56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4049 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_4049  response regulator receiver protein  100 
 
 		 275 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00251355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3324  LuxR family transcriptional regulator  99.64 
 
 		 314 aa  537  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3235  hypothetical protein  73.82 
 
 		 275 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 385 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15290  putative transcriptional regulator  43.06 
 
 		 325 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0074929  hitchhiker  0.0000000000000265262 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1345  putative transcriptional regulator  43.06 
 
 		 325 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3060  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 215 aa  48.9  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 217 aa  48.9  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 119 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 405 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 394 aa  47  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 385 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1234  LuxR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 856 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7175  transcriptional regulator, LuxR family  37.84 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.267519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 416 aa  46.6  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 257 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  26.07 
 
 		 257 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3634  transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 525 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.567744  normal  0.0299379 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2812  transcriptional regulator, LuxR family  42.03 
 
 		 522 aa  45.8  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000674561  hitchhiker  0.0000653029 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 394 aa  45.8  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0389  LuxR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 397 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  43.4 
 
 		 395 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1197  two component LuxR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0485473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.9 
 
 		 221 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  37.5 
 
 		 373 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_003296  RS03679  transcription regulator protein  32.14 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000906887  normal  0.0907157 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  43.4 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5646  putative LuxR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.387707 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0703  two component LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 220 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.901141  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 391 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2762  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  39.29 
 
 		 520 aa  43.9  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3337  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.16 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal  0.130531 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3310  regulatory protein, LuxR  42.86 
 
 		 512 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  27.31 
 
 		 893 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  32.61 
 
 		 910 aa  43.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24980  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40.91 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1410  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.48 
 
 		 222 aa  43.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.46664  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0636  LuxR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 496 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 216 aa  42.7  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0559  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 211 aa  42.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0841173  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000650  transcriptional regulator LuxR family  26.53 
 
 		 292 aa  42.7  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  30.59 
 
 		 370 aa  42.7  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  37.29 
 
 		 387 aa  42.7  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4220  LuxR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 222 aa  42.7  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.848445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  30.77 
 
 		 916 aa  42.7  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 359 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.24 
 
 		 469 aa  42.4  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0175254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29510  ATP-dependent transcriptional regulator  40.91 
 
 		 992 aa  42.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.611914 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06950  LuxR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 496 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.490761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4871  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 222 aa  42.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134443  normal  0.31614 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  32.26 
 
 		 216 aa  42.4  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 175 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.68 
 
 		 208 aa  42  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 229 aa  42  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>