93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1078 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  100 
 
 		 387 aa  784    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  91.21 
 
 		 387 aa  693    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  91.47 
 
 		 398 aa  694    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  67.45 
 
 		 405 aa  550  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  68.5 
 
 		 393 aa  533  1e-150  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  66.32 
 
 		 398 aa  531  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  61.68 
 
 		 388 aa  489  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  44.55 
 
 		 428 aa  312  4.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  46.34 
 
 		 420 aa  312  5.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  45.73 
 
 		 431 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  44.78 
 
 		 403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  43.75 
 
 		 417 aa  302  6.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  44.51 
 
 		 416 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  43.92 
 
 		 435 aa  300  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  41.59 
 
 		 421 aa  297  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  43.85 
 
 		 421 aa  296  6e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  41.85 
 
 		 417 aa  295  7e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  44.57 
 
 		 430 aa  294  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  44.24 
 
 		 471 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  46.57 
 
 		 417 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  45.05 
 
 		 418 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  43.58 
 
 		 421 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  43.96 
 
 		 424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  46.03 
 
 		 380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  41 
 
 		 408 aa  273  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  46.86 
 
 		 380 aa  272  9e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  40.36 
 
 		 407 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  40.41 
 
 		 406 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  35.86 
 
 		 450 aa  249  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  40.87 
 
 		 401 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  40.87 
 
 		 401 aa  242  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  40.28 
 
 		 401 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  39.56 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  38.56 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  36.13 
 
 		 379 aa  225  8e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  35.6 
 
 		 379 aa  225  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  38.74 
 
 		 441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  38.15 
 
 		 425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  38.14 
 
 		 416 aa  210  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  33.7 
 
 		 382 aa  206  4e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  36.04 
 
 		 399 aa  204  3e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  31.77 
 
 		 383 aa  199  9e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  35.88 
 
 		 389 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  31.28 
 
 		 369 aa  192  1e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  37.18 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  35.5 
 
 		 389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  34.03 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  36.9 
 
 		 386 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  33.94 
 
 		 382 aa  170  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  33.94 
 
 		 382 aa  170  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  33.05 
 
 		 420 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  34.15 
 
 		 403 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  34.1 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  32.18 
 
 		 385 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  32.85 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  33.64 
 
 		 399 aa  150  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  32.89 
 
 		 424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  31.14 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  31.75 
 
 		 385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  31.75 
 
 		 385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  30.86 
 
 		 397 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  30.56 
 
 		 397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  31.21 
 
 		 392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  26.24 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  31.53 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  28.12 
 
 		 386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  28.33 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  26.37 
 
 		 315 aa  106  5e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  27.27 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  28.23 
 
 		 413 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  25.79 
 
 		 427 aa  94  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  25.79 
 
 		 427 aa  94  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  25.79 
 
 		 427 aa  94  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  26.22 
 
 		 562 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  25.42 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  27.14 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  24.93 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1970  major capsid-like protein  27.94 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  26.79 
 
 		 412 aa  67  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  23.64 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  23.73 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3486  HK97 family phage major capsid protein  29.65 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1114  HK97 family phage major capsid protein  22.02 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2179  phage major capsid protein, HK97 family  27.54 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4981  HK97 family phage major capsid protein  24.4 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5360  HK97 family phage major capsid protein  24.4 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  22.51 
 
 		 514 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2852  phage major capsid protein, HK97 family  25.15 
 
 		 466 aa  52.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  normal  0.025439 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12666  phiRv2 prophage protein  25.43 
 
 		 479 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.5272e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0468  prophage LambdaBa04, major capsid protein  26.05 
 
 		 396 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0446  prophage LambdaBa04, major capsid protein  26.05 
 
 		 400 aa  49.7  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08230  phage major capsid protein, HK97 family  28.44 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0061868  hitchhiker  0.00502474 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1284  major capsid protein HK97  21.72 
 
 		 416 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0461297  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>