More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0773 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 		 252 aa  503  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0824  phosphoesterase PA-phosphatase related  85.48 
 
 		 241 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0119  PA-phosphatase related phosphoesterase  57.48 
 
 		 256 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00406131  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1706  phosphoesterase, PA-phosphatase related  52.74 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2555  phosphoesterase PA-phosphatase related  48.7 
 
 		 271 aa  208  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.729938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1672  phosphoesterase PA-phosphatase related  51.83 
 
 		 244 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2905  phosphoesterase, PA-phosphatase related  50.67 
 
 		 255 aa  205  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1755  phosphoesterase, PA-phosphatase related  57.01 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2990  phosphoesterase PA-phosphatase related  54.55 
 
 		 255 aa  201  8e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3095  phosphoesterase PA-phosphatase related  54.55 
 
 		 255 aa  201  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3574  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.5 
 
 		 267 aa  185  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  45.22 
 
 		 241 aa  184  8e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3250  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.5 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3446  phosphoesterase PA-phosphatase related  46.8 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0828  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.34 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4605  phosphoesterase PA-phosphatase related  47.98 
 
 		 249 aa  176  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0154  phosphoesterase PA-phosphatase related  48.5 
 
 		 249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2570  hypothetical protein  43.11 
 
 		 227 aa  173  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4104  phosphoesterase PA-phosphatase related  46.15 
 
 		 257 aa  168  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6892  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.9 
 
 		 251 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.757531 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5915  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.53 
 
 		 249 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.322864  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2334  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.69 
 
 		 242 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254017 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2200  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.12 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0197  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.44 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0713  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.27 
 
 		 254 aa  148  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.065408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2461  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.25 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03667  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.36 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0231  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.42 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.72 
 
 		 211 aa  85.5  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  40 
 
 		 360 aa  82.4  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.41 
 
 		 702 aa  80.5  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0315  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.09 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4315  phosphoesterase, PA-phosphatase related  46.43 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2342  PAP2 family protein  30.95 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149302  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2126  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.48 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0807737  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2417  PAP2 family protein  31.55 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2154  PAP2 family protein  30.95 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0168528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2092  phosphatidylglycerophosphatase B  30.95 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2309  PAP2 family protein  30.95 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2335  PAP2 family protein  30.95 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1125  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.2 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.223896  hitchhiker  0.00699955 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2088  phosphatidylglycerophosphatase B  30.95 
 
 		 213 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0563174  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.88 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5027  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.11 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.223489  normal  0.43198 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3032  PAP2 family protein  30.36 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1525  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.28 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2290  PAP2 family protein  37.93 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2748  phosphoesterase, PA-phosphatase-related protein  40.35 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.572696  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  44.86 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1019  DedA/PAP2 family phospholipid acid phosphatase  40.32 
 
 		 502 aa  73.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2504  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.38 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.104215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1246  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.81 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.656269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1164  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.78 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0429  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.38 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.402808  normal  0.651701 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1353  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.48 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2814  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.5 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000029245  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0407  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.37 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0646  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.1 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.8109  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00801  phosphatidylglycerophosphatase B  30.93 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00840146  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0381  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.84 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257956  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.12 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2226  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.33 
 
 		 198 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0393  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.84 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  39.25 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0402  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.84 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0315  membrane-associated phospholipid phosphatase  32.14 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.770739  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  39.25 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1362  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.09 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000155567  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5319  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.89 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2434  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.1 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.535844 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2181  hypothetical protein  33 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0466384  normal  0.124469 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1477  hypothetical protein  31.21 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769795  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1506  hypothetical protein  31.21 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3543  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.11 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3147  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  39.45 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.225101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10313  integral membrane protein  41.49 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1075  phosphoesterase, PA-phosphatase related  24.52 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  46.81 
 
 		 438 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4462  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.34 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0262508  normal  0.313668 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0979  phosphoesterase PA-phosphatase-like protein  29.26 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.626703  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2570  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.82 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.501729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6732  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.16 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.322739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  42.06 
 
 		 439 aa  63.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1011  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.9 
 
 		 215 aa  62  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.43228  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6692  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.42 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2061  phosphoesterase PA-phosphatase related  30 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2146  phosphatidylglycerophosphatase B  36.07 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0608  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.32 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1429  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.09 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.05 
 
 		 676 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1341  PAP2 family protein  36.61 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  34.65 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1402  PAP2 family protein  35.71 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1205  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.52 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4866  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.65 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4688  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.65 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0831  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.9 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.148726  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4399  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.62 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0270  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.31 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3403  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.18 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411638  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>