137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0148 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0148  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  529  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.48 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.06 
 
 
279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0036  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.21 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4761  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.18 
 
 
280 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000159664 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  34.69 
 
 
812 aa  89.7  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1412  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.7 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.98368  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0547  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.89 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0347407  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2515  hypothetical protein  34.5 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00069207  normal  0.734956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4447  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.37 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.626562  hitchhiker  0.00229166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3550  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.18 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1504  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.3 
 
 
174 aa  67  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1131  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.7 
 
 
198 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.24 
 
 
201 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.24 
 
 
201 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.14 
 
 
178 aa  58.9  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  35.04 
 
 
357 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2462  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  37.5 
 
 
199 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0841769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  34.92 
 
 
359 aa  57.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  34.92 
 
 
359 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3620  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.97 
 
 
311 aa  57.4  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000326063 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2497  bacitracin transport permease  40.22 
 
 
199 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202307  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03667  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.78 
 
 
230 aa  56.6  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2011  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  28.57 
 
 
222 aa  56.2  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0468  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.25 
 
 
200 aa  55.8  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3097  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.63 
 
 
222 aa  55.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1103  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.67 
 
 
175 aa  55.5  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1042  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.4 
 
 
282 aa  54.7  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2759  bacitracin transport permease protein bcrc  37.36 
 
 
199 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0828321  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4001  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.18 
 
 
200 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.794332  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0315  membrane-associated phospholipid phosphatase  31.5 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.770739  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1888  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.7 
 
 
192 aa  54.7  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.871384  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2053  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
199 aa  53.9  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.400178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2794  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.78 
 
 
199 aa  53.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.755209  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 
358 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  37.5 
 
 
364 aa  52.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2029  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.56 
 
 
200 aa  52.4  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.85 
 
 
176 aa  52.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.05 
 
 
171 aa  52.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2147  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.77 
 
 
178 aa  52  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.913624  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0399  phosphatase  31.03 
 
 
187 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.556092  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5285  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.37 
 
 
201 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.965621  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  33.02 
 
 
358 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1644  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.37 
 
 
201 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126989  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2785  bacitracin transport permease  37.36 
 
 
199 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0313  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.29 
 
 
305 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512715  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2292  phosphatase, PAP2 family protein  33.72 
 
 
194 aa  50.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000588398  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0878  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.64 
 
 
182 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.749948  hitchhiker  0.002123 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1713  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.04 
 
 
176 aa  50.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.118972  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2185  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.43 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.303622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.82 
 
 
199 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09156  hypothetical protein  28.24 
 
 
187 aa  50.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.63816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2194  PAP2 family phosphatase  31.52 
 
 
183 aa  49.7  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000351549  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  29.73 
 
 
185 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.94 
 
 
241 aa  49.7  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3219  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  44.26 
 
 
230 aa  49.7  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4656  PAP2 family protein  32.67 
 
 
177 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5011  PAP2 family protein  32.67 
 
 
177 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0918  PAP2 family protein  28.14 
 
 
200 aa  49.3  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.791764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4880  PAP2 family protein  32.67 
 
 
177 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1037  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.14 
 
 
200 aa  49.3  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000361007  hitchhiker  0.00000179156 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1322  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.48 
 
 
220 aa  48.9  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4494  phosphatidylglycerophosphatase B  32.67 
 
 
177 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0369  PAP2 family protein  32.67 
 
 
177 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636888  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3318  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.48 
 
 
208 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0711194  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.33 
 
 
169 aa  48.5  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4588  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.68 
 
 
176 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4897  PAP2 family protein  32.67 
 
 
177 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4871  PAP2 family protein  32.67 
 
 
177 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2523  PAP2 family protein  32.56 
 
 
181 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000225597 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4906  PAP2 family protein  32.67 
 
 
177 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4512  phosphatidylglycerophosphatase B  32.67 
 
 
177 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113665  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0465  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.44 
 
 
199 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.451199  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2555  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
271 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.729938  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2672  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.51 
 
 
191 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2329  PAP2 family protein  32.56 
 
 
211 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.401849  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2508  PAP2 family protein  32.56 
 
 
211 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3198  PAP2 family protein  41.1 
 
 
170 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  24.67 
 
 
185 aa  47  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  28.83 
 
 
185 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5970  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  26.99 
 
 
212 aa  46.6  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.76 
 
 
360 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.57 
 
 
205 aa  46.6  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2128  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.43 
 
 
199 aa  46.2  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.167938  normal  0.900368 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1969  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.04 
 
 
253 aa  46.2  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175709  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13960  membrane-associated phospholipid phosphatase  45.76 
 
 
390 aa  45.8  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66242  normal  0.948702 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3046  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.78 
 
 
299 aa  45.8  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.560501  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0568  hypothetical protein  27.71 
 
 
187 aa  45.8  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.237091 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.71 
 
 
176 aa  45.8  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1778  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.43 
 
 
182 aa  45.8  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1672  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.15 
 
 
244 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0479  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.8 
 
 
170 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0994  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.2 
 
 
198 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485972  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3371  membrane-associated phospholipid phosphatase  23.16 
 
 
217 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.067771 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1706  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.36 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0407  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.24 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4360  lipid A 1-phosphatase protein  30.91 
 
 
268 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0835  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.43 
 
 
181 aa  44.3  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.26 
 
 
227 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2504  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.36 
 
 
198 aa  44.3  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>