  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1138  dihydrodipicolinate synthase  77.78 
 
 		 297 aa  485  1e-136  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.635374  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0784  dihydrodipicolinate synthase  76.09 
 
 		 297 aa  482  1e-135  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0897  dihydrodipicolinate synthase  73.88 
 
 		 298 aa  464  1e-129  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0626  dihydrodipicolinate synthase  76.63 
 
 		 298 aa  462  1e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0827  dihydrodipicolinate synthase  73.88 
 
 		 298 aa  464  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1204  dihydrodipicolinate synthase  73.2 
 
 		 298 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247588  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0583  dihydrodipicolinate synthase  70.31 
 
 		 298 aa  448  1e-125  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1226  dihydrodipicolinate synthase  65.99 
 
 		 297 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  47.06 
 
 		 293 aa  290  2e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 290 aa  279  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 290 aa  279  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 		 290 aa  278  7e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  51.05 
 
 		 292 aa  278  8e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  50.35 
 
 		 292 aa  276  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 292 aa  276  4e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 		 290 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  47.9 
 
 		 292 aa  269  5e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  48.95 
 
 		 292 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 		 290 aa  268  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 290 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  46.39 
 
 		 290 aa  260  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  48.79 
 
 		 291 aa  259  5.0000000000000005e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  46.18 
 
 		 288 aa  258  1e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  49.64 
 
 		 292 aa  257  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  47.43 
 
 		 290 aa  257  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  45.1 
 
 		 291 aa  256  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  45.49 
 
 		 293 aa  249  6e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  45.05 
 
 		 292 aa  248  7e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  45.99 
 
 		 296 aa  248  8e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  44.1 
 
 		 297 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  48.9 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  46.26 
 
 		 296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  45.14 
 
 		 291 aa  242  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  42.81 
 
 		 300 aa  242  6e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  45.91 
 
 		 296 aa  242  6e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  45.91 
 
 		 296 aa  242  7e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 		 292 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  48.16 
 
 		 292 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  47.81 
 
 		 292 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  41.1 
 
 		 294 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  44.21 
 
 		 289 aa  239  4e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  48.16 
 
 		 294 aa  239  5e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  45.14 
 
 		 308 aa  238  6.999999999999999e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3191  dihydrodipicolinate synthase  44.83 
 
 		 297 aa  238  8e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0102406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  43.75 
 
 		 293 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  40.75 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  45.26 
 
 		 300 aa  237  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  41.3 
 
 		 298 aa  238  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 		 290 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  42.52 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  43.69 
 
 		 295 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  43.55 
 
 		 292 aa  236  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  44.1 
 
 		 292 aa  236  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  44.03 
 
 		 295 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  44.29 
 
 		 291 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  44.29 
 
 		 291 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  47.79 
 
 		 292 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  46.38 
 
 		 326 aa  235  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  46.72 
 
 		 300 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 		 301 aa  235  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  45.42 
 
 		 299 aa  235  8e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  46.02 
 
 		 292 aa  234  9e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  46.72 
 
 		 300 aa  234  9e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  46.72 
 
 		 300 aa  234  9e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  44.64 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  45.05 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  43.69 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  48.88 
 
 		 287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  42.71 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  43.75 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1860  dihydrodipicolinate synthase  47.43 
 
 		 293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151494  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  44.98 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  46.35 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  42.46 
 
 		 289 aa  233  3e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  44.25 
 
 		 293 aa  233  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  47.62 
 
 		 300 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  46.89 
 
 		 301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  46.18 
 
 		 291 aa  232  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  44.14 
 
 		 292 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  43.51 
 
 		 289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  43.21 
 
 		 300 aa  232  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  48.53 
 
 		 292 aa  231  9e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  43.79 
 
 		 292 aa  231  9e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  46.53 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  46.53 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  46.53 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  46.53 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  46.53 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  46.53 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  44.64 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  48.53 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  41.87 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  46.53 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  45.77 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  43.94 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>