52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2010 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_1656  glucan 1,4-alpha-glucosidase  58.48 
 
 
817 aa  952  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.159035  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4086  glucan 1,4-alpha-glucosidase  49.81 
 
 
777 aa  727  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1869  glucan 1,4-alpha-glucosidase  80.09 
 
 
838 aa  1388  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2109  glucan 1,4-alpha-glucosidase  79.98 
 
 
838 aa  1368  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.185275 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1775  glucan 1,4-alpha-glucosidase  68.65 
 
 
820 aa  1171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.039992  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1924  glucan 1,4-alpha-glucosidase  81.36 
 
 
837 aa  1406  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2453  glucan 1,4-alpha-glucosidase  98.83 
 
 
858 aa  1754  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2337  glucan 1,4-alpha-glucosidase  98.83 
 
 
858 aa  1754  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2348  glucan 1,4-alpha-glucosidase  98.27 
 
 
430 aa  814  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2349  glucan 1,4-alpha-glucosidase  96.54 
 
 
433 aa  876  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1873  glucan 1,4-alpha-glucosidase  66.71 
 
 
833 aa  1136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  6.7547e-05  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3146  glucan 1,4-alpha-glucosidase  51.46 
 
 
808 aa  793  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26980  glucan 1,4-alpha-glucosidase  54.04 
 
 
821 aa  844  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2004  glucan 1,4-alpha-glucosidase  67.1 
 
 
841 aa  1140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0600  glucan 1,4-alpha-glucosidase  54.1 
 
 
803 aa  856  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.698783 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2201  glucan 1,4-alpha-glucosidase  64.41 
 
 
840 aa  1108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.402848  decreased coverage  7.36169e-07 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2973  glucan 1,4-alpha-glucosidase  51.46 
 
 
808 aa  793  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2459  glucoamylase  78.12 
 
 
847 aa  1382  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4198  glucan 1,4-alpha-glucosidase  53.18 
 
 
860 aa  824  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.116621 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2010  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  100 
 
 
858 aa  1774  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00769756  hitchhiker  0.000340276 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2807  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.25 
 
 
814 aa  343  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3431  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.38 
 
 
715 aa  341  3e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37344  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.7 
 
 
801 aa  328  2e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2108  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.32 
 
 
692 aa  317  5e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2482  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.32 
 
 
681 aa  317  6e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40631  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  34.17 
 
 
1160 aa  316  1e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2590  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.82 
 
 
802 aa  315  2e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.767497  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3494  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.82 
 
 
803 aa  315  3e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0213  glucan 1,4- a-glucosidase  31.65 
 
 
881 aa  310  9e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1658  putative amylase  31.81 
 
 
881 aa  299  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0200  putative glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.81 
 
 
882 aa  299  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0289  glycosy hydrolase family protein  31.33 
 
 
882 aa  299  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0995  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.16 
 
 
800 aa  298  4e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.42 
 
 
1505 aa  270  6e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1503  glycoside hydrolase 15-related  28.26 
 
 
1592 aa  265  4e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.547945 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0098  putative glucoamylase precursor  29.03 
 
 
835 aa  249  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.519208 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.38 
 
 
761 aa  248  4e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7156  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.15 
 
 
1132 aa  234  4e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0725  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.39 
 
 
798 aa  225  3e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.928559 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1878  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.75 
 
 
786 aa  190  9e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2224  glycosyl hydrolase, family 15  24.75 
 
 
786 aa  190  9e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  27.97 
 
 
670 aa  78.2  6e-13  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  27.2 
 
 
615 aa  70.9  1e-10  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  26.05 
 
 
645 aa  64.7  8e-09  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1503  glycoside hydrolase 15-related  25.08 
 
 
649 aa  64.3  9e-09  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.227839  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  23.38 
 
 
647 aa  61.2  7e-08  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.15 
 
 
569 aa  54.7  7e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  22.58 
 
 
615 aa  52.8  3e-05  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0134624 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  25.11 
 
 
668 aa  52  4e-05  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  24.69 
 
 
663 aa  48.1  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1968  glycoside hydrolase 15-related protein  21.06 
 
 
622 aa  45.8  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  21.72 
 
 
644 aa  45.1  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>