More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0028 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  100 
 
 		 279 aa  566  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  82.08 
 
 		 279 aa  475  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  84.45 
 
 		 238 aa  411  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  66.91 
 
 		 279 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  67.64 
 
 		 287 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  67.62 
 
 		 283 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  67.99 
 
 		 281 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  68.35 
 
 		 281 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  68.35 
 
 		 281 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  54.72 
 
 		 287 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  54.34 
 
 		 287 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1412  beta-lactamase domain protein  50.36 
 
 		 278 aa  280  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270255  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  47.45 
 
 		 279 aa  273  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  47.76 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  48.5 
 
 		 293 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  48.12 
 
 		 293 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  45.04 
 
 		 291 aa  225  8e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  45.39 
 
 		 292 aa  219  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  43.33 
 
 		 322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  43.87 
 
 		 290 aa  204  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0756  beta-lactamase domain-containing protein  47.55 
 
 		 291 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.401313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  39.85 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  42.96 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  37.78 
 
 		 324 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  39.18 
 
 		 318 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  38.38 
 
 		 342 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  37.73 
 
 		 324 aa  175  7e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  41.54 
 
 		 277 aa  175  7e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  37.69 
 
 		 339 aa  175  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  36.14 
 
 		 327 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  35.38 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  38.6 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  36.06 
 
 		 327 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  36 
 
 		 351 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  35.97 
 
 		 336 aa  172  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  36.3 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  38.63 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  37.64 
 
 		 324 aa  168  9e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  34.89 
 
 		 332 aa  168  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  37.36 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  37.28 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  39.71 
 
 		 314 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  35.29 
 
 		 321 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  36.57 
 
 		 332 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  35.61 
 
 		 332 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  36.03 
 
 		 314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  35.97 
 
 		 327 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  34.17 
 
 		 329 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  34.73 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  33.94 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  37.27 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  33.21 
 
 		 324 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  34.7 
 
 		 335 aa  158  8e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  38.57 
 
 		 334 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  37.36 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  37.36 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  33.57 
 
 		 315 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  37 
 
 		 344 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 		 311 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  37.13 
 
 		 322 aa  155  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  33.7 
 
 		 322 aa  155  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  35.23 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  36.56 
 
 		 328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  32.26 
 
 		 329 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  37.67 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  32.26 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  35.16 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  35.16 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  33.72 
 
 		 320 aa  149  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  35.19 
 
 		 320 aa  149  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  36.16 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  35.4 
 
 		 329 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  33.82 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  34.59 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  32.59 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  32.72 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  34.31 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  30.8 
 
 		 329 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  32.97 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3467  metal dependent hydrolase  32.96 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  31.96 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  34.81 
 
 		 315 aa  132  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  34.81 
 
 		 339 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  32.59 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  35.96 
 
 		 277 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  34.21 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  29.62 
 
 		 326 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  29.64 
 
 		 331 aa  108  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  30.16 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  32.26 
 
 		 332 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.74 
 
 		 293 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  32.26 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 288 aa  102  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8301  beta-lactamase domain protein  30.24 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  32 
 
 		 330 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1577  hypothetical protein  31.37 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  33.85 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>