More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3179 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3179  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 		 230 aa  457  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3901  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.13 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4225  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.18 
 
 		 226 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4360  lipid A 1-phosphatase protein  38.89 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2558  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.82 
 
 		 255 aa  94.4  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0088777  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0740  PAP2 family protein  35.27 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0735  PAP2 family protein  35.27 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2554  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.35 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0399  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.03 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149101  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0131  PAP2 family protein  30.13 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0122  PAP2 family protein  30.13 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.81 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2916  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.29 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1791  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.86 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.824897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2826  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.59 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1669  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.21 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000273408  normal  0.218841 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0381  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.05 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4552  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.38 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0981  hypothetical protein  30.32 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0951  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2545  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.83 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121468  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.25 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0450  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  40.44 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0154  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.44 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.34 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0036  phosphoesterase, PA-phosphatase related  46.15 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.34 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.28 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1387  phosphoesterase PA-phosphatase related  23.94 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2932  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  0.0854276 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2672  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.77 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  52.94 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4866  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.5 
 
 		 438 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4688  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.5 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  36.43 
 
 		 438 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2201  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.98 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0608  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.81 
 
 		 438 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0315  membrane-associated phospholipid phosphatase  35.37 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.770739  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.68 
 
 		 676 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.13 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1249  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.35 
 
 		 489 aa  58.9  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.195733  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3158  phosphoesterase PA-phosphatase related  32 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.873511  normal  0.780516 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2785  bacitracin transport permease  34.74 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0828  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.57 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238614 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.68 
 
 		 438 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4871  PAP2 family protein  33.74 
 
 		 177 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0607  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.79 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00776566  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  41.07 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2382  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.31 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000279179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0369  PAP2 family protein  33.74 
 
 		 177 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636888  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2759  bacitracin transport permease protein bcrc  35.19 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0828321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  33.53 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4656  PAP2 family protein  40.86 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4494  phosphatidylglycerophosphatase B  40.86 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  41.51 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0979  phosphoesterase, PA-phosphatase related  46.48 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000896993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3446  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.45 
 
 		 267 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5011  PAP2 family protein  40.86 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4897  PAP2 family protein  40.86 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4880  PAP2 family protein  40.86 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.96 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  41.51 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3219  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.84 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3721  phosphoesterase, PA-phosphatase related  48.44 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.701868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3574  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.94 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1477  hypothetical protein  30.86 
 
 		 204 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769795  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4906  PAP2 family protein  40.86 
 
 		 177 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4512  phosphatidylglycerophosphatase B  40.86 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113665  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.62 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4605  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.13 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1506  hypothetical protein  30.86 
 
 		 204 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  50.79 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0992  PAP2 family protein  26.98 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2497  bacitracin transport permease  35.96 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202307  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3250  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.94 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807425 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1093  membrane-associated phospholipid phosphatase  37.86 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00170585  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  48.44 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0691  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.57 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.46674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2462  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  35.96 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0841769  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2053  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.17 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.400178  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0409  phosphoesterase, PA-phosphatase related  46.88 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4001  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.81 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.794332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4588  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.91 
 
 		 176 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.69 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0373  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.08 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1075  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.75 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1390  PAP2 family protein  34.71 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.686909  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0425  phosphoesterase PA-phosphatase related  45 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.41159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0149  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.5 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.748039  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.11 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3059  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.34 
 
 		 533 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.15 
 
 		 662 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1816  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.31 
 
 		 181 aa  54.3  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1171  Pap2  36.45 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00573838  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2794  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.04 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.755209  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2748  phosphoesterase, PA-phosphatase-related protein  36.67 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.572696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3918  putative phosphoesterase, PA-phosphatase related (membrane associated)  37.5 
 
 		 263 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2064  PAP2 family protein  35.16 
 
 		 305 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0267151  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0508  membrane-associated phospholipid phosphatase  36.23 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>