More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0853 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0853  glycogen branching enzyme  100 
 
 
622 aa  1303    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00164465  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.83 
 
 
626 aa  567  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06930  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.39 
 
 
630 aa  566  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0081  glycogen branching enzyme  46.02 
 
 
674 aa  560  1e-158  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  43.85 
 
 
725 aa  555  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0818  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.57 
 
 
674 aa  557  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1559  glycogen branching enzyme  45.09 
 
 
659 aa  557  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.018797  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0558  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.26 
 
 
650 aa  548  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000187675  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.11 
 
 
735 aa  550  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1840  glycogen branching enzyme  45.09 
 
 
659 aa  549  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.11 
 
 
732 aa  550  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  43.77 
 
 
749 aa  548  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.05 
 
 
728 aa  544  1e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0562  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.5 
 
 
638 aa  543  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0053  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.18 
 
 
742 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0344154  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  43.73 
 
 
737 aa  536  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  43.28 
 
 
631 aa  537  1e-151  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0586  glycogen branching enzyme  43.94 
 
 
621 aa  537  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  43.97 
 
 
731 aa  534  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  42.49 
 
 
631 aa  532  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  44.55 
 
 
740 aa  529  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  43.23 
 
 
728 aa  529  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0558  glycogen branching enzyme  44.43 
 
 
680 aa  528  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  43.06 
 
 
722 aa  527  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  42.95 
 
 
740 aa  524  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3504  glycogen branching enzyme  44.26 
 
 
645 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  42.65 
 
 
748 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4120  glycogen branching enzyme  41.37 
 
 
764 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4761  glycogen branching enzyme  43.93 
 
 
645 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4599  glycogen branching enzyme  43.77 
 
 
645 aa  512  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5123  glycogen branching enzyme  43.93 
 
 
645 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4710  glycogen branching enzyme  44.43 
 
 
645 aa  515  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  41.87 
 
 
729 aa  513  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  42.3 
 
 
738 aa  514  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0775  1,4-alpha-glucan branching enzyme  43.62 
 
 
721 aa  513  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  42.39 
 
 
723 aa  513  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4980  glycogen branching enzyme  43.77 
 
 
645 aa  512  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4999  glycogen branching enzyme  43.61 
 
 
645 aa  513  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5009  glycogen branching enzyme  44.86 
 
 
645 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5028  glycogen branching enzyme  43.77 
 
 
645 aa  510  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4621  glycogen branching enzyme  43.61 
 
 
637 aa  511  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  42.26 
 
 
726 aa  511  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2162  glycogen branching enzyme  43.06 
 
 
625 aa  511  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750455  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  41.36 
 
 
725 aa  509  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0238  glycogen branching enzyme  43.61 
 
 
645 aa  511  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0276021  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2024  glycogen branching enzyme  44.8 
 
 
677 aa  511  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136929  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0151  1,4-alpha-glucan branching enzyme  43.9 
 
 
639 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  40.47 
 
 
764 aa  507  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  42.35 
 
 
695 aa  506  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0246  1,4-alpha-glucan branching enzyme  41.29 
 
 
839 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0999  glycogen branching enzyme  42.37 
 
 
640 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.970102  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10681  glycogen branching enzyme  40.68 
 
 
759 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.134433  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1978  glycogen branching enzyme  42.76 
 
 
632 aa  502  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  40.03 
 
 
755 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  41.09 
 
 
774 aa  504  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  41.72 
 
 
768 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1530  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.14 
 
 
736 aa  504  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.473268  hitchhiker  0.0000810495 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4050  glycogen branching enzyme  41.72 
 
 
768 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  42.28 
 
 
634 aa  501  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06491  glycogen branching enzyme  40.47 
 
 
754 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.930927  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2403  1,4-alpha-glucan branching enzyme  41.95 
 
 
659 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  42.1 
 
 
746 aa  501  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2353  1,4-alpha-glucan branching enzyme  41.95 
 
 
659 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  41.48 
 
 
784 aa  499  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  41.48 
 
 
784 aa  499  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  41.45 
 
 
732 aa  499  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  41.98 
 
 
732 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  41.88 
 
 
785 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  39.88 
 
 
755 aa  501  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3200  glycogen branching enzyme  41.67 
 
 
648 aa  501  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0465  glycogen branching enzyme  40.28 
 
 
782 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.498209  normal  0.561272 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0036  1,4-alpha-glucan branching enzyme  42.88 
 
 
635 aa  498  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  41.6 
 
 
741 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  41.49 
 
 
732 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0919  glycogen branching enzyme  40.13 
 
 
764 aa  497  1e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144042  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2285  glycogen branching enzyme  41.88 
 
 
638 aa  497  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4362  1,4-alpha-glucan branching enzyme  40.91 
 
 
654 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1226  glycogen branching enzyme  39.88 
 
 
766 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  41.57 
 
 
733 aa  498  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1837  glycogen branching enzyme  40.4 
 
 
776 aa  495  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06101  glycogen branching enzyme  39.97 
 
 
754 aa  498  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  42.36 
 
 
1224 aa  496  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  42.6 
 
 
1217 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0452  glycogen branching enzyme  40.12 
 
 
782 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1494  glycogen branching enzyme  40.96 
 
 
746 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2229  1,4-alpha-glucan branching enzyme  41.9 
 
 
629 aa  492  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00541672  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  39.88 
 
 
763 aa  494  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  41.48 
 
 
728 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0584  glycogen branching enzyme  38.94 
 
 
754 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  41.3 
 
 
740 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  41.31 
 
 
728 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06401  glycogen branching enzyme  39.25 
 
 
754 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.556362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  41.55 
 
 
770 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  41.02 
 
 
668 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.10284 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1168  glycogen branching enzyme  41.16 
 
 
765 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3094  1,4-alpha-glucan branching enzyme  41.03 
 
 
646 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302104  normal  0.0711873 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0840  glycogen branching enzyme  42.36 
 
 
643 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.049249 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  40.39 
 
 
732 aa  489  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1248  glycogen branching enzyme  41.41 
 
 
745 aa  492  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  42.4 
 
 
736 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.297047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>