76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4538 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4538  acid phosphatase  100 
 
 
289 aa  578  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03461  acid phosphatase  52.82 
 
 
285 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.355106 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0038  Acid phosphatase  52.12 
 
 
279 aa  244  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17079  hitchhiker  0.000164539 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2221  acid phosphatase  49.62 
 
 
283 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517778  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03490  phosphatase  54.46 
 
 
265 aa  219  5e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1631  acid phosphatase  45.06 
 
 
253 aa  209  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0243  putative acid phosphatase  44.6 
 
 
249 aa  179  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4714  putative acid phosphatase  44.55 
 
 
250 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.225628  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4585  putative acid phosphatase  44.08 
 
 
250 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4680  putative acid phosphatase  44.55 
 
 
250 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4670  putative acid phosphatase  43.6 
 
 
250 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4589  putative acid phosphatase  44.08 
 
 
250 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.10693  normal  0.314355 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0006  putative acid phosphatase  41.74 
 
 
246 aa  166  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3182  Acid phosphatase  44.02 
 
 
248 aa  162  8.000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0651896  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4695  acid phosphatase  41.89 
 
 
275 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4496  acid phosphatase  39.19 
 
 
287 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.043425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1669  Acid phosphatase  39.15 
 
 
296 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206276  normal  0.6113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1570  acid phosphatase  39.57 
 
 
292 aa  153  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  0.0585082 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0690  Acid phosphatase  44.13 
 
 
258 aa  151  8.999999999999999e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1849  Acid phosphatase  39.15 
 
 
292 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2550  acid phosphatase  41.88 
 
 
272 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.232354  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4100  acid phosphatase  41.12 
 
 
295 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.122701 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0256  acid phosphatase  40.45 
 
 
253 aa  132  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.136313 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2405  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.29 
 
 
262 aa  122  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.449401 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3722  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.49 
 
 
273 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805724  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2996  acid phosphatase  36.82 
 
 
582 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2143  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.99 
 
 
256 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3908  putative phosphatase  36.36 
 
 
423 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3969  putative phosphatase  36.36 
 
 
423 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3788  putative phosphatase  35.54 
 
 
423 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2222  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.87 
 
 
447 aa  73.6  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2395  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.87 
 
 
465 aa  73.6  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2536  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.06 
 
 
431 aa  73.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2492  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.6 
 
 
425 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2001  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.72 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0269  putative acid phosphatase  37.19 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2201  serine protease  38.18 
 
 
641 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0315  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.99 
 
 
378 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02380  putative acid phosphatase  36.36 
 
 
241 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382503  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0282  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.5 
 
 
246 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0187484  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4861  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.64 
 
 
472 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3064  autotransporter-associated beta strand repeat protein  34.38 
 
 
634 aa  58.9  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.782614 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  34.38 
 
 
634 aa  58.9  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28361  hypothetical protein  27.09 
 
 
245 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0131  lipoprotein  34.95 
 
 
657 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3763  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.91 
 
 
470 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0027  autotransporter-associated beta strand repeat protein  33.01 
 
 
661 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0024  membrane-associated phospholipid phosphatase  36.36 
 
 
510 aa  52.8  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00690  acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase  28.35 
 
 
253 aa  52.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.61 
 
 
178 aa  52  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4663  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.28 
 
 
515 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.626418  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6344  beta strand repeat-containing protein  30.17 
 
 
652 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169872  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6047  beta strand repeat-containing protein  31.96 
 
 
652 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.649226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  33.33 
 
 
1177 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.7 
 
 
1011 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  26.61 
 
 
1062 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0449  phosphoesterase PA-phosphatase related  24.81 
 
 
170 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3891  phosphoesterase PA-phosphatase related  24.81 
 
 
170 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.256491  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6465  beta strand repeat-containing protein  34.78 
 
 
653 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.696651  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6700  beta strand repeat-containing protein  34.78 
 
 
653 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.162952 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  30.69 
 
 
683 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6306  beta strand repeat-containing protein  34.25 
 
 
653 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.662487 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3721  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.36 
 
 
170 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.701868  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0313  phosphoesterase, PA-phosphatase related  24.86 
 
 
305 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512715  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  32.61 
 
 
1053 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
176 aa  43.5  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0409  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.36 
 
 
170 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  28.89 
 
 
182 aa  43.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1160  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.08 
 
 
205 aa  43.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0022  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.43 
 
 
520 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.38 
 
 
170 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0785734  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1885  membrane-associated phospholipid phosphatase  28.3 
 
 
329 aa  42.7  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2023  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.02 
 
 
317 aa  42.7  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204588 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0435  phosphoesterase PA-phosphatase related  24.81 
 
 
170 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.3398  hitchhiker  0.00199052 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  24.81 
 
 
170 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3097  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.58 
 
 
222 aa  42.4  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.105983 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>