191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4360 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4360  lipid A 1-phosphatase protein  100 
 
 		 268 aa  533  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4225  phosphoesterase PA-phosphatase related  48.47 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3901  phosphoesterase PA-phosphatase related  48.43 
 
 		 232 aa  205  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3179  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.89 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2558  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.12 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0088777  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1791  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.24 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.824897  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0740  PAP2 family protein  37.1 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0735  PAP2 family protein  37.1 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.34 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1669  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.06 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000273408  normal  0.218841 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.26 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3918  putative phosphoesterase, PA-phosphatase related (membrane associated)  33.33 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0381  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.98 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2201  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.29 
 
 		 208 aa  75.1  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2916  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.66 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2554  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.63 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0607  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.58 
 
 		 179 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00776566  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0691  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.21 
 
 		 207 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.46674  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2545  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.33 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121468  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0981  hypothetical protein  38.46 
 
 		 215 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0399  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.81 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149101  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0951  hypothetical protein  43.53 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4552  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.35 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0131  PAP2 family protein  31.97 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0122  PAP2 family protein  31.97 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.01 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.14 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.52 
 
 		 676 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0828  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.31 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238614 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2672  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  22.4 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0311  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.87 
 
 		 497 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2826  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.04 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.68 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1775  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.9 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2990  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.38 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3095  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.38 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3600  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.46 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4001  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.79 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.371815  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0231  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.79 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2200  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.34 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  33.33 
 
 		 437 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3219  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.33 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2905  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.62 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1387  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.58 
 
 		 196 aa  53.9  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0430  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.17 
 
 		 497 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647388  normal  0.580984 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4605  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.06 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2234  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.26 
 
 		 268 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  32.41 
 
 		 437 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0219  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.61 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237278 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0450  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  42.71 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1842  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.34 
 
 		 204 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0425  undecaprenyl-diphosphatase  33.33 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  33.94 
 
 		 438 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2555  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.84 
 
 		 271 aa  52.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.729938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09156  hypothetical protein  31.91 
 
 		 187 aa  52  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.63816  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0149  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.93 
 
 		 221 aa  52.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.748039  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4688  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.98 
 
 		 438 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  33.98 
 
 		 438 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4656  PAP2 family protein  29.7 
 
 		 177 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4871  PAP2 family protein  29.7 
 
 		 177 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4866  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.98 
 
 		 438 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5011  PAP2 family protein  29.7 
 
 		 177 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3574  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0369  PAP2 family protein  29.7 
 
 		 177 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4880  PAP2 family protein  29.7 
 
 		 177 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4588  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.71 
 
 		 176 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.33 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3250  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.33 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807425 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.33 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4906  PAP2 family protein  29.7 
 
 		 177 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4494  phosphatidylglycerophosphatase B  29.7 
 
 		 177 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1362  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.74 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000155567  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3446  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.59 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6892  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.5 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.757531 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0608  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.98 
 
 		 438 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4897  PAP2 family protein  29.7 
 
 		 177 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4512  phosphatidylglycerophosphatase B  29.7 
 
 		 177 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113665  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.76 
 
 		 172 aa  50.4  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2844  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.22 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4001  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.33 
 
 		 200 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.794332  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0216  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.59 
 
 		 218 aa  50.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3046  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.56 
 
 		 299 aa  49.7  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.560501  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1246  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.64 
 
 		 331 aa  49.3  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.656269 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0036  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.55 
 
 		 273 aa  48.9  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0979  phosphoesterase PA-phosphatase-like protein  27.49 
 
 		 253 aa  48.9  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.626703  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5027  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.223489  normal  0.43198 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3147  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.65 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.225101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.87 
 
 		 169 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.86 
 
 		 178 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.86 
 
 		 178 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1672  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.85 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1565  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.96 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.28 
 
 		 438 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0713  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.05 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.065408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.62 
 
 		 457 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0154  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.23 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4104  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.44 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2570  hypothetical protein  32.03 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.19 
 
 		 199 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1160  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 205 aa  47.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>