107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0006 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0006  putative acid phosphatase  100 
 
 
246 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0243  putative acid phosphatase  50.96 
 
 
249 aa  229  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3182  Acid phosphatase  46.05 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0651896  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0690  Acid phosphatase  50.53 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4680  putative acid phosphatase  40.89 
 
 
250 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4589  putative acid phosphatase  40.49 
 
 
250 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.10693  normal  0.314355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4670  putative acid phosphatase  40.89 
 
 
250 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4714  putative acid phosphatase  40.49 
 
 
250 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.225628  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4585  putative acid phosphatase  40.08 
 
 
250 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4496  acid phosphatase  43.19 
 
 
287 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.043425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1631  acid phosphatase  42.18 
 
 
253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03490  phosphatase  39.73 
 
 
265 aa  168  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4538  acid phosphatase  41.74 
 
 
289 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0038  Acid phosphatase  41.98 
 
 
279 aa  165  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17079  hitchhiker  0.000164539 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03461  acid phosphatase  41.98 
 
 
285 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.355106 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2221  acid phosphatase  41.71 
 
 
283 aa  152  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517778  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4100  acid phosphatase  38.71 
 
 
295 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.122701 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1570  acid phosphatase  37.26 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  0.0585082 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1669  Acid phosphatase  38.21 
 
 
296 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206276  normal  0.6113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0256  acid phosphatase  38.81 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.136313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1849  Acid phosphatase  37.85 
 
 
292 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4695  acid phosphatase  36.49 
 
 
275 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2550  acid phosphatase  38.5 
 
 
272 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.232354  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2996  acid phosphatase  34.43 
 
 
582 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3722  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.5 
 
 
273 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805724  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2405  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.5 
 
 
262 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.449401 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2143  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.69 
 
 
256 aa  108  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0282  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.87 
 
 
246 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0187484  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28361  hypothetical protein  32.04 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2201  serine protease  34.27 
 
 
641 aa  80.9  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2001  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.17 
 
 
378 aa  77  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2536  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.77 
 
 
431 aa  75.5  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2222  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.93 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00690  acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase  29.38 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0315  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.36 
 
 
378 aa  72  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3064  autotransporter-associated beta strand repeat protein  37.5 
 
 
634 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.782614 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  37.5 
 
 
634 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2395  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.77 
 
 
465 aa  69.7  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3908  putative phosphatase  33.88 
 
 
423 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3969  putative phosphatase  33.88 
 
 
423 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4861  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.67 
 
 
472 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3788  putative phosphatase  33.06 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2492  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
425 aa  66.2  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0269  putative acid phosphatase  29.94 
 
 
241 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3763  phosphoesterase PA-phosphatase related  36 
 
 
470 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0131  lipoprotein  34.02 
 
 
657 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6344  beta strand repeat-containing protein  28.1 
 
 
652 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169872  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6047  beta strand repeat-containing protein  31.96 
 
 
652 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.649226 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6306  beta strand repeat-containing protein  27.56 
 
 
653 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.662487 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0027  autotransporter-associated beta strand repeat protein  30.93 
 
 
661 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  31.58 
 
 
683 aa  53.1  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6465  beta strand repeat-containing protein  32.22 
 
 
653 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.696651  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6700  beta strand repeat-containing protein  32.22 
 
 
653 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.162952 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  26.56 
 
 
1062 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02380  putative acid phosphatase  25.34 
 
 
241 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382503  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0024  membrane-associated phospholipid phosphatase  31.33 
 
 
510 aa  50.4  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2200  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.14 
 
 
248 aa  49.7  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  35.23 
 
 
1053 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.07 
 
 
1011 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4512  phosphatidylglycerophosphatase B  30.28 
 
 
177 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113665  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.87 
 
 
208 aa  47.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4871  PAP2 family protein  31.19 
 
 
177 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0369  PAP2 family protein  31.19 
 
 
177 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636888  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4656  PAP2 family protein  29.36 
 
 
177 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4494  phosphatidylglycerophosphatase B  29.36 
 
 
177 aa  46.2  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5011  PAP2 family protein  29.36 
 
 
177 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.36 
 
 
174 aa  46.6  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4897  PAP2 family protein  29.36 
 
 
177 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4880  PAP2 family protein  29.36 
 
 
177 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0607  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.21 
 
 
179 aa  46.2  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00776566  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4588  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.63 
 
 
176 aa  46.2  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.17 
 
 
178 aa  46.2  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  31.11 
 
 
1177 aa  45.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.57 
 
 
207 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.82 
 
 
179 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0036  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.15 
 
 
273 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0828  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.36 
 
 
252 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238614 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1791  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.21 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.824897  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.63 
 
 
172 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1740  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.26 
 
 
431 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4906  PAP2 family protein  28.44 
 
 
177 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1577  hypothetical protein  27.52 
 
 
392 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.353635  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3529  phosphoesterase, PA-phosphatase related  24.64 
 
 
361 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.938289  normal  0.0139793 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1657  PAP2 superfamily protein  35.94 
 
 
171 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000234418  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.85 
 
 
170 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0785734  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1340  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.67 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0154  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.36 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2329  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.97 
 
 
182 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4605  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.36 
 
 
249 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3446  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.92 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1019  DedA/PAP2 family phospholipid acid phosphatase  29.92 
 
 
502 aa  43.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3721  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.31 
 
 
170 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.701868  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0425  undecaprenyl-diphosphatase  34.94 
 
 
203 aa  43.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3179  phosphoesterase PA-phosphatase related  33 
 
 
230 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0430  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.68 
 
 
497 aa  42.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647388  normal  0.580984 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3891  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.23 
 
 
170 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.256491  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1672  phosphoesterase PA-phosphatase related  32 
 
 
244 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0449  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.23 
 
 
170 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.39 
 
 
360 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4360  lipid A 1-phosphatase protein  41.38 
 
 
268 aa  42.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>