More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3059 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1858  phosphoesterase PA-phosphatase related  78.42 
 
 		 535 aa  699    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.832371  decreased coverage  0.00202108 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3059  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 		 533 aa  1027    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0394  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.24 
 
 		 496 aa  326  7e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0403  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.24 
 
 		 496 aa  326  7e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0382  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.24 
 
 		 496 aa  326  7e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.464112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0311  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.19 
 
 		 497 aa  326  7e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0430  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.74 
 
 		 497 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647388  normal  0.580984 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22000  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  44.59 
 
 		 480 aa  311  2.9999999999999997e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00559373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3215  Sphingosine kinase-like protein  47.51 
 
 		 506 aa  293  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1885  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.75 
 
 		 471 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000885175  normal  0.0968816 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1249  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  42.24 
 
 		 489 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.195733  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4138  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.12 
 
 		 499 aa  277  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3059  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  41.68 
 
 		 519 aa  257  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.450638  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2246  phosphoesterase PA-phosphatase related  45.51 
 
 		 482 aa  256  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0627766  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3916  phosphoesterase PA-phosphatase related  40 
 
 		 498 aa  252  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0196  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  39.45 
 
 		 490 aa  226  8e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0450  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  45.41 
 
 		 205 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  48.26 
 
 		 199 aa  104  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3900  diacylglycerol kinase catalytic region  34.32 
 
 		 303 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.377313  normal  0.188998 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1486  putative lipid kinase  30.68 
 
 		 302 aa  86.7  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0368  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.24 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2552  putative lipid kinase  31.6 
 
 		 305 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0756  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.49 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4941  putative lipid kinase  29.57 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454886  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1888  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.25 
 
 		 192 aa  79  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.871384  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.33 
 
 		 185 aa  78.2  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  28.9 
 
 		 185 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2791  putative lipid kinase  29.84 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0686435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3348  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.26 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.31592  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3383  diacylglycerol kinase catalytic region  29.29 
 
 		 403 aa  73.6  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1933  hypothetical protein  26.9 
 
 		 226 aa  73.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3489  diacylglycerol kinase catalytic region  39.19 
 
 		 541 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2359  diacylglycerol kinase  28.76 
 
 		 343 aa  72.8  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1920  hypothetical protein  26.63 
 
 		 287 aa  72  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5358  putative lipid kinase  30.94 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593577  hitchhiker  0.00311469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6593  diacylglycerol kinase catalytic region  40.41 
 
 		 440 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.830582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  29.18 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3443  diacylglycerol kinase catalytic region  36.47 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000406653  hitchhiker  0.000176251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2544  diacylglycerol kinase, catalytic region  31.85 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.502154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4745  diacylglycerol kinase catalytic region  26.48 
 
 		 321 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3490  phosphoesterase PA-phosphatase related  46 
 
 		 197 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  29.93 
 
 		 312 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.82 
 
 		 178 aa  68.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1846  putative lipid kinase  26.62 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3848  diacylglycerol kinase catalytic region  26.26 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000041794  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1140  diacylglycerol kinase catalytic region  26.54 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2760  diacylglycerol kinase catalytic region  30.87 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0246521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1023  putative lipid kinase  26.69 
 
 		 291 aa  67  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1567  putative lipid kinase  26.26 
 
 		 309 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2128  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 199 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.167938  normal  0.900368 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1361  diacylglycerol kinase catalytic region  26.4 
 
 		 321 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.758230000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2183  hypothetical protein  26.09 
 
 		 318 aa  66.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.681145  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1506  hypothetical protein  33.59 
 
 		 204 aa  65.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3476  putative lipid kinase  24.45 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0227  putative lipid kinase  26.67 
 
 		 328 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6348  diacylglycerol kinase, catalytic region  30.19 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  29.48 
 
 		 185 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0081  putative lipid kinase  22.95 
 
 		 310 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1477  hypothetical protein  33.59 
 
 		 204 aa  65.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769795  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0775  diacylglycerol kinase catalytic region  29.21 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0654  diacylglycerol kinase catalytic region  27.92 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.537224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  35.56 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3700  diacylglycerol kinase catalytic region  27.72 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  35.76 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2406  diacylglycerol kinase catalytic region  28.98 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.45203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1118  diacylglycerol kinase, catalytic region  26.49 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.867073  decreased coverage  0.00200137 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2518  diacylglycerol kinase, catalytic region  31.05 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2179  putative lipid kinase  30.85 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.18 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1500  diacylglycerol kinase catalytic region  31.5 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3825  diacylglycerol kinase catalytic region  29.91 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61177  normal  0.232851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1672  putative lipid kinase  25.51 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  37.59 
 
 		 439 aa  63.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4652  diacylglycerol kinase catalytic region  25.1 
 
 		 300 aa  63.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.06 
 
 		 179 aa  63.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3102  diacylglycerol kinase, catalytic region  28.97 
 
 		 302 aa  63.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0608  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.29 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2785  bacitracin transport permease  28.93 
 
 		 199 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4976  bmrU protein  24.16 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  33.33 
 
 		 438 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4570  diacylglycerol kinase  23.83 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0465  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.77 
 
 		 199 aa  62  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.451199  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0313  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.07 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512715  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.18 
 
 		 194 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.26 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4959  bmrU protein  24.16 
 
 		 300 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.45 
 
 		 201 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2852  diacylglycerol kinase catalytic region  26.19 
 
 		 321 aa  62.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.156551  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2381  diacylglycerol kinase, catalytic region  32.41 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2074  putative lipid kinase  27.68 
 
 		 298 aa  62.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.45 
 
 		 201 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4713  bmrU protein  23.83 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4552  diacylglycerol kinase  23.83 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5075  diacylglycerol kinase family protein  23.83 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5863  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  40.8 
 
 		 168 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1816  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.29 
 
 		 181 aa  61.6  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  45.26 
 
 		 170 aa  62  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0785734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3490  diacylglycerol kinase, catalytic region  35.83 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2844  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.21 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.825053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>