More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2872 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2872  PfkB  100 
 
 		 332 aa  653    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  65.64 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  52.94 
 
 		 335 aa  338  9e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  49.85 
 
 		 342 aa  325  5e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  53.75 
 
 		 333 aa  322  4e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  51.84 
 
 		 331 aa  320  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  53.12 
 
 		 328 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  50.47 
 
 		 330 aa  318  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  50.47 
 
 		 330 aa  318  1e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  52.32 
 
 		 333 aa  317  2e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  49.24 
 
 		 338 aa  315  5e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  51.35 
 
 		 337 aa  315  5e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  52.28 
 
 		 329 aa  315  7e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  50 
 
 		 333 aa  311  6.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  46.88 
 
 		 330 aa  309  5e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  49.04 
 
 		 330 aa  308  6.999999999999999e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  47.37 
 
 		 330 aa  307  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  53.4 
 
 		 338 aa  307  1.0000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  50.62 
 
 		 333 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  48.45 
 
 		 331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  51.23 
 
 		 331 aa  306  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  51.83 
 
 		 407 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  50.16 
 
 		 333 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  50.16 
 
 		 333 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  48.42 
 
 		 348 aa  301  7.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  49.38 
 
 		 333 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  49.23 
 
 		 337 aa  299  5e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  49.23 
 
 		 337 aa  299  5e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  48.59 
 
 		 330 aa  298  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  50.15 
 
 		 337 aa  298  7e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  48.37 
 
 		 337 aa  298  9e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  49.54 
 
 		 337 aa  296  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  49.23 
 
 		 333 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  48.59 
 
 		 330 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  49.38 
 
 		 333 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  44.95 
 
 		 335 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  52.06 
 
 		 330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  53.05 
 
 		 333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  45.45 
 
 		 335 aa  281  8.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  50.15 
 
 		 330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  49.85 
 
 		 330 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  50.78 
 
 		 330 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  46.95 
 
 		 338 aa  268  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  38.49 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  44.75 
 
 		 330 aa  259  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  38.87 
 
 		 333 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  45.92 
 
 		 333 aa  256  5e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  38.01 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  38.56 
 
 		 333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  42.41 
 
 		 331 aa  243  5e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  39.51 
 
 		 335 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  36.09 
 
 		 370 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  38.07 
 
 		 328 aa  189  5e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  34.69 
 
 		 327 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  34.69 
 
 		 327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  34.49 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  31.71 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  32.42 
 
 		 336 aa  169  8e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  31.78 
 
 		 339 aa  163  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  33.23 
 
 		 328 aa  160  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  31.2 
 
 		 339 aa  157  4e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  30.09 
 
 		 341 aa  155  7e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  34.19 
 
 		 328 aa  150  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  35.2 
 
 		 360 aa  146  5e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  34.28 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 320 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  33.33 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  35.27 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_002936  DET0711  carbohydrate kinase  27.27 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0646  ribokinase-like domain-containing protein  27.64 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_618  sugar kinase ribokinase  27.43 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  31.89 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  31.87 
 
 		 273 aa  94  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  32.84 
 
 		 329 aa  93.6  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  33.46 
 
 		 303 aa  92.4  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  29.17 
 
 		 309 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  32.72 
 
 		 304 aa  90.5  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  31.46 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  27.14 
 
 		 347 aa  90.1  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  30.95 
 
 		 303 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  31.82 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02272  adenosine kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06390)  25.8 
 
 		 352 aa  87  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0154807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  33.19 
 
 		 308 aa  86.3  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  28.37 
 
 		 297 aa  85.9  9e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  28.49 
 
 		 645 aa  85.9  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  30.34 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  28.79 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  32.02 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  31.3 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  28.09 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  26.41 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  31.3 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  25.83 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  31.82 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  30.97 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  31.91 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  29.32 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  29.97 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  33.66 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  28.14 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>