More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0002 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0002  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  100 
 
 
157 aa  315  1e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.075802  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1822  Holliday junction resolvase  73.25 
 
 
157 aa  244  3e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.21855  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1854  Holliday junction resolvase  74.52 
 
 
157 aa  244  3e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2057  Holliday junction resolvase  75.32 
 
 
157 aa  241  2e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0026  Holliday junction resolvase  71.15 
 
 
160 aa  240  7e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580095  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1897  Holliday junction resolvase  71.15 
 
 
160 aa  239  9e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2104  Holliday junction resolvase  70.51 
 
 
160 aa  238  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1573  Holliday junction resolvase  70.51 
 
 
158 aa  232  1e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1794  Holliday junction resolvase  68.39 
 
 
158 aa  223  7e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.098383  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2104  Holliday junction resolvase  67.31 
 
 
159 aa  221  4e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  44.44 
 
 
171 aa  116  1e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.23238e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  40.4 
 
 
176 aa  114  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  40.51 
 
 
164 aa  114  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  42.76 
 
 
164 aa  114  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  41.83 
 
 
164 aa  114  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.74044e-15 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  43.14 
 
 
164 aa  113  1e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1642  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.91 
 
 
191 aa  112  2e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0543  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.41 
 
 
186 aa  110  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.87 
 
 
163 aa  110  8e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  37.58 
 
 
165 aa  109  1e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2400  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.35 
 
 
191 aa  109  1e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.553379  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.67 
 
 
191 aa  109  1e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3491  Holliday junction resolvase  39.6 
 
 
173 aa  108  2e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  35.03 
 
 
161 aa  108  2e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  38.16 
 
 
180 aa  109  2e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1747  Holliday junction resolvase  37.74 
 
 
170 aa  109  2e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  0.595925 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  38.82 
 
 
180 aa  109  2e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  38.16 
 
 
180 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  38.16 
 
 
180 aa  108  4e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38 
 
 
179 aa  107  7e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0699  Holliday junction resolvase  40 
 
 
194 aa  107  9e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.207762  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0671  Holliday junction resolvase  40 
 
 
194 aa  106  9e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.674635  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0987  Holliday junction resolvase  38 
 
 
166 aa  107  9e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  39.22 
 
 
159 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.83978e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  35.29 
 
 
173 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0539  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.48 
 
 
187 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2324  Holliday junction resolvase  37.33 
 
 
166 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.747333  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 
180 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0476  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.67 
 
 
190 aa  105  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 
275 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 
284 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  36.84 
 
 
183 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.91 
 
 
173 aa  106  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  41.06 
 
 
172 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  8.64662e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1012  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.29 
 
 
185 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.793505  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  37.91 
 
 
182 aa  105  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 
180 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 
180 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  36.84 
 
 
183 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 
180 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.84 
 
 
166 aa  105  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 
180 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.06 
 
 
164 aa  105  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  36.31 
 
 
162 aa  104  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  36.18 
 
 
180 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  36.18 
 
 
180 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  38 
 
 
183 aa  103  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0951  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.64 
 
 
185 aa  103  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  36.84 
 
 
180 aa  103  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  36.18 
 
 
180 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.59 
 
 
165 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0497  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.67 
 
 
187 aa  103  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.655461  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1009  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.64 
 
 
185 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  40.38 
 
 
181 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  36.18 
 
 
180 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0930  Holliday junction resolvase  38.71 
 
 
182 aa  101  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0164  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.33 
 
 
192 aa  101  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  39.22 
 
 
181 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  38.96 
 
 
181 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  39.74 
 
 
174 aa  100  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  40.52 
 
 
161 aa  100  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  36.77 
 
 
182 aa  100  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  39.1 
 
 
181 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.19 
 
 
183 aa  100  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0138  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.64 
 
 
174 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  39.22 
 
 
181 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1706  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.64 
 
 
175 aa  99  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0826466  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  32.69 
 
 
162 aa  99  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.06 
 
 
167 aa  99  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  37.11 
 
 
186 aa  98.2  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  37.75 
 
 
174 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1651  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.03 
 
 
157 aa  98.6  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  33.11 
 
 
156 aa  98.6  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2240  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.09 
 
 
182 aa  98.2  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  36.48 
 
 
186 aa  97.8  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  37.33 
 
 
200 aa  97.8  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.44 
 
 
164 aa  97.4  6e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3202  Holliday junction resolvase  37.25 
 
 
197 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0673445 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1433  Holliday junction resolvase  37.18 
 
 
194 aa  97.1  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  36.42 
 
 
174 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  31.21 
 
 
164 aa  95.9  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  36.42 
 
 
174 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  4.86306e-05 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0008  Holliday junction endonuclease RuvC  38.31 
 
 
156 aa  95.1  3e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2236  Crossover junction endodeoxyribonuclease  37.88 
 
 
179 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0833  Holliday junction resolvase  35.48 
 
 
182 aa  95.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  38.22 
 
 
180 aa  95.5  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  36.13 
 
 
182 aa  95.1  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  35.29 
 
 
184 aa  94.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11601  Holliday junction resolvase  35.33 
 
 
157 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  33.78 
 
 
173 aa  94.7  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>