56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2405 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2405  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
262 aa  530  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.449401 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2550  acid phosphatase  39.92 
 
 
272 aa  156  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.232354  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4100  acid phosphatase  42.27 
 
 
295 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.122701 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4695  acid phosphatase  38.97 
 
 
275 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0256  acid phosphatase  40.53 
 
 
253 aa  151  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.136313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1669  Acid phosphatase  36.6 
 
 
296 aa  149  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206276  normal  0.6113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3722  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.42 
 
 
273 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805724  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1849  Acid phosphatase  35.32 
 
 
292 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1570  acid phosphatase  34.89 
 
 
292 aa  142  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  0.0585082 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0038  Acid phosphatase  35.44 
 
 
279 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17079  hitchhiker  0.000164539 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03490  phosphatase  35.65 
 
 
265 aa  126  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03461  acid phosphatase  32.68 
 
 
285 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.355106 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4538  acid phosphatase  35.24 
 
 
289 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2221  acid phosphatase  34.07 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517778  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2996  acid phosphatase  36.54 
 
 
582 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0006  putative acid phosphatase  35.5 
 
 
246 aa  112  8.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4589  putative acid phosphatase  31.61 
 
 
250 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.10693  normal  0.314355 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4680  putative acid phosphatase  31.61 
 
 
250 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4714  putative acid phosphatase  31.61 
 
 
250 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.225628  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4670  putative acid phosphatase  31.61 
 
 
250 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4585  putative acid phosphatase  31.09 
 
 
250 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1631  acid phosphatase  28.71 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4496  acid phosphatase  31.78 
 
 
287 aa  96.3  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.043425 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0690  Acid phosphatase  34.5 
 
 
258 aa  95.5  8e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0243  putative acid phosphatase  30.53 
 
 
249 aa  94.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3182  Acid phosphatase  30 
 
 
248 aa  85.5  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0651896  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2143  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.25 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2001  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.25 
 
 
378 aa  65.9  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0315  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.43 
 
 
378 aa  65.5  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2222  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.16 
 
 
447 aa  63.2  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2536  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.38 
 
 
431 aa  63.2  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2395  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.65 
 
 
465 aa  62.4  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3908  putative phosphatase  32.77 
 
 
423 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3969  putative phosphatase  32.77 
 
 
423 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00690  acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase  27.13 
 
 
253 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2492  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.42 
 
 
425 aa  61.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0282  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.52 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0187484  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3788  putative phosphatase  31.93 
 
 
423 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2201  serine protease  29.61 
 
 
641 aa  59.7  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4861  phosphoesterase PA-phosphatase related  36 
 
 
472 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3763  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.43 
 
 
470 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0024  membrane-associated phospholipid phosphatase  40.58 
 
 
510 aa  55.5  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3064  autotransporter-associated beta strand repeat protein  27.38 
 
 
634 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.782614 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  29.73 
 
 
634 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28361  hypothetical protein  29.85 
 
 
245 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0027  autotransporter-associated beta strand repeat protein  28.4 
 
 
661 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  32.32 
 
 
1062 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0269  putative acid phosphatase  36.25 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0131  lipoprotein  27.92 
 
 
657 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6344  beta strand repeat-containing protein  27.33 
 
 
652 aa  45.4  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169872  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6047  beta strand repeat-containing protein  27.33 
 
 
652 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.649226 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6465  beta strand repeat-containing protein  26.88 
 
 
653 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.696651  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6700  beta strand repeat-containing protein  26.88 
 
 
653 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.162952 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  25.6 
 
 
683 aa  43.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6306  beta strand repeat-containing protein  26.54 
 
 
653 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.662487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02380  putative acid phosphatase  32.5 
 
 
241 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382503  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>