More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3132 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  100 
 
 		 565 aa  1144    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  54.22 
 
 		 546 aa  574  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  51.93 
 
 		 552 aa  553  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  51.8 
 
 		 548 aa  549  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  51.18 
 
 		 556 aa  547  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  51.88 
 
 		 619 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  49.91 
 
 		 553 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  47.62 
 
 		 550 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  47.36 
 
 		 557 aa  496  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  47.48 
 
 		 560 aa  494  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  48.95 
 
 		 553 aa  456  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  43.89 
 
 		 543 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  41.27 
 
 		 540 aa  392  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  43.07 
 
 		 568 aa  381  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  44.57 
 
 		 554 aa  375  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  38.5 
 
 		 544 aa  369  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  45.76 
 
 		 565 aa  365  2e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  45.07 
 
 		 536 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  39.53 
 
 		 532 aa  317  3e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  45.49 
 
 		 536 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  39.04 
 
 		 579 aa  312  1e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  38.86 
 
 		 530 aa  307  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  40.5 
 
 		 527 aa  306  6e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  37.86 
 
 		 583 aa  306  8.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  39.54 
 
 		 522 aa  303  6.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  34.81 
 
 		 563 aa  302  1e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  37.91 
 
 		 556 aa  301  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  44.58 
 
 		 532 aa  292  9e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  43.07 
 
 		 532 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  37.73 
 
 		 556 aa  283  6.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  35.91 
 
 		 543 aa  283  8.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  38.61 
 
 		 544 aa  280  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  36.87 
 
 		 569 aa  279  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  37.4 
 
 		 553 aa  259  7e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04180  conserved hypothetical protein  34.15 
 
 		 589 aa  259  1e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  32.94 
 
 		 533 aa  259  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  30.5 
 
 		 539 aa  251  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  32.78 
 
 		 522 aa  246  8e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  31.09 
 
 		 522 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  31.27 
 
 		 522 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  31.08 
 
 		 522 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  31.08 
 
 		 522 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  34.62 
 
 		 535 aa  242  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  32.36 
 
 		 522 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  35.16 
 
 		 537 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  31.21 
 
 		 520 aa  240  5e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  33.27 
 
 		 542 aa  239  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  32.21 
 
 		 522 aa  239  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  31.25 
 
 		 522 aa  239  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  31.39 
 
 		 522 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  30.96 
 
 		 522 aa  232  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  29.96 
 
 		 574 aa  229  9e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  34.94 
 
 		 542 aa  227  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  33.6 
 
 		 573 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  32.87 
 
 		 485 aa  219  1e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  29.9 
 
 		 539 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  34.65 
 
 		 544 aa  217  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  31.02 
 
 		 537 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  33.53 
 
 		 541 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  32.85 
 
 		 548 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  28.75 
 
 		 526 aa  214  3.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  33.58 
 
 		 538 aa  213  5.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  33.27 
 
 		 601 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  33.4 
 
 		 564 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  32.43 
 
 		 541 aa  209  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  31.54 
 
 		 565 aa  208  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  31.84 
 
 		 543 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  32.9 
 
 		 540 aa  204  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  31.35 
 
 		 546 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  29.38 
 
 		 520 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  32.88 
 
 		 620 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  30.82 
 
 		 585 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  33.4 
 
 		 548 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  33.4 
 
 		 548 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  33.4 
 
 		 548 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  34.61 
 
 		 545 aa  201  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  32.34 
 
 		 583 aa  200  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  32.66 
 
 		 549 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  32.34 
 
 		 583 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  30.71 
 
 		 596 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  31.59 
 
 		 538 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  30.06 
 
 		 616 aa  198  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.29 
 
 		 544 aa  196  7e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  31.03 
 
 		 548 aa  196  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  30.36 
 
 		 549 aa  196  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  31.52 
 
 		 552 aa  195  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1652  Amidohydrolase 3  37.91 
 
 		 477 aa  195  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.31 
 
 		 542 aa  195  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  31.15 
 
 		 543 aa  193  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  36.42 
 
 		 501 aa  193  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  30.06 
 
 		 564 aa  193  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2467  Amidohydrolase 3  35.73 
 
 		 475 aa  192  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  30.66 
 
 		 582 aa  191  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  31.85 
 
 		 569 aa  190  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  30.85 
 
 		 547 aa  189  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  30.58 
 
 		 545 aa  189  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  31.92 
 
 		 541 aa  188  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  30.04 
 
 		 543 aa  188  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  31.3 
 
 		 569 aa  188  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  29.95 
 
 		 608 aa  188  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>