More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1097 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  100 
 
 		 568 aa  1127    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  60.11 
 
 		 554 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  60.41 
 
 		 565 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  42.08 
 
 		 548 aa  414  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  41.29 
 
 		 556 aa  409  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  42.65 
 
 		 560 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  42.65 
 
 		 565 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  38.32 
 
 		 619 aa  392  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  44.97 
 
 		 553 aa  391  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  40.3 
 
 		 546 aa  386  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  39.75 
 
 		 557 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  38.24 
 
 		 550 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  39.71 
 
 		 553 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  38.46 
 
 		 552 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  41.35 
 
 		 543 aa  338  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  42.71 
 
 		 532 aa  325  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  37.61 
 
 		 540 aa  308  1.0000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  38.6 
 
 		 530 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  35.26 
 
 		 544 aa  302  9e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  39.26 
 
 		 556 aa  301  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  36.23 
 
 		 583 aa  294  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  43.63 
 
 		 536 aa  293  8e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  38.34 
 
 		 543 aa  290  7e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  44.05 
 
 		 536 aa  280  7e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  34.51 
 
 		 556 aa  277  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  40.66 
 
 		 544 aa  273  8.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  38.35 
 
 		 579 aa  271  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  39.75 
 
 		 522 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  35.66 
 
 		 527 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  43.33 
 
 		 532 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  44.12 
 
 		 532 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  31.36 
 
 		 539 aa  253  5.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  36.36 
 
 		 542 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  31.87 
 
 		 522 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  31.95 
 
 		 522 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  35.31 
 
 		 535 aa  234  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  31.44 
 
 		 569 aa  234  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  30.98 
 
 		 522 aa  233  6e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  31.24 
 
 		 563 aa  233  7.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  31.87 
 
 		 520 aa  232  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  36.31 
 
 		 553 aa  232  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  31.25 
 
 		 522 aa  233  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  31.26 
 
 		 522 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  31.26 
 
 		 522 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  29.88 
 
 		 533 aa  232  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  31.46 
 
 		 522 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  31.25 
 
 		 522 aa  230  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04180  conserved hypothetical protein  32.68 
 
 		 589 aa  228  3e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  33.99 
 
 		 537 aa  227  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  30.5 
 
 		 522 aa  226  7e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  30.8 
 
 		 522 aa  226  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  36.27 
 
 		 544 aa  225  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  29.76 
 
 		 574 aa  224  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  36.07 
 
 		 549 aa  224  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  33.67 
 
 		 537 aa  223  8e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  31.72 
 
 		 544 aa  215  9.999999999999999e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  34.27 
 
 		 538 aa  213  5.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  34.51 
 
 		 548 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  34.51 
 
 		 548 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  34.51 
 
 		 548 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  35.39 
 
 		 545 aa  213  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  36.12 
 
 		 537 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  34.13 
 
 		 541 aa  212  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  33.2 
 
 		 552 aa  207  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  36.74 
 
 		 501 aa  205  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.309934 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  31.15 
 
 		 541 aa  203  5e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  26.36 
 
 		 526 aa  204  5e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  30.36 
 
 		 545 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  32.71 
 
 		 485 aa  202  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  32.53 
 
 		 542 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  31.11 
 
 		 543 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  32.2 
 
 		 541 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  30.06 
 
 		 581 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  31.92 
 
 		 540 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  30.33 
 
 		 543 aa  196  7e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  30.23 
 
 		 585 aa  195  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  32.31 
 
 		 546 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  26.51 
 
 		 563 aa  191  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  31.66 
 
 		 581 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  33.2 
 
 		 548 aa  189  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  28.07 
 
 		 520 aa  189  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  34.23 
 
 		 539 aa  186  8e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.83 
 
 		 542 aa  186  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0778  amidohydrolase 3  32.06 
 
 		 499 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.674672  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  29.72 
 
 		 573 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 548 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  30.67 
 
 		 549 aa  184  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  26.37 
 
 		 522 aa  182  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  27.59 
 
 		 539 aa  181  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  30.71 
 
 		 562 aa  180  5.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  31.99 
 
 		 538 aa  179  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  31.86 
 
 		 556 aa  177  6e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  28.18 
 
 		 565 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  30.42 
 
 		 549 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  29.88 
 
 		 547 aa  174  3.9999999999999995e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3750  Amidohydrolase 3  35.73 
 
 		 505 aa  173  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  30.12 
 
 		 573 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3662  Amidohydrolase 3  33.62 
 
 		 536 aa  172  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.565379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  27.18 
 
 		 558 aa  172  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  33.27 
 
 		 543 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>