More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0285 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0285  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 430 aa  858    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000550268  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  46.67 
 
 		 437 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  48.2 
 
 		 437 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  45.65 
 
 		 437 aa  420  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0271  preprotein translocase, SecY subunit  49.88 
 
 		 430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.523157  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  46.34 
 
 		 435 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  45.79 
 
 		 435 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  45.09 
 
 		 435 aa  395  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  45.41 
 
 		 437 aa  396  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  45.33 
 
 		 435 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1735  preprotein translocase subunit SecY  47.03 
 
 		 452 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  44.24 
 
 		 437 aa  391  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  44.63 
 
 		 435 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0381  preprotein translocase subunit SecY  47.03 
 
 		 452 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  45.75 
 
 		 448 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  44.68 
 
 		 435 aa  388  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  44.15 
 
 		 437 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  46.82 
 
 		 445 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  45.09 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2045  preprotein translocase, SecY subunit  44.71 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000027617  hitchhiker  0.00154147 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  46.08 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  43.87 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  46.12 
 
 		 447 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  43.53 
 
 		 443 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  43.53 
 
 		 443 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.6 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  46.12 
 
 		 447 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  45.48 
 
 		 442 aa  376  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  46.12 
 
 		 448 aa  378  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  45.15 
 
 		 446 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2514  preprotein translocase subunit SecY  47.27 
 
 		 452 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  45.41 
 
 		 447 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  42.92 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  44.66 
 
 		 453 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  45.83 
 
 		 449 aa  375  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  45.84 
 
 		 457 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  42.66 
 
 		 445 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  45.58 
 
 		 419 aa  371  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  43.33 
 
 		 441 aa  365  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  44.92 
 
 		 446 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  45.13 
 
 		 444 aa  368  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  44.63 
 
 		 448 aa  367  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  43.12 
 
 		 420 aa  368  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  44.21 
 
 		 446 aa  365  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  43.74 
 
 		 446 aa  365  1e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  43.13 
 
 		 443 aa  365  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  43.46 
 
 		 443 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  43.46 
 
 		 443 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  43.12 
 
 		 445 aa  363  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  43.22 
 
 		 444 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  43.22 
 
 		 444 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  42.18 
 
 		 440 aa  363  3e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  43.5 
 
 		 446 aa  363  3e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  43.46 
 
 		 443 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  42.65 
 
 		 443 aa  363  4e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  43.97 
 
 		 443 aa  363  4e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  44.68 
 
 		 447 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  43.22 
 
 		 443 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  42.99 
 
 		 442 aa  360  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  42.99 
 
 		 442 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  42.99 
 
 		 442 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  42.17 
 
 		 443 aa  359  5e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  43.59 
 
 		 447 aa  359  5e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  43.59 
 
 		 447 aa  359  5e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  42.99 
 
 		 442 aa  358  7e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  45.86 
 
 		 446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  43.09 
 
 		 444 aa  356  5e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  43.74 
 
 		 434 aa  355  6.999999999999999e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0275  preprotein translocase subunit SecY  43.84 
 
 		 454 aa  355  6.999999999999999e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0794912  normal  0.75706 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  42.35 
 
 		 443 aa  355  7.999999999999999e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  45.39 
 
 		 446 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  42.62 
 
 		 443 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  43.36 
 
 		 447 aa  354  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  43.82 
 
 		 424 aa  354  2e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  42.11 
 
 		 443 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  43.09 
 
 		 443 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  42.62 
 
 		 443 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  42.86 
 
 		 437 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  41.43 
 
 		 441 aa  352  8e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  43.72 
 
 		 421 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  42.26 
 
 		 443 aa  350  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  44.08 
 
 		 431 aa  350  3e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  42.19 
 
 		 419 aa  348  7e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  42.39 
 
 		 443 aa  348  8e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  41.81 
 
 		 440 aa  348  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  43.19 
 
 		 448 aa  347  3e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0201  preprotein translocase subunit SecY  41.96 
 
 		 443 aa  346  4e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.124191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  40.92 
 
 		 463 aa  346  4e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  43.26 
 
 		 419 aa  346  5e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  41.27 
 
 		 442 aa  345  6e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4256  preprotein translocase subunit SecY  42.45 
 
 		 443 aa  346  6e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193642  unclonable  0.00000000000448849 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  41.57 
 
 		 443 aa  345  7e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0219  preprotein translocase subunit SecY  42.69 
 
 		 446 aa  345  7e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000744124  unclonable  0.0000000000304117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0214  preprotein translocase subunit SecY  42.69 
 
 		 446 aa  345  7e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  hitchhiker  0.00772115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  42.69 
 
 		 446 aa  345  7e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000110874  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0621  preprotein translocase subunit SecY  42.75 
 
 		 439 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0979  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  41.08 
 
 		 447 aa  344  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000479753  hitchhiker  0.00549319 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  42.22 
 
 		 446 aa  344  2e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  41.27 
 
 		 437 aa  344  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080  preprotein translocase subunit SecY  42.76 
 
 		 441 aa  344  2e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0404503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>