69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0243 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0243  putative acid phosphatase  100 
 
 
249 aa  518  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3182  Acid phosphatase  62.14 
 
 
248 aa  299  3e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0651896  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0690  Acid phosphatase  60.08 
 
 
258 aa  279  3e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0006  putative acid phosphatase  50.96 
 
 
246 aa  229  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4589  putative acid phosphatase  46.57 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.10693  normal  0.314355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4670  putative acid phosphatase  46.57 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4680  putative acid phosphatase  46.57 
 
 
250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4714  putative acid phosphatase  46.57 
 
 
250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.225628  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4585  putative acid phosphatase  46.08 
 
 
250 aa  194  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4538  acid phosphatase  44.6 
 
 
289 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0038  Acid phosphatase  44.14 
 
 
279 aa  172  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17079  hitchhiker  0.000164539 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03490  phosphatase  43.75 
 
 
265 aa  170  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4496  acid phosphatase  41.35 
 
 
287 aa  168  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.043425 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03461  acid phosphatase  42.06 
 
 
285 aa  165  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.355106 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1631  acid phosphatase  39.71 
 
 
253 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2221  acid phosphatase  42.52 
 
 
283 aa  155  8e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517778  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4695  acid phosphatase  36.05 
 
 
275 aa  143  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2550  acid phosphatase  37.25 
 
 
272 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.232354  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1570  acid phosphatase  36.19 
 
 
292 aa  132  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  0.0585082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1849  Acid phosphatase  36.19 
 
 
292 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1669  Acid phosphatase  36.67 
 
 
296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206276  normal  0.6113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4100  acid phosphatase  36.32 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.122701 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0256  acid phosphatase  34.43 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.136313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3722  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.76 
 
 
273 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805724  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2143  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.85 
 
 
256 aa  102  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2996  acid phosphatase  30.29 
 
 
582 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2405  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.16 
 
 
262 aa  94.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.449401 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0282  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.15 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0187484  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3908  putative phosphatase  30.61 
 
 
423 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3969  putative phosphatase  30.61 
 
 
423 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3788  putative phosphatase  29.93 
 
 
423 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2201  serine protease  32.26 
 
 
641 aa  69.7  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2536  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.61 
 
 
431 aa  66.6  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28361  hypothetical protein  28.89 
 
 
245 aa  65.5  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  33.6 
 
 
634 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3064  autotransporter-associated beta strand repeat protein  33.6 
 
 
634 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.782614 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2001  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.43 
 
 
378 aa  64.3  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2222  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.46 
 
 
447 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00690  acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase  28.57 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4861  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.24 
 
 
472 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2395  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.13 
 
 
465 aa  60.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0315  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  28.69 
 
 
378 aa  59.3  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0269  putative acid phosphatase  33.33 
 
 
241 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3763  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.57 
 
 
470 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2492  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.13 
 
 
425 aa  55.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0027  autotransporter-associated beta strand repeat protein  29.41 
 
 
661 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0131  lipoprotein  30.65 
 
 
657 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02380  putative acid phosphatase  31.25 
 
 
241 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382503  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  31.17 
 
 
1062 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  28.57 
 
 
683 aa  52  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6047  beta strand repeat-containing protein  27.01 
 
 
652 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.649226 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6344  beta strand repeat-containing protein  27.01 
 
 
652 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169872  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  28.93 
 
 
986 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  33.78 
 
 
1177 aa  48.9  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2329  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.25 
 
 
182 aa  48.9  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0024  membrane-associated phospholipid phosphatase  35.94 
 
 
510 aa  48.9  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6306  beta strand repeat-containing protein  28.07 
 
 
653 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.662487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  30 
 
 
1053 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6700  beta strand repeat-containing protein  27.1 
 
 
653 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.162952 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6465  beta strand repeat-containing protein  27.1 
 
 
653 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.696651  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  30.58 
 
 
995 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.08 
 
 
178 aa  45.4  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.56 
 
 
1011 aa  45.4  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3891  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.77 
 
 
170 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.256491  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0449  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.77 
 
 
170 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2200  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.13 
 
 
248 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0119  PA-phosphatase related phosphoesterase  29.7 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00406131  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4663  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.19 
 
 
515 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.626418  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1657  PAP2 superfamily protein  35.71 
 
 
171 aa  42.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000234418  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>