More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1280 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  100 
 
 
185 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  96.76 
 
 
185 aa  358  4e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3348  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.09 
 
 
186 aa  137  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.31592  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02460  PAP2 superfamily protein  43.87 
 
 
188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.457854  normal  0.122911 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1598  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.07 
 
 
180 aa  117  7e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.970961  hitchhiker  0.00000195096 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1888  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  41.67 
 
 
192 aa  107  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.871384  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2674  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  44.9 
 
 
184 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.64 
 
 
185 aa  107  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15070  PAP2 superfamily protein  35.2 
 
 
198 aa  91.7  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.872818 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0463  Undecaprenyl-diphosphatase  36.18 
 
 
219 aa  90.1  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.282936  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.41 
 
 
174 aa  89  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2672  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  40.49 
 
 
191 aa  89  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3387  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.71 
 
 
168 aa  87.8  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000111833  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0425  undecaprenyl-diphosphatase  32.12 
 
 
203 aa  87  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2317  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.18 
 
 
187 aa  84.7  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.06 
 
 
176 aa  84.7  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.69 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.89 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3600  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.3 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  31.91 
 
 
438 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.09 
 
 
438 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2011  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.38 
 
 
222 aa  78.2  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.53 
 
 
201 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.53 
 
 
201 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2128  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.81 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.167938  normal  0.900368 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  32.56 
 
 
437 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.12 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  32.56 
 
 
437 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4138  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.33 
 
 
499 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2029  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.71 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.91 
 
 
205 aa  72  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.62 
 
 
438 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  32.97 
 
 
439 aa  69.7  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2178  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.26 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0501  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.84 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2560  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.27 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.48 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.38 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1919  membrane-associated phospholipid phosphatase  27.84 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.462306 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.71 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1410  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.81 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.163391 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2554  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.73 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163921  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2366  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0167377 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1504  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.12 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3916  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.49 
 
 
498 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4001  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.93 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.794332  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1657  PAP2 superfamily protein  32.59 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000234418  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0756  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.77 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0373  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.38 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1131  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.81 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.2 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.01 
 
 
178 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4866  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.81 
 
 
438 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374239  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.04 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2234  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.34 
 
 
268 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0465  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.96 
 
 
199 aa  63.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.451199  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0313  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.97 
 
 
305 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512715  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.01 
 
 
178 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0878  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.35 
 
 
182 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.749948  hitchhiker  0.002123 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1555  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.27 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.31 
 
 
169 aa  63.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1791  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.49 
 
 
225 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.824897  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0568  hypothetical protein  30 
 
 
187 aa  62.4  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.237091 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001653  membrane-associated phospholipid phosphatase  40.66 
 
 
182 aa  62.8  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.08 
 
 
179 aa  62.8  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1039  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.92 
 
 
183 aa  62.4  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1778  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.19 
 
 
182 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  38.46 
 
 
182 aa  62.4  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  33.88 
 
 
438 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4688  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.27 
 
 
438 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1456  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  24.38 
 
 
192 aa  62  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2023  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.23 
 
 
317 aa  62  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204588 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3059  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.48 
 
 
533 aa  61.2  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3198  PAP2 family protein  38.89 
 
 
170 aa  61.6  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0608  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.26 
 
 
438 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.63 
 
 
272 aa  60.5  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22000  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  30.28 
 
 
480 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00559373  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3219  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.4 
 
 
230 aa  59.7  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1347  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.11 
 
 
392 aa  59.7  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.423681  hitchhiker  0.0000000949183 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1775  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.46 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2181  PAP2 family protein  29.95 
 
 
346 aa  59.3  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2759  bacitracin transport permease protein bcrc  30.57 
 
 
199 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0828321  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2382  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.93 
 
 
221 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000279179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2785  bacitracin transport permease  29.3 
 
 
199 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0409  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.78 
 
 
170 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2985  PAP2 superfamily protein  35.29 
 
 
175 aa  58.9  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2733  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.31 
 
 
172 aa  58.9  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1015  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.51 
 
 
265 aa  58.9  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1517  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.22 
 
 
281 aa  58.9  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000561151  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2063  hypothetical protein  38.82 
 
 
178 aa  58.9  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.78 
 
 
170 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0785734  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3318  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.75 
 
 
208 aa  58.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0711194  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2304  hypothetical protein  39.74 
 
 
195 aa  58.5  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2782  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.61 
 
 
294 aa  58.2  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.235755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5970  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.29 
 
 
212 aa  58.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1178  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.78 
 
 
294 aa  57.8  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.2963e-23 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0422  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.22 
 
 
192 aa  57.8  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1816  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.53 
 
 
181 aa  57.8  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28361  hypothetical protein  27.03 
 
 
245 aa  57.8  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>