237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3547 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
170 aa  342  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0785734  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0409  phosphoesterase, PA-phosphatase related  96.47 
 
 
170 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3721  phosphoesterase, PA-phosphatase related  92.94 
 
 
170 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.701868  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0435  phosphoesterase PA-phosphatase related  84.12 
 
 
170 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.3398  hitchhiker  0.00199052 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  83.53 
 
 
170 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0449  phosphoesterase PA-phosphatase related  82.94 
 
 
170 aa  268  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3891  phosphoesterase PA-phosphatase related  82.94 
 
 
170 aa  268  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.256491  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4195  PAP2 family protein  90.59 
 
 
170 aa  267  4e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0510  phosphoesterase, PA-phosphatase related  77.06 
 
 
170 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0479  phosphoesterase, PA-phosphatase related  65.43 
 
 
170 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  54.44 
 
 
169 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0532  phosphoesterase PA-phosphatase related  50.28 
 
 
187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0465  phosphoesterase, PA-phosphatase related  52.8 
 
 
199 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.451199  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3198  PAP2 family protein  57.06 
 
 
170 aa  167  8e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  54.02 
 
 
176 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  49.69 
 
 
169 aa  143  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  45.12 
 
 
172 aa  134  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  49.26 
 
 
182 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2063  hypothetical protein  49.63 
 
 
178 aa  119  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1657  PAP2 superfamily protein  40.25 
 
 
171 aa  117  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000234418  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001653  membrane-associated phospholipid phosphatase  47.06 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2985  PAP2 superfamily protein  43.57 
 
 
175 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.99 
 
 
171 aa  101  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.3 
 
 
157 aa  96.3  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.85 
 
 
201 aa  80.9  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.85 
 
 
201 aa  80.9  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1897  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  40.15 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3600  phosphoesterase PA-phosphatase related  45.71 
 
 
171 aa  77  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.09 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2366  phosphoesterase PA-phosphatase related  50 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0167377 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1816  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.76 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0425  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.35 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.41159  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 
179 aa  70.9  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4001  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.1 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.794332  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2733  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.58 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2011  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  27.16 
 
 
222 aa  67.4  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2304  hypothetical protein  34.9 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02498  PAP2 superfamily, putative  39.18 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0979  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.08 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000896993 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.68 
 
 
178 aa  63.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.68 
 
 
178 aa  63.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.2 
 
 
207 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  39.13 
 
 
185 aa  61.6  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.48 
 
 
178 aa  60.8  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.19 
 
 
205 aa  60.8  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2329  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.09 
 
 
182 aa  60.8  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.78 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  36.96 
 
 
185 aa  58.5  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0817  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.4 
 
 
179 aa  57.4  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1555  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.67 
 
 
176 aa  57.4  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2178  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  42.71 
 
 
197 aa  57  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.893732  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2317  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  28.32 
 
 
187 aa  56.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3059  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.38 
 
 
533 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0139  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.41 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.88 
 
 
176 aa  55.1  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2128  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.33 
 
 
199 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.167938  normal  0.900368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.94 
 
 
199 aa  54.7  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0835  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.96 
 
 
181 aa  54.3  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1410  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.09 
 
 
187 aa  54.3  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.163391 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.59 
 
 
185 aa  53.9  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1015  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.59 
 
 
265 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09156  hypothetical protein  28.24 
 
 
187 aa  53.9  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.63816  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1888  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.36 
 
 
192 aa  53.9  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.871384  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1565  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.45 
 
 
225 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2178  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.01 
 
 
166 aa  53.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3404  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.88 
 
 
228 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3348  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.89 
 
 
186 aa  52.4  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.31592  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2029  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30 
 
 
200 aa  51.6  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2554  phosphoesterase, PA-phosphatase related  48.39 
 
 
280 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163921  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0607  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 
179 aa  51.2  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00776566  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.31 
 
 
208 aa  51.2  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3387  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.78 
 
 
168 aa  50.8  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000111833  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.3 
 
 
272 aa  50.8  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2515  hypothetical protein  31.52 
 
 
296 aa  50.8  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00069207  normal  0.734956 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1504  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.24 
 
 
174 aa  50.8  0.000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3490  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.21 
 
 
197 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.63 
 
 
438 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1791  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.96 
 
 
225 aa  50.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.824897  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  39.13 
 
 
437 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2932  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.07 
 
 
203 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  0.0854276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  39.13 
 
 
437 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0430  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.45 
 
 
497 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647388  normal  0.580984 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3158  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.21 
 
 
203 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.873511  normal  0.780516 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0878  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.82 
 
 
182 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.749948  hitchhiker  0.002123 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  42.42 
 
 
227 aa  48.9  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1778  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.06 
 
 
182 aa  49.3  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0038  Acid phosphatase  27.74 
 
 
279 aa  48.5  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17079  hitchhiker  0.000164539 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07455  hypothetical protein  31.73 
 
 
187 aa  48.1  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.13 
 
 
438 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2444  hypothetical protein  37.89 
 
 
216 aa  48.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0113795  normal  0.0207864 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2382  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  43.82 
 
 
221 aa  48.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000279179  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2201  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.6 
 
 
208 aa  48.1  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  35.48 
 
 
438 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1347  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.3 
 
 
392 aa  47.8  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.423681  hitchhiker  0.0000000949183 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4588  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.29 
 
 
176 aa  47.4  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1775  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.22 
 
 
187 aa  47.8  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2147  phosphoesterase PA-phosphatase related  40 
 
 
178 aa  47.4  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.913624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2785  bacitracin transport permease  44.44 
 
 
199 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4880  PAP2 family protein  35.29 
 
 
177 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1669  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.97 
 
 
202 aa  47.4  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000273408  normal  0.218841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>