More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3970 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1934  phage integrase  100 
 
 		 388 aa  797    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3803  phage integrase family protein  100 
 
 		 388 aa  797    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704516  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3970  phage integrase family protein  100 
 
 		 388 aa  797    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  37.09 
 
 		 373 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  35.23 
 
 		 364 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  35.23 
 
 		 364 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  35.01 
 
 		 395 aa  176  7e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  34.62 
 
 		 367 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  32.11 
 
 		 361 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  34.37 
 
 		 344 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  31.2 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  31.2 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  31.2 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  31.2 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  31.2 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  31.2 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  31.2 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3734  phage integrase-like SAM-like  34.73 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  34.19 
 
 		 312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1466  Tn554-related, transposase A  26.69 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000354684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3147  Tn554-related, transposase A  27 
 
 		 372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85236  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0986  Tn554-related, transposase A  23.98 
 
 		 384 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061254  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5935  phage integrase family protein  28.03 
 
 		 393 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3904  phage integrase family protein  28.03 
 
 		 393 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3896  phage integrase family protein  28.03 
 
 		 393 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0478  phage integrase family protein  28.03 
 
 		 393 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0242  Tn554-related, transposase A  29.64 
 
 		 519 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3698  integrase family protein  26.05 
 
 		 393 aa  93.2  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0843425  normal  0.150744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3044  integrase family protein  26.05 
 
 		 393 aa  93.2  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169579  hitchhiker  0.00511814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1215  integrase family protein  26.05 
 
 		 393 aa  93.2  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0266422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3585  integrase family protein  26.05 
 
 		 393 aa  93.2  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0961554  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3740  integrase family protein  26.05 
 
 		 393 aa  93.2  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3469  integrase family protein  26.05 
 
 		 393 aa  93.2  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00208728  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3603  integrase family protein  26.05 
 
 		 393 aa  93.2  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185249  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1426  phage integrase family protein  26.04 
 
 		 401 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5398  phage integrase family protein  25.67 
 
 		 399 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5418  phage integrase family protein  25.67 
 
 		 399 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0512  phage integrase family protein  25.67 
 
 		 399 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0067  integrase family protein  22.85 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.952097  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  24.79 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  29.08 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0787  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like protein  25.81 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00453269  unclonable  0.000000000000100471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5497  phage integrase family protein  24.86 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052501 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0455  phage integrase family protein  24.86 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3589  phage integrase family protein  24.86 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127182 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  26.06 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  26.23 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1703  phage integrase  34.38 
 
 		 285 aa  68.9  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  31.43 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0666  Phage integrase, N-terminal SAM- like  31.14 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.555034  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.16 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  34.55 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.88 
 
 		 345 aa  67  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.66 
 
 		 325 aa  67  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  33.66 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  33.16 
 
 		 363 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  30.88 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  28.44 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  29.95 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.52 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.01 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1247  Phage integrase  30.54 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  30.85 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  30.73 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  31.4 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  24.69 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  24.64 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2723  integrase family protein  29.11 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  26.08 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  29.47 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0238  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.36 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0625179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  29.76 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  26.79 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.62 
 
 		 324 aa  62.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  29.36 
 
 		 295 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  25.75 
 
 		 313 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  34.18 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  24.93 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.98 
 
 		 329 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  28 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  29.52 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.69 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.61 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3706  integrase family protein  28.29 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000354013  normal  0.710204 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  33.12 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2522  integrase family protein  28.29 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000359584  hitchhiker  0.00166754 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2544  tyrosine recombinase XerC  28.11 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774585  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  29.11 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  30.43 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  27.64 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1237  integrase family protein  28.29 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  30.23 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5002  hypothtical protein  27.62 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  hitchhiker  0.0000000255834 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3960  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.52 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5613  hypothetical protein  27.55 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  30.91 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.26 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  30.88 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>