More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2354 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0699  coproporphyrinogen III oxidase  99.33 
 
 		 450 aa  898    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2354  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 450 aa  905    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.148404 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0531  coproporphyrinogen III oxidase  83.52 
 
 		 450 aa  761    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2548  coproporphyrinogen III oxidase  62.3 
 
 		 451 aa  541  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1851  coproporphyrinogen III oxidase  60.8 
 
 		 451 aa  539  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532026  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0659  coproporphyrinogen III oxidase  58.78 
 
 		 453 aa  506  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3859  coproporphyrinogen III oxidase  50.68 
 
 		 442 aa  444  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.652374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0977  coproporphyrinogen III oxidase  48.19 
 
 		 452 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1962  coproporphyrinogen III oxidase  47.51 
 
 		 452 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0317  coproporphyrinogen III oxidase  47.29 
 
 		 452 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2028  coproporphyrinogen III oxidase  41.89 
 
 		 450 aa  353  4e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6824  coproporphyrinogen III oxidase  40.97 
 
 		 450 aa  349  5e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1747  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.33 
 
 		 467 aa  341  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79617  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.26 
 
 		 456 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1560  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.56 
 
 		 444 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2555  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.97 
 
 		 451 aa  335  7e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.674135 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0435  coproporphyrinogen III oxidase  41.36 
 
 		 450 aa  335  9e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3273  coproporphyrinogen III oxidase  41.88 
 
 		 448 aa  330  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  39.09 
 
 		 454 aa  325  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3872  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.93 
 
 		 470 aa  323  4e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1199  coproporphyrinogen III oxidase  38.57 
 
 		 450 aa  319  7e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00110576  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6285  coproporphyrinogen III oxidase  38.55 
 
 		 450 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180348  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4298  coproporphyrinogen III oxidase  38.32 
 
 		 451 aa  317  3e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1101  coproporphyrinogen III oxidase  38.34 
 
 		 450 aa  317  4e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00147181  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  38.57 
 
 		 449 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  37.7 
 
 		 449 aa  310  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3244  coproporphyrinogen III oxidase  39.63 
 
 		 480 aa  309  5.9999999999999995e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1986  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.36 
 
 		 454 aa  308  9e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  38.48 
 
 		 469 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  36.64 
 
 		 449 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  37.79 
 
 		 449 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0086  coproporphyrinogen III oxidase  37.47 
 
 		 446 aa  292  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.652683  normal  0.197179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0948  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.09 
 
 		 490 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  39.41 
 
 		 463 aa  289  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0655  coproporphyrinogen III oxidase  36.79 
 
 		 444 aa  287  2.9999999999999996e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.372227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0648  coproporphyrinogen III oxidase  36.56 
 
 		 444 aa  286  7e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3720  coproporphyrinogen III oxidase  36.07 
 
 		 446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.959602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  38.51 
 
 		 463 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  33.49 
 
 		 451 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  34.03 
 
 		 453 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2234  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.17 
 
 		 456 aa  282  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0025864  normal  0.861147 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2633  coproporphyrinogen III oxidase  36.07 
 
 		 444 aa  282  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0090  coproporphyrinogen III oxidase  35.83 
 
 		 446 aa  281  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142789 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1668  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 437 aa  281  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3911  coproporphyrinogen III oxidase  36.3 
 
 		 446 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0495726 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4296  coproporphyrinogen III oxidase  36.53 
 
 		 446 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000258009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4116  coproporphyrinogen III oxidase  36.3 
 
 		 446 aa  280  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3913  coproporphyrinogen III oxidase  36.53 
 
 		 446 aa  280  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0047  coproporphyrinogen III oxidase  36.53 
 
 		 446 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577126  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4351  coproporphyrinogen III oxidase  36.53 
 
 		 446 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  38.17 
 
 		 463 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4493  coproporphyrinogen III oxidase  36.53 
 
 		 446 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.320649 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4003  coproporphyrinogen III oxidase  36.3 
 
 		 446 aa  280  4e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.258904 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4730  coproporphyrinogen III oxidase  36.3 
 
 		 458 aa  279  7e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.78 
 
 		 458 aa  279  7e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0614  coproporphyrinogen III oxidase  35.63 
 
 		 472 aa  279  7e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.546946  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0042  coproporphyrinogen III oxidase  35.6 
 
 		 446 aa  279  8e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3100  coproporphyrinogen III oxidase  34.76 
 
 		 469 aa  277  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  34.58 
 
 		 453 aa  277  3e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  33.94 
 
 		 484 aa  276  4e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  33.26 
 
 		 451 aa  276  4e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0053  coproporphyrinogen III oxidase  35.83 
 
 		 446 aa  276  5e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.59946  normal  0.060899 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  37.53 
 
 		 463 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3786  coproporphyrinogen III oxidase  35.83 
 
 		 460 aa  276  6e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  35.09 
 
 		 457 aa  276  8e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.09 
 
 		 457 aa  276  8e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  35.09 
 
 		 457 aa  276  8e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  35.09 
 
 		 457 aa  276  8e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  35.09 
 
 		 457 aa  276  8e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  35.09 
 
 		 457 aa  276  8e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  35.09 
 
 		 457 aa  276  8e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  35.09 
 
 		 457 aa  276  8e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  37.3 
 
 		 463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44470  coproporphyrinogen III oxidase  35.37 
 
 		 460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.063876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  37.3 
 
 		 463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0096  coproporphyrinogen III oxidase  35.36 
 
 		 446 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4251  coproporphyrinogen III oxidase  34.86 
 
 		 457 aa  273  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  0.0658119 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3829  coproporphyrinogen III oxidase  36.83 
 
 		 460 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.919193 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  32.24 
 
 		 451 aa  273  5.000000000000001e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  37.84 
 
 		 461 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3423  coproporphyrinogen III oxidase  37.07 
 
 		 461 aa  273  6e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  38.46 
 
 		 464 aa  272  9e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  38.46 
 
 		 464 aa  272  9e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  38.46 
 
 		 464 aa  272  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  38.46 
 
 		 464 aa  272  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0876  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.41 
 
 		 457 aa  272  1e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  34.25 
 
 		 460 aa  271  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  32.79 
 
 		 451 aa  271  1e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  36.59 
 
 		 461 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  34.03 
 
 		 453 aa  271  1e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0207  coproporphyrinogen III oxidase  32.55 
 
 		 455 aa  271  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119827  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1993  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.73 
 
 		 460 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0376675  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  36.65 
 
 		 489 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  38.24 
 
 		 464 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3582  coproporphyrinogen III oxidase  36.61 
 
 		 460 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  36.73 
 
 		 470 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0472  coproporphyrinogen III oxidase  33.86 
 
 		 455 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.953637  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  38.37 
 
 		 464 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4884  coproporphyrinogen III oxidase  35.15 
 
 		 457 aa  270  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0254001  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  38.37 
 
 		 464 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>