100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3521 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3521  PAP2 family protein  100 
 
 		 174 aa  356  8e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.702348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3191  phosphoesterase PA-phosphatase related  76.44 
 
 		 174 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.353726  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1441  PAP2 family protein  72.29 
 
 		 175 aa  259  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.24965  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3857  PAP2 family protein  64 
 
 		 175 aa  239  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3568  phosphoesterase PA-phosphatase related  68.39 
 
 		 174 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3636  phosphoesterase PA-phosphatase related  67.82 
 
 		 174 aa  234  7e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00129425  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0674  phosphoesterase PA-phosphatase related  67.82 
 
 		 174 aa  233  7e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3759  phosphoesterase PA-phosphatase related  67.24 
 
 		 174 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.226695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0774  phosphoesterase, PA-phosphatase related  62.86 
 
 		 175 aa  216  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.120064  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0748  phosphoesterase, PA-phosphatase related  62.86 
 
 		 175 aa  216  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0445246 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3190  phosphoesterase, PA-phosphatase related  64.63 
 
 		 175 aa  206  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.276417  hitchhiker  0.000061179 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  52.2 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0174559  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0835  phosphoesterase, PA-phosphatase related  49.31 
 
 		 181 aa  154  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0816  membrane-associated phospholipid phosphatase  44.37 
 
 		 189 aa  136  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247749 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0831  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.37 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1027  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.35 
 
 		 437 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313073  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0961  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1891  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.94 
 
 		 182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.161028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2784  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.79 
 
 		 442 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1765  putative membrane-associated phosphoesterase  34.27 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.569407  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3031  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.84 
 
 		 460 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0770809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3641  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.43 
 
 		 186 aa  107  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.302085  normal  0.062133 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4366  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.85 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0817815  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05882  hypothetical protein  41.67 
 
 		 108 aa  87.8  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0572  PAP2 superfamily protein  39.53 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.194022 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2324  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.41 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.043169  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1899  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.41 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2545  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.71 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2185  phosphoesterase PA-phosphatase related  45.16 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.303622  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1773  PAP2 superfamily protein  39.39 
 
 		 445 aa  68.6  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1969  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175709  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4469  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.94 
 
 		 251 aa  67.8  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1347  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.25 
 
 		 392 aa  67  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.423681  hitchhiker  0.0000000949183 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6735  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  41.57 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.418259 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1340  phosphoesterase PA-phosphatase related  46.25 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.130328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6959  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  39.53 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190723  normal  0.122006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3912  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.96 
 
 		 230 aa  62  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.703578  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1840  PAP2 family protein  38.89 
 
 		 272 aa  60.8  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4017  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.27 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2234  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.69 
 
 		 268 aa  58.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.83 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1178  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.78 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.2963e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1517  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.66 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000561151  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2023  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.77 
 
 		 317 aa  54.7  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204588 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3083  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.13 
 
 		 294 aa  54.3  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  30.4 
 
 		 182 aa  52  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2415  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.22 
 
 		 265 aa  51.2  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0206905  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0216  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.17 
 
 		 218 aa  51.2  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001653  membrane-associated phospholipid phosphatase  31.36 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.66 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0532  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.1 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3550  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.25 
 
 		 278 aa  48.9  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2201  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.14 
 
 		 208 aa  48.5  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.87 
 
 		 194 aa  48.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0313  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.67 
 
 		 305 aa  48.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512715  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5970  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.36 
 
 		 212 aa  47.8  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1340  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.7 
 
 		 204 aa  47.8  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  30.7 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1338  PAP2 family protein  30.83 
 
 		 347 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0607  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.73 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00776566  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3198  PAP2 family protein  33.33 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0465  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.21 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.451199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.48 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3940  phosphoesterase PA-phosphatase related  23.92 
 
 		 271 aa  45.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010362 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1858  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.54 
 
 		 283 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3219  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  44.93 
 
 		 230 aa  45.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3404  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.01 
 
 		 228 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2099  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.54 
 
 		 283 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228285  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1779  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.54 
 
 		 283 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2419  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.45 
 
 		 222 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.623876  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2063  hypothetical protein  34.07 
 
 		 178 aa  44.7  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  29.82 
 
 		 185 aa  44.7  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.31 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.31 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2794  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.29 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.755209  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.71 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3793  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  36.78 
 
 		 1261 aa  43.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2985  PAP2 superfamily protein  45.16 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.64 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0435  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.71 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.3398  hitchhiker  0.00199052 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.36 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.11 
 
 		 185 aa  42.4  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0409  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.47 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.21 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0785734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1565  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.91 
 
 		 225 aa  42.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0399  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.36 
 
 		 245 aa  42.4  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149101  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.28 
 
 		 207 aa  42  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0510  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.9 
 
 		 170 aa  42  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2504  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.18 
 
 		 331 aa  42  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.104215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1412  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.41 
 
 		 263 aa  42  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.98368  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3721  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.29 
 
 		 170 aa  42  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.701868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2515  hypothetical protein  40.98 
 
 		 296 aa  42  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00069207  normal  0.734956 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1669  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.96 
 
 		 202 aa  41.6  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000273408  normal  0.218841 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.13 
 
 		 272 aa  41.2  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3318  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.63 
 
 		 208 aa  41.2  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0711194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.1 
 
 		 172 aa  41.2  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.95 
 
 		 199 aa  41.2  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2178  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.91 
 
 		 166 aa  40.8  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2782  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.06 
 
 		 294 aa  40.8  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1015  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.22 
 
 		 265 aa  40.8  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>