More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4557 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  100 
 
 
420 aa  848    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  49.39 
 
 
423 aa  386  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  44.36 
 
 
421 aa  338  8e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  43.35 
 
 
408 aa  296  6e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  40.49 
 
 
422 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  42.52 
 
 
426 aa  285  9e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  40.59 
 
 
411 aa  265  8.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  39.52 
 
 
410 aa  264  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  39.6 
 
 
412 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  38.79 
 
 
412 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  39.09 
 
 
400 aa  255  9e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  41.29 
 
 
418 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  36.39 
 
 
419 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  39.66 
 
 
411 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  34.66 
 
 
411 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  37.13 
 
 
405 aa  246  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  33.67 
 
 
411 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  34.41 
 
 
411 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  34.41 
 
 
411 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  34.41 
 
 
411 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  34.49 
 
 
411 aa  243  5e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  34.66 
 
 
411 aa  243  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  33.92 
 
 
411 aa  242  7e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  34.41 
 
 
411 aa  243  7e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3894  cytochrome P450  41.69 
 
 
403 aa  242  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  37.19 
 
 
398 aa  242  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  33.92 
 
 
411 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  35.25 
 
 
411 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  42 
 
 
406 aa  239  5.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  39.12 
 
 
417 aa  239  9e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  38.27 
 
 
395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  39.2 
 
 
400 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  39.11 
 
 
404 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  38.26 
 
 
402 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  36.52 
 
 
398 aa  231  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  35.5 
 
 
402 aa  230  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  32.92 
 
 
420 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  38.06 
 
 
459 aa  224  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6983  cytochrome P450-family protein  36.61 
 
 
416 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  37.77 
 
 
401 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  35.09 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  37.84 
 
 
399 aa  220  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  36.78 
 
 
398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  37.29 
 
 
402 aa  219  8.999999999999998e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2116  cytochrome P450  39.11 
 
 
389 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  38.24 
 
 
414 aa  217  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  37.22 
 
 
394 aa  217  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  37.34 
 
 
399 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  36.98 
 
 
414 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  38.08 
 
 
399 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  37.4 
 
 
399 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  34.71 
 
 
399 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  35.31 
 
 
396 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  37.14 
 
 
388 aa  210  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  34.72 
 
 
391 aa  210  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  37.44 
 
 
400 aa  210  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  35.71 
 
 
402 aa  209  8e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  34.56 
 
 
409 aa  209  9e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  36.43 
 
 
400 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  38.93 
 
 
398 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  37.16 
 
 
405 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  37.25 
 
 
410 aa  206  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  36.12 
 
 
406 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  36.12 
 
 
406 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  36.12 
 
 
406 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  35.48 
 
 
410 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  33.66 
 
 
401 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  35.45 
 
 
407 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  35.45 
 
 
407 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  35.52 
 
 
405 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  33.25 
 
 
407 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  37.57 
 
 
423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  37.41 
 
 
411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  35.71 
 
 
408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  34.75 
 
 
409 aa  199  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2724  cytochrome P450  34.99 
 
 
409 aa  199  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118546  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  35.98 
 
 
406 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  35.68 
 
 
400 aa  199  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  36.21 
 
 
408 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3533  cytochrome P450  36.14 
 
 
432 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173576  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  35.06 
 
 
408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  34.92 
 
 
397 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  33.25 
 
 
405 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  35.58 
 
 
443 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  34.17 
 
 
408 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  41.36 
 
 
367 aa  196  6e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  33.75 
 
 
412 aa  196  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  34.51 
 
 
393 aa  196  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  35.71 
 
 
436 aa  196  9e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  34.66 
 
 
417 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2750  cytochrome P450  34.95 
 
 
416 aa  195  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  33.58 
 
 
407 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  35.22 
 
 
400 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  34.41 
 
 
401 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  35.82 
 
 
409 aa  192  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4185  cytochrome P450  35.29 
 
 
412 aa  192  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059363  normal  0.410694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4485  cytochrome P450  34.83 
 
 
421 aa  192  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  0.78931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  34.54 
 
 
407 aa  192  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  36.16 
 
 
436 aa  192  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1432  cytochrome P450  35.05 
 
 
408 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.675359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>