More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_A0172 on replicon NC_004349
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004349  SO_A0172  resolvase family site-specific recombinase  100 
 
 		 208 aa  426  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2368  Resolvase domain protein  54.12 
 
 		 223 aa  211  7.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  decreased coverage  0.00000000117936 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2327  Resolvase domain  41.41 
 
 		 217 aa  164  9e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3410  Resolvase domain protein  40.2 
 
 		 206 aa  156  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08249  site-specific recombinase  61.95 
 
 		 135 aa  152  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0864  multiple promoter invertase  40.21 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186706 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3142  resolvase-like protein  40.82 
 
 		 203 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1950  multiple promoter invertase  40.62 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202011  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a031  site-specific recombinase/resolvase  37.31 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0141681  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4198  resolvase domain-containing protein  37.63 
 
 		 205 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163134 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  33.17 
 
 		 204 aa  104  8e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a003  site-specific recombinase/resolvase  27.41 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000421132  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0013  DNA integration/recombination/inversion protein  51.16 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.52034  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2852  resolvase domain-containing protein  43.75 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.049445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  30.92 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  32.78 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0523  resolvase-like protein  32.92 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  30.39 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  33.16 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  31.76 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  35.48 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2960  DNA resolvase  31.53 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000168825  unclonable  0.00000591562 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  29.17 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  30.21 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  30.39 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  30.85 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  30.85 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  27.6 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  32.4 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  27.08 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  27.08 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  31.02 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  30.17 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  30.17 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  29.38 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  29.83 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  30.92 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1181  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0644392 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  29.61 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  28.72 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  30 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  27.27 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1967  resolvase domain-containing protein  33.11 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  27.08 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  31.28 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  27.13 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  28.19 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  27.27 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  29.8 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  32.89 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  32.45 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  30.16 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  26.56 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0445  resolvase/integrase-like protein  29.47 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.65944  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  33.56 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4796  resolvase domain-containing protein  31.79 
 
 		 310 aa  61.6  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  29 
 
 		 187 aa  62  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  27.37 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  31.79 
 
 		 313 aa  61.6  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  29.02 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  30.32 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  30.67 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  28.06 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  27.54 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  29.9 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2180  resolvase domain-containing protein  28.28 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52939  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4460  Resolvase domain protein  28.29 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  32.03 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  34.44 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  30.11 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  34.44 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  27.27 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  26.04 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  26.73 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  26.14 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  28.87 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  29.53 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  29.53 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1397  Resolvase domain protein  28.64 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  26.97 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  26.97 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1090  resolvase domain-containing protein  32.89 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  26.97 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0876  resolvase domain-containing protein  31.76 
 
 		 251 aa  58.2  0.00000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0740279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  27.64 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  27.64 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4355  Resolvase domain protein  27.55 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25950  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.49 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4455  resolvase domain-containing protein  28.21 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4386  resolvase domain-containing protein  27.88 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  28.47 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  32.47 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  29.66 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  28.87 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  28.87 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  28.43 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  30.91 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  29.05 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  28.57 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  28.22 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>