59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1669 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1669  Acid phosphatase  100 
 
 
296 aa  580  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206276  normal  0.6113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1849  Acid phosphatase  87.84 
 
 
292 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1570  acid phosphatase  86.49 
 
 
292 aa  467  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  0.0585082 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4100  acid phosphatase  60.84 
 
 
295 aa  291  8e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.122701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2550  acid phosphatase  50.37 
 
 
272 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.232354  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3722  phosphoesterase PA-phosphatase related  53.16 
 
 
273 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805724  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0256  acid phosphatase  42.53 
 
 
253 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.136313 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03490  phosphatase  41.59 
 
 
265 aa  158  9e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0038  Acid phosphatase  41.23 
 
 
279 aa  155  9e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17079  hitchhiker  0.000164539 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4695  acid phosphatase  39.15 
 
 
275 aa  153  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4538  acid phosphatase  38.67 
 
 
289 aa  152  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03461  acid phosphatase  36.75 
 
 
285 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.355106 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2405  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.6 
 
 
262 aa  149  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.449401 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2221  acid phosphatase  40.74 
 
 
283 aa  147  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517778  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0006  putative acid phosphatase  38.21 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2996  acid phosphatase  39.72 
 
 
582 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0243  putative acid phosphatase  36.67 
 
 
249 aa  130  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1631  acid phosphatase  33.8 
 
 
253 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4496  acid phosphatase  31.31 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.043425 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3182  Acid phosphatase  32.46 
 
 
248 aa  113  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0651896  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4589  putative acid phosphatase  33.02 
 
 
250 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.10693  normal  0.314355 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4680  putative acid phosphatase  32.55 
 
 
250 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4670  putative acid phosphatase  32.55 
 
 
250 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4585  putative acid phosphatase  32.55 
 
 
250 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4714  putative acid phosphatase  32.55 
 
 
250 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.225628  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0690  Acid phosphatase  36.31 
 
 
258 aa  107  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2143  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.67 
 
 
256 aa  102  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0269  putative acid phosphatase  34.25 
 
 
241 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2001  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.05 
 
 
378 aa  72.4  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0282  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.18 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0187484  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02380  putative acid phosphatase  33.56 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382503  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3908  putative phosphatase  34.62 
 
 
423 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2536  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.33 
 
 
431 aa  69.3  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3969  putative phosphatase  34.62 
 
 
423 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2395  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.38 
 
 
465 aa  68.9  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3788  putative phosphatase  33.85 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2222  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.78 
 
 
447 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0315  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.39 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2201  serine protease  29.23 
 
 
641 aa  65.9  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00690  acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase  27.78 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4861  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.1 
 
 
472 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3763  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
470 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2492  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.65 
 
 
425 aa  61.6  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0024  membrane-associated phospholipid phosphatase  40 
 
 
510 aa  58.2  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28361  hypothetical protein  26.43 
 
 
245 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1740  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.77 
 
 
431 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  32.88 
 
 
1062 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  29.03 
 
 
634 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3064  autotransporter-associated beta strand repeat protein  26.96 
 
 
634 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.782614 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.18 
 
 
178 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0027  autotransporter-associated beta strand repeat protein  28 
 
 
661 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0131  lipoprotein  28.8 
 
 
657 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.51 
 
 
1011 aa  45.8  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3721  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.03 
 
 
170 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.701868  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  35.19 
 
 
182 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1749  phosphoesterase PA-phosphatase-like protein  27.93 
 
 
403 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  29.52 
 
 
683 aa  43.5  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3198  PAP2 family protein  30.25 
 
 
170 aa  42.7  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0399  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.34 
 
 
245 aa  42.7  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>