More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0271 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0271  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 		 430 aa  845    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.523157  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  49.42 
 
 		 435 aa  433  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  49.88 
 
 		 435 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  48.72 
 
 		 435 aa  430  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  49.88 
 
 		 435 aa  430  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  49.42 
 
 		 435 aa  425  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  48.96 
 
 		 437 aa  423  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  47.06 
 
 		 437 aa  421  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  46.74 
 
 		 437 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  48.27 
 
 		 435 aa  413  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  48.26 
 
 		 435 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  48.14 
 
 		 435 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  47.74 
 
 		 437 aa  408  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0285  preprotein translocase subunit SecY  49.88 
 
 		 430 aa  408  1.0000000000000001e-112  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000550268  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  47.91 
 
 		 445 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  48.72 
 
 		 442 aa  403  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  49.41 
 
 		 443 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  47.65 
 
 		 437 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  45.24 
 
 		 437 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  49.41 
 
 		 443 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  48.04 
 
 		 448 aa  396  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  48.36 
 
 		 447 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  46.37 
 
 		 429 aa  395  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  49.05 
 
 		 441 aa  393  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  48.12 
 
 		 447 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  49.17 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  48 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  48.82 
 
 		 437 aa  391  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  47.33 
 
 		 420 aa  391  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  48.11 
 
 		 443 aa  385  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  47.65 
 
 		 447 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0343  preprotein translocase, SecY subunit  47.41 
 
 		 444 aa  386  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  46.81 
 
 		 443 aa  382  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  48 
 
 		 446 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  47.39 
 
 		 440 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  48.84 
 
 		 431 aa  381  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2045  preprotein translocase, SecY subunit  46.87 
 
 		 435 aa  378  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000027617  hitchhiker  0.00154147 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  46.9 
 
 		 437 aa  378  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1042  preprotein translocase subunit SecY  47.54 
 
 		 439 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  47.42 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  47.64 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0621  preprotein translocase subunit SecY  47.67 
 
 		 439 aa  378  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  46.57 
 
 		 444 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0838  preprotein translocase subunit SecY  49.41 
 
 		 434 aa  377  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  47.56 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0401  preprotein translocase subunit SecY  47.78 
 
 		 439 aa  376  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0393  preprotein translocase subunit SecY  47.78 
 
 		 439 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0413341  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2305  preprotein translocase subunit SecY  48.46 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325321  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4223  preprotein translocase subunit SecY  47.54 
 
 		 436 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0505149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0979  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.73 
 
 		 447 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000479753  hitchhiker  0.00549319 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  47.19 
 
 		 446 aa  375  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  47.27 
 
 		 443 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  46.23 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  45.99 
 
 		 443 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  45.99 
 
 		 444 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  47.64 
 
 		 444 aa  373  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  45.99 
 
 		 444 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  45.75 
 
 		 442 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  45.99 
 
 		 443 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  47.28 
 
 		 443 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0299  preprotein translocase subunit SecY  47.88 
 
 		 440 aa  373  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631755  hitchhiker  0.00000321163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  46.23 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2305  preprotein translocase subunit SecY  47.04 
 
 		 437 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  45.52 
 
 		 442 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  45.28 
 
 		 442 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  45.28 
 
 		 442 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  47.26 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  46.81 
 
 		 443 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  47.03 
 
 		 444 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  46.57 
 
 		 442 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  48 
 
 		 442 aa  370  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  46.95 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  45.75 
 
 		 443 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  46.82 
 
 		 434 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0078  preprotein translocase subunit SecY  47.84 
 
 		 420 aa  369  1e-101  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3423  preprotein translocase subunit SecY  47.17 
 
 		 436 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.23916 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  46.46 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  45.75 
 
 		 446 aa  365  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  47.86 
 
 		 447 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0495  preprotein translocase subunit SecY  45.84 
 
 		 439 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  46.24 
 
 		 445 aa  368  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  45.97 
 
 		 446 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  45.97 
 
 		 446 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  42.73 
 
 		 463 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3929  preprotein translocase subunit SecY  46.19 
 
 		 436 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  47.22 
 
 		 419 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2149  preprotein translocase, SecY subunit  47.39 
 
 		 448 aa  365  1e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0576412  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  45.65 
 
 		 446 aa  363  2e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  45.41 
 
 		 446 aa  364  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04500  preprotein translocase subunit SecY  44.99 
 
 		 454 aa  364  2e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.705639  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001722  preprotein translocase SecY subunit  45.77 
 
 		 444 aa  363  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000228975  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0340  preprotein translocase subunit SecY  45.35 
 
 		 435 aa  364  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670272  hitchhiker  0.000594925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2930  preprotein translocase subunit SecY  47.56 
 
 		 440 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000799077 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0509  preprotein translocase subunit SecY  45.56 
 
 		 443 aa  363  3e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0470282  hitchhiker  0.00397274 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  46.24 
 
 		 443 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1949  preprotein translocase, SecY subunit  47.12 
 
 		 420 aa  363  4e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3277  preprotein translocase subunit SecY  47.56 
 
 		 440 aa  363  4e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.821024  hitchhiker  0.000244814 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  47.22 
 
 		 421 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0103  preprotein translocase subunit SecY  48.2 
 
 		 421 aa  362  5.0000000000000005e-99  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2062  preprotein translocase subunit SecY  46.52 
 
 		 421 aa  362  5.0000000000000005e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>