189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3219 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3219  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  100 
 
 
230 aa  456  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.91 
 
 
208 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2201  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.18 
 
 
208 aa  62.8  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1669  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.27 
 
 
202 aa  62.8  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000273408  normal  0.218841 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.09 
 
 
178 aa  62.8  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  34.4 
 
 
185 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0399  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.07 
 
 
245 aa  60.1  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149101  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.39 
 
 
205 aa  58.9  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.13 
 
 
176 aa  58.9  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.59 
 
 
279 aa  58.5  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0501  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.49 
 
 
222 aa  58.5  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1773  PAP2 superfamily protein  40.24 
 
 
445 aa  58.2  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0313  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.93 
 
 
305 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512715  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  32.8 
 
 
185 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3550  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.34 
 
 
278 aa  57  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3371  membrane-associated phospholipid phosphatase  28.72 
 
 
217 aa  55.8  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.067771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3901  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.34 
 
 
232 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0219  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.26 
 
 
219 aa  55.1  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237278 
 
 
-
 
NC_004310  BR0740  PAP2 family protein  28.1 
 
 
255 aa  54.7  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.29 
 
 
272 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.05 
 
 
169 aa  53.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4360  lipid A 1-phosphatase protein  33.33 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2029  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.06 
 
 
200 aa  53.1  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3404  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.64 
 
 
228 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.77 
 
 
174 aa  53.1  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0735  PAP2 family protein  28.1 
 
 
255 aa  52.8  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  25 
 
 
194 aa  52.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3198  PAP2 family protein  47.46 
 
 
170 aa  52.4  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2558  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.97 
 
 
255 aa  52.4  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0088777  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1657  PAP2 superfamily protein  35.78 
 
 
171 aa  52.4  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000234418  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3147  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.51 
 
 
218 aa  52.4  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.225101  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0572  PAP2 superfamily protein  47.62 
 
 
243 aa  52  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.194022 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0936  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.47 
 
 
286 aa  52  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0036  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30 
 
 
273 aa  52  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1412  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.25 
 
 
263 aa  52  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.98368  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3387  phosphoesterase PA-phosphatase related  34 
 
 
168 aa  52.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000111833  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2554  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.5 
 
 
280 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163921  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.33 
 
 
199 aa  52  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.69 
 
 
177 aa  52  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0174559  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4225  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.64 
 
 
226 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5319  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.48 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2063  hypothetical protein  31.82 
 
 
178 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0532  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.34 
 
 
187 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3857  PAP2 family protein  42.65 
 
 
175 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4552  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.46 
 
 
309 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3191  phosphoesterase PA-phosphatase related  47.83 
 
 
174 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.353726  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.61 
 
 
185 aa  50.4  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1441  PAP2 family protein  46.88 
 
 
175 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.24965  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0148  hypothetical protein  42.25 
 
 
266 aa  50.1  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2733  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.23 
 
 
172 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5970  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.93 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  40 
 
 
178 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  30.61 
 
 
182 aa  49.3  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  40 
 
 
178 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2011  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.94 
 
 
222 aa  49.7  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1787  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.27 
 
 
318 aa  49.3  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0823755  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.77 
 
 
207 aa  49.3  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.06 
 
 
457 aa  48.9  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  35.34 
 
 
359 aa  48.9  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  35.34 
 
 
359 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1429  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.11 
 
 
293 aa  48.9  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1125  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.18 
 
 
245 aa  48.5  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.223896  hitchhiker  0.00699955 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1338  PAP2 family protein  41.98 
 
 
347 aa  48.5  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5027  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.12 
 
 
255 aa  48.5  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.223489  normal  0.43198 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2128  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.65 
 
 
199 aa  48.5  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.167938  normal  0.900368 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.32 
 
 
438 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0231  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.58 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3600  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.04 
 
 
171 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0149  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.41 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.748039  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2918  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.57 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547296  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05882  hypothetical protein  41.1 
 
 
108 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2515  hypothetical protein  44.12 
 
 
296 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00069207  normal  0.734956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2814  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.58 
 
 
238 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000029245  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0607  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.73 
 
 
179 aa  47  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00776566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.62 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2185  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.94 
 
 
257 aa  47  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.303622  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3318  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.59 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0711194  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4138  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.57 
 
 
499 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.7 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4469  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.27 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1131  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.73 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0835  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.25 
 
 
181 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.62 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0272  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  43.94 
 
 
188 aa  47.4  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0216  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.7 
 
 
218 aa  47  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5915  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.39 
 
 
249 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.322864  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1969  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.91 
 
 
253 aa  46.6  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175709  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2545  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.06 
 
 
242 aa  46.6  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9017  phosphoesterase PA-phosphatase related  35 
 
 
232 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1791  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.39 
 
 
225 aa  46.6  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.824897  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  27.86 
 
 
438 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  33.04 
 
 
812 aa  46.6  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  45 
 
 
179 aa  46.2  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0139  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.86 
 
 
187 aa  46.2  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6732  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  28.43 
 
 
251 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.322739 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0568  hypothetical protein  26.57 
 
 
187 aa  46.2  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.237091 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1075  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.03 
 
 
331 aa  45.8  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3521  PAP2 family protein  43.48 
 
 
174 aa  45.8  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.702348  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.24 
 
 
227 aa  45.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2143  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.51 
 
 
202 aa  46.2  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.100346 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>