119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0027 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0131  lipoprotein  86.94 
 
 		 657 aa  1137    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6465  beta strand repeat-containing protein  70.34 
 
 		 653 aa  872    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.696651  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6344  beta strand repeat-containing protein  71.25 
 
 		 652 aa  865    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6700  beta strand repeat-containing protein  70.49 
 
 		 653 aa  874    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.162952 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  61.13 
 
 		 683 aa  705    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0027  autotransporter-associated beta strand repeat protein  100 
 
 		 661 aa  1313    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6306  beta strand repeat-containing protein  70.18 
 
 		 653 aa  874    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.662487 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6047  beta strand repeat-containing protein  71.1 
 
 		 652 aa  863    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.649226 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0033  autotransporter-associated beta strand repeat protein  95.4 
 
 		 348 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.354567 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  51.52 
 
 		 634 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2201  serine protease  50.57 
 
 		 641 aa  564  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3064  autotransporter-associated beta strand repeat protein  50 
 
 		 634 aa  547  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.782614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  48.28 
 
 		 986 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  47.76 
 
 		 995 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  50.12 
 
 		 1053 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.44 
 
 		 1011 aa  273  9e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  43.58 
 
 		 1177 aa  250  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3788  putative phosphatase  34.39 
 
 		 423 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3969  putative phosphatase  33.99 
 
 		 423 aa  120  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3908  putative phosphatase  33.99 
 
 		 423 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2492  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.55 
 
 		 425 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2395  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.11 
 
 		 465 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2222  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.68 
 
 		 447 aa  110  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2536  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35 
 
 		 431 aa  107  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0315  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.07 
 
 		 378 aa  103  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0024  membrane-associated phospholipid phosphatase  32.2 
 
 		 510 aa  103  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0032  hypothetical protein  93.55 
 
 		 65 aa  96.3  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.694262 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2001  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.47 
 
 		 378 aa  95.5  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.19 
 
 		 1125 aa  86.7  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0340  serine protease  35.68 
 
 		 949 aa  84.7  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000000485293  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  35.9 
 
 		 974 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0234  serine protease  36.62 
 
 		 998 aa  83.2  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249897  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  36.62 
 
 		 970 aa  82.4  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  36.36 
 
 		 970 aa  82.8  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000319801  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2063  autotransporter beta-domain-containing protein  40.27 
 
 		 954 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  28.57 
 
 		 1028 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  35.55 
 
 		 965 aa  78.2  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  35.55 
 
 		 909 aa  76.6  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4861  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.8 
 
 		 472 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  29.93 
 
 		 1055 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2954  autotransporter-associated beta strand repeat protein  28.57 
 
 		 947 aa  70.9  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0154236  hitchhiker  0.00450699 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  27.67 
 
 		 1038 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.38 
 
 		 915 aa  67.4  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  29.55 
 
 		 1004 aa  67  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  35.58 
 
 		 942 aa  66.2  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.9 
 
 		 913 aa  65.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3763  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.82 
 
 		 470 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  35.57 
 
 		 1530 aa  61.6  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.8 
 
 		 910 aa  60.8  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  27.02 
 
 		 1062 aa  60.8  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  37.41 
 
 		 1325 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  37.8 
 
 		 1006 aa  59.7  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03461  acid phosphatase  34.65 
 
 		 285 aa  59.7  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.355106 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.95 
 
 		 926 aa  58.9  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  40.52 
 
 		 2003 aa  58.2  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  28.06 
 
 		 1033 aa  57  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4714  putative acid phosphatase  31.37 
 
 		 250 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.225628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.6 
 
 		 906 aa  56.2  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000419199  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.59 
 
 		 1532 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  36.52 
 
 		 3322 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4585  putative acid phosphatase  31.37 
 
 		 250 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1631  acid phosphatase  29.85 
 
 		 253 aa  55.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  37.5 
 
 		 1446 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4589  putative acid phosphatase  30.39 
 
 		 250 aa  55.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.10693  normal  0.314355 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  37.82 
 
 		 994 aa  55.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0006  putative acid phosphatase  30.93 
 
 		 246 aa  54.7  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0038  Acid phosphatase  30.25 
 
 		 279 aa  54.7  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17079  hitchhiker  0.000164539 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4680  putative acid phosphatase  30.39 
 
 		 250 aa  54.7  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  32.37 
 
 		 2057 aa  54.7  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0690  Acid phosphatase  28.91 
 
 		 258 aa  54.3  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0243  putative acid phosphatase  29.41 
 
 		 249 aa  54.3  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4670  putative acid phosphatase  30.39 
 
 		 250 aa  54.3  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4538  acid phosphatase  33.01 
 
 		 289 aa  53.5  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  37.39 
 
 		 1113 aa  52  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4695  acid phosphatase  30.28 
 
 		 275 aa  51.6  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  47.69 
 
 		 2642 aa  51.6  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2221  acid phosphatase  31.48 
 
 		 283 aa  51.6  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517778  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  55.56 
 
 		 1741 aa  51.2  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4100  acid phosphatase  42.42 
 
 		 295 aa  50.8  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.122701 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  33.59 
 
 		 2906 aa  50.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2143  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.73 
 
 		 256 aa  50.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03490  phosphatase  27.11 
 
 		 265 aa  50.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2405  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.4 
 
 		 262 aa  49.3  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.449401 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0269  putative acid phosphatase  33.06 
 
 		 241 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00690  acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase  27.27 
 
 		 253 aa  49.7  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  39.31 
 
 		 1806 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  40.37 
 
 		 2396 aa  48.9  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  38.13 
 
 		 1632 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  55.1 
 
 		 1357 aa  48.5  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.84 
 
 		 1134 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02380  putative acid phosphatase  32.23 
 
 		 241 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.93 
 
 		 1081 aa  47.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  33.33 
 
 		 3506 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2218  hypothetical protein  33.12 
 
 		 709 aa  47  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  40.74 
 
 		 1971 aa  47  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  52.73 
 
 		 1078 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3182  Acid phosphatase  26.12 
 
 		 248 aa  47  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0651896  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  35.2 
 
 		 1550 aa  46.6  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  34.51 
 
 		 2711 aa  46.6  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1669  Acid phosphatase  29.91 
 
 		 296 aa  47  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206276  normal  0.6113 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>